الكشف الفلوري النسبي للبيوروفوسفات باستخدام أنابيب الكربون النانوية أحادية الجدار المفعلة بـ sp³
Ratiometric fluorescent sensing of pyrophosphate with sp³-functionalized single-walled carbon nanotubes

المجلة: Nature Communications، المجلد: 15، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-45052-1
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38267487
تاريخ النشر: 2024-01-24
المؤلف: Simon Settele وآخرون
الموضوع الرئيسي: الكيمياء التحليلية وأجهزة الاستشعار

نظرة عامة

في هذا القسم، يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا للكشف عن البيروفوسفات غير العضوي باستخدام أنابيب الكربون النانوية أحادية الجدار (SWNTs) المفعلة بـ sp³ والتي تظهر انبعاث عيب متغير اللون. يعتمد آلية الكشف على تثبيت أيونات Cu²⁺ على سطح SWNT من خلال التنسيق مع مجموعات الأريل الألكاين المرفقة تساهميًا ومعقد الترايازول. يؤدي وجود أيونات Cu²⁺ إلى إخماد الفلورية عبر نقل الإلكترون المحفز بالضوء، والذي يمكن عكسه بإضافة مواد تحليل معقدة للنحاس مثل البيروفوسفات. وهذا يمكّن القياسات النسبية عبر نطاق تركيز واسع، مما يسهل الكشف عن البيروفوسفات في مستخلص الخلايا ومراقبة تخليق الحمض النووي أثناء تفاعلات سلسلة البوليميراز.

يبرز المؤلفون مزايا استخدام SWNTs كمستشعرات حيوية، لا سيما في نافذة الأشعة تحت الحمراء القريبة (NIR-II) (1000-1700 نانومتر)، بسبب حساسيتها للتغيرات البيئية، وثباتها الضوئي العالي، وقابليتها للتوافق الحيوي. على الرغم من التحديات مثل انخفاض عائد الفلورية الكمية (PLQY) في المشتتات المائية، أظهرت التطورات الأخيرة في استخدام SWNTs أحادية الجزيء المصنفة ودمج العيوب اللمعية sp³ وعدًا في تعزيز خصائص الفلورية وزيادة PLQY. يؤدي إدخال هذه العيوب sp³، المعروفة أيضًا باسم العيوب الكمية، إلى ظهور نطاقات انبعاث جديدة تحسن الأداء العام لمستشعرات SWNTs القائمة.

طرق

في هذا القسم، يوضح المؤلفون المواد وطرق التوصيف المستخدمة في أبحاثهم. تم الحصول على مجموعة متنوعة من المواد الكيميائية من Sigma-Aldrich وTCI وAlfa Aesar، بما في ذلك كبريتات النيكل (II) سداسية الماء، وكبريتات الكوبالت (II) سباعية الماء، وثلاثي فوسفات الأدينوزين ثنائي الصوديوم (ATP)، وبولي (إيثيلين جلايكول) (PEG). تم الإشارة إلى مستويات النقاء المحددة والأوزان الجزيئية لهذه المركبات، مما يدل على التركيز على المواد عالية الجودة لضمان سلامة التجارب.

تشمل طرق التوصيف المستخدمة مطيافية الامتصاص والفلورية (PL)، مع أخذ القياسات باستخدام مطياف Cary 6000i UV-VIS-NIR ومصادر ليزر مختلفة، بما في ذلك ليزر فائق الاستمرارية pulsed ps ومصباح قوس Xe بقوة 450 واط. تم تحليل أوقات حياة حالات العيوب اللمعية في أنابيب الكربون النانوية أحادية الجدار (SWNTs) المفعلة باستخدام نظام عدّ الفوتونات المفردة المرتبط بالزمن. بالإضافة إلى ذلك، تم إجراء مطيافية رامان باستخدام مجهر رينشاو inVia Reflex، حيث تم جمع أكثر من 1000 طيف من المشتتات SWNT وتم متوسطها للدقة. توفر هذه الطرق معًا إطارًا قويًا لتحليل الخصائص البصرية والخصائص الهيكلية للمواد المدروسة.

النتائج

يقدم قسم “النتائج” في ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. عادةً ما يتضمن بيانات كمية، وتحليلات إحصائية، وتمثيلات بصرية مثل الرسوم البيانية أو الجداول لتوضيح النتائج. من المحتمل أن تتم مناقشة النتائج فيما يتعلق بالفرضيات أو أسئلة البحث المطروحة سابقًا في الدراسة، مع تسليط الضوء على الأنماط أو الارتباطات أو الاختلافات الملحوظة في البيانات.

علاوة على ذلك، قد يتناول القسم مقاييس أو معايير محددة تم قياسها، مع القيم المقابلة لها، لتوفير فهم واضح للنتائج التجريبية. كما يتم تناول أي اتجاهات أو شذوذ ملحوظة، مما يوفر رؤى حول تداعيات النتائج ضمن السياق الأوسع لمجال البحث. بشكل عام، يخدم هذا القسم لنقل الأدلة التجريبية التي تدعم استنتاجات الدراسة.

المناقشة

في هذا القسم، يناقش المؤلفون تطوير وتوصيف أنابيب الكربون النانوية أحادية الجدار (SWNTs) المفعلة بـ sp³ كمجسات فلورية للكشف عن البيروفوسفات (PPi). تم تفعيل SWNTs (6,5) باستخدام كيمياء الديازونيوم، مما أدى إلى ظهور ميزة انبعاث الفلورية (PL) المتغيرة اللون المنسوبة إلى عيوب sp³. أدى إضافة معقد النحاس (II) إلى إخماد كبير في شدة PL وتسبب في مزيد من الانزياحات الحمراء في قمم الانبعاث، مما يشير إلى تفاعل قوي بين أيونات Cu²⁺ وSWNTs المفعلة. وُجد أن الإخماد كان قابلاً للعكس عند إضافة PPi، مما يشير إلى أن SWNTs يمكن أن تعمل كمستشعرات فعالة لـ PPi في السياقات البيولوجية.

تم تحقيق الكشف الكمي عن PPi من خلال قياسات PL، مما كشف عن منحنى معايرة يظهر استجابة خطية عبر نطاق تركيز واسع (12 ميكرومتر إلى 10.94 مللي مول). أشار المؤلفون إلى أن نسبة شدة E₁₁*/E₁₁ كانت مقياسًا أكثر موثوقية للكشف مقارنة بالشدة المطلقة، حيث ظلت مستقرة حتى عند تركيزات عالية من المواد التحليلية. تم تقييم انتقائية مجسات SWNT ضد مجموعة متنوعة من المواد المتداخلة المحتملة، مع ملاحظات استجابة كبيرة بشكل أساسي لوكلاء معقدين للنحاس، بما في ذلك PPi. تختتم الدراسة بالقول إنه على الرغم من أن SWNTs تظهر بعض الانتقائية، إلا أن تحسين أنظمة التفعيل والروابط ضروري لتعزيز خصوصيتها للكشف عن PPi في البيئات البيولوجية المعقدة.

Journal: Nature Communications, Volume: 15, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-024-45052-1
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38267487
Publication Date: 2024-01-24
Author(s): Simon Settele et al.
Primary Topic: Analytical Chemistry and Sensors

Overview

In this section, the authors present a novel approach for detecting inorganic pyrophosphate using sp³-functionalized (6,5) single-walled carbon nanotubes (SWNTs) that exhibit red-shifted defect emission. The detection mechanism relies on the immobilization of Cu²⁺ ions on the SWNT surface through coordination with covalently attached aryl alkyne groups and a triazole complex. The presence of Cu²⁺ ions induces fluorescence quenching via photoinduced electron transfer, which can be reversed by the addition of copper-complexing analytes like pyrophosphate. This enables ratiometric measurements across a broad concentration range, facilitating the detection of pyrophosphate in cell lysate and monitoring DNA synthesis during polymerase chain reactions.

