DOI: https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2025.59588
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41697700
تاريخ النشر: 2026-02-16
المؤلف: Raphaëlle Klitting وآخرون
الموضوع الرئيسي: الأمراض المنقولة بواسطة البعوض ومكافحتها
نظرة عامة
تبحث ورقة البحث في الديناميات المكانية والزمنية لدورة فيروس غرب النيل (WNV) في فرنسا من 2022 إلى 2025، مع التركيز بشكل خاص على ظهور سلالة WNV 2 (WNV-L2) في منطقة باريس الحضرية في يوليو 2025. تستخدم الدراسة علم الأوبئة الجينومية، مع دمج بيانات بشرية وحيوانية وحشرية، إلى جانب تسلسل الجينوم الفيروسي وتحليل النشوء والتطور البايزي، لتتبع أصول وأنماط انتشار الفيروس. شملت جهود المراقبة مراقبة الإصابات البشرية المؤكدة، وحالات الطيور والخيول، وسكان البعوض عبر المناطق المعروفة بنشاط WNV.
تظهر النتائج أن WNV-L2 كانت السلالة الوحيدة المكتشفة خلال فترة الدراسة، مع بيانات جينومية مستمدة من 52 عينة إيجابية لـ WNV. ومن الجدير بالذكر أن التحليل أشار إلى علاقة جينية وثيقة بين سلالات البحر الأبيض المتوسط الغربي وتلك القادمة من المحيط الأطلسي الجنوبي، مما يشير إلى إدخال الفيروس من الغرب إلى الجنوب. كانت سلالات التفشي التي تم تحديدها في باريس في 2025 مرتبطة بالسلالة الأطلسية الجنوبية من السنوات السابقة. تسلط هذه النتائج الضوء على الدور المزدوج لصيانة الفيروس محليًا وانتشاره لمسافات طويلة في ديناميات دورة WNV في فرنسا، مما يبرز ضرورة تعزيز المراقبة الجينومية لتوقع التفشيات المستقبلية بشكل أفضل.
مقدمة
تناقش مقدمة ورقة البحث فيروس غرب النيل (WNV)، وهو فيروس أورثوفلافivirus يتم نقله بشكل أساسي بواسطة بعوض Culex، حيث تعمل الطيور كعائلات مضيفة. تم عزل WNV لأول مرة في أوغندا في عام 1937، وأصبح الآن أكثر الفيروسات الناقلة للأمراض انتشارًا على مستوى العالم، مما تسبب في تفشيات في مناطق مختلفة، بما في ذلك أفريقيا وأوروبا والأمريكتين. في فرنسا الحضرية، كانت دورة WNV تاريخيًا محدودة في منطقة كامارغ حتى ظهور سلالة WNV 2 (WNV-L2) في عام 2018، والتي وسعت نطاقها الجغرافي منذ ذلك الحين، مما أدى إلى اكتشافها في كل من المناطق الشرقية والغربية للبحر الأبيض المتوسط وكذلك المحيط الأطلسي الجنوبي.
تسلط المقدمة الضوء على تحول كبير في نشاط WNV في فرنسا، خاصة مع اكتشاف WNV-L2 في البشر وعائلات أخرى في منطقة باريس لأول مرة في عام 2025. يمثل هذا توسعًا ملحوظًا يتجاوز المناطق المتأثرة سابقًا، مع وجود انتقال محلي مؤكد يتضح من حالات الإصابة العصبية وإيجابية فضلات البعوض. يؤكد المؤلفون على الحاجة إلى بيانات جينومية شاملة لفهم ديناميات الفيروس وطرق دورانه داخل فرنسا وارتباطاته بشبكات النقل الأوروبية الأوسع. تهدف الدراسة إلى استخدام تسلسل الجينوم جنبًا إلى جنب مع بيانات المراقبة الوطنية من 2022 إلى 2025 لتوضيح الديناميات المكانية والزمنية لـ WNV في فرنسا وتتبع أصول السلالة الناشئة حديثًا في منطقة باريس.
طرق البحث
في هذه الدراسة، تم الحصول على عينات بشرية من برنامج المراقبة الصحية العامة الوطني الذي تديره المركز الوطني المرجعي (NRC) للفيروسات الناقلة للأمراض، تحت إشراف الصحة العامة في فرنسا. نظرًا لأن هذه العينات كانت جزءًا من المراقبة الوبائية الروتينية، لم يكن من الضروري الحصول على موافقة أخلاقية من لجنة. كانت العينات، التي تشمل بلازما وسيروم بشري، تُستقبل بشكل روتيني لأغراض التشخيص القياسية، وكانت مصحوبة بنماذج تشير إلى موافقة المريض من خلال بند عدم المعارضة. من المهم أن نلاحظ أنه لم يتم جمع أي عينات سريرية إضافية خصيصًا لهذا البحث.
تم إخفاء هوية جميع العينات البشرية والثقافات الفيروسية المستمدة لضمان الامتثال للائحة العامة لحماية البيانات الأوروبية والمعايير التي وضعتها اللجنة الوطنية الفرنسية للمعلومات والحرية، مما يقلل من أي مخاطر محتملة على المرضى المعنيين. يبرز هذا النهج المنهجي التزام الدراسة بالمعايير الأخلاقية أثناء استخدام البيانات الوبائية الموجودة لأغراض البحث.
النتائج
في هذه الدراسة، تم تحليل ما مجموعه 52 عينة، تتكون من 6 عينات بشرية، 2 خيول، 19 طيور، و25 عينات حشرية. تم الحصول على التسلسلات من مناطق مختلفة، بما في ذلك البحر الأبيض المتوسط الشرقي (8 تسلسلات)، البحر الأبيض المتوسط الغربي (11)، المحيط الأطلسي الجنوبي (23)، وباريس (10)، جميعها تنتمي إلى سلالة WNV-L2. أظهر التحليل النشوء والتطور أن سلالات WNV من البحر الأبيض المتوسط الشرقي تختلف عن تلك التي تم اكتشافها في السنوات السابقة (2018، 2022، و2023) وتتشكل بشكل منفصل عن سلالات المحيط الأطلسي الجنوبي، مما يشير إلى انتشار كبير لـ WNV-L2 عبر فرنسا الحضرية.
تم استخدام الاستدلال البايزي لبناء شجرة نشوء وتطور زمنية، مع دمج تسلسلات الدراسة مع 218 جينومًا عامًا من قاعدة بيانات PathoPlexus. قدرت التحليلات أن مجموعة البحر الأبيض المتوسط الشرقي ظهرت حوالي أكتوبر 2023، بينما تعود مجموعة التسلسلات من 2018 إلى 2023 إلى نوفمبر 2016. بالإضافة إلى ذلك، شