DOI: https://doi.org/10.1590/0074-02760250114
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41810679
تاريخ النشر: 2026-01-01
المؤلف: Zhenyun Du
الموضوع الرئيسي: الطفيليات وتفاعلاتها مع المضيف
نظرة عامة
يوفر هذا القسم نظرة عامة على البيانات التكميلية المتعلقة بتحليلات التعبير التفاضلي للـ RNA غير المشفر الطويل (lncRNAs) باستخدام طريقة DESeq2، كما هو موضح في الأشكال 1 و 2. بالإضافة إلى ذلك، يناقش الشبكات الفرعية للتعبير المشترك المستمدة من تحليل الشبكة الجينية المعبر عنها بشكل وزني (WGCNA)، مع تسليط الضوء على lncRNAs الرئيسية المعروضة في الأشكال 3 و 4 و 5. يتم تلخيص التفاصيل الشاملة المتعلقة بمكتبات RNA-seq المستخدمة في التحليلات، جنبًا إلى جنب مع معلومات حول lncRNAs التي تم التعرف عليها حديثًا، في الجداول I و II. الجدول I يسرد بشكل خاص رموز مكتبات RNA-seq والعينات المقابلة المرتبطة بمشروع BioProject PRJEB32839.
DOI: https://doi.org/10.1590/0074-02760250114
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41810679
Publication Date: 2026-01-01
Author(s): Zhenyun Du
Primary Topic: Parasites and Host Interactions
Overview
The section provides an overview of supplementary data related to the differential expression analyses of long non-coding RNAs (lncRNAs) using the DESeq2 method, as illustrated in Figures 1 and 2. Additionally, it discusses co-expression sub-networks derived from weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), highlighting hub lncRNAs presented in Figures 3, 4, and 5. Comprehensive details regarding the RNA-seq libraries utilized in the analyses, along with information on newly identified lncRNAs, are summarized in Tables I and II. Table I specifically lists the RNA-seq library codes and the corresponding samples associated with BioProject PRJEB32839.