The authors highlight the advantages of using SWNTs as biosensors, particularly in the near-infrared (NIR-II) window (1000-1700 nm), due to their sensitivity to environmental changes, high photostability, and biocompatibility. Despite challenges such as low photoluminescence quantum yield (PLQY) in aqueous dispersions, recent advancements in utilizing sorted monochiral SWNTs and integrating luminescent sp³ defects have shown promise in enhancing fluorescence properties and increasing PLQY. The introduction of these sp³ defects, also referred to as quantum defects, results in new emission bands that improve the overall performance of SWNT-based biosensors.

Methods

In this section, the authors detail the materials and characterization methods employed in their research. A variety of reagents were sourced from Sigma-Aldrich, TCI, and Alfa Aesar, including nickel(II) sulfate hexahydrate, cobalt(II) sulfate heptahydrate, adenosine triphosphate disodium hydrate (ATP), and poly(ethylene glycol) (PEG). The specific purity levels and molecular weights of these compounds are noted, indicating a focus on high-quality materials for experimental integrity.

The characterization methods utilized include absorption and photoluminescence (PL) spectroscopy, with measurements taken using a Cary 6000i UV-VIS-NIR spectrophotometer and various laser sources, including a ps-pulsed supercontinuum laser and a 450 W Xe arc lamp. PL lifetimes of luminescent defect states in functionalized (6,5) single-walled carbon nanotubes (SWNTs) were analyzed using a time-correlated single photon counting scheme. Additionally, Raman spectroscopy was performed with a Renishaw inVia Reflex confocal microscope, where over 1000 spectra were collected from SWNT dispersions and averaged for accuracy. These methods collectively provide a robust framework for analyzing the optical properties and structural characteristics of the materials studied.

Results

The “Results” section of the research paper presents key findings derived from the conducted experiments or analyses. It typically includes quantitative data, statistical analyses, and visual representations such as graphs or tables to illustrate the outcomes. The results are likely discussed in relation to the hypotheses or research questions posed earlier in the study, highlighting significant patterns, correlations, or differences observed in the data.

Moreover, the section may detail specific metrics or parameters that were measured, along with their corresponding values, to provide a clear understanding of the experimental outcomes. Any notable trends or anomalies are also addressed, offering insights into the implications of the findings within the broader context of the research field. Overall, this section serves to convey the empirical evidence supporting the study’s conclusions.

Discussion

In this section, the authors discuss the development and characterization of sp³-functionalized single-walled carbon nanotubes (SWNTs) as fluorescent probes for the detection of pyrophosphate (PPi). The (6,5) SWNTs were functionalized using diazonium chemistry, resulting in a red-shifted photoluminescence (PL) emission feature attributed to sp³ defects. The addition of a copper(II) complex significantly quenched the PL intensity and caused further red-shifts in the emission peaks, indicating a strong interaction between the Cu²⁺ ions and the functionalized SWNTs. The quenching was found to be reversible upon the addition of PPi, which suggests that the SWNTs can serve as effective sensors for PPi in biological contexts.

Quantitative detection of PPi was achieved through PL measurements, revealing a calibration curve that demonstrated a linear response over a wide concentration range (12 µM to 10.94 mM). The authors noted that the E₁₁*/E₁₁ intensity ratio was a more reliable metric for detection than absolute intensities, as it remained stable even at high analyte concentrations. The selectivity of the SWNT probes was evaluated against various potential interferents, with significant responses observed primarily for strong copper-complexing agents, including PPi. The study concludes that while the SWNTs exhibit some selectivity, further optimization of the functionalization and ligand systems is necessary to enhance their specificity for PPi detection in complex biological environments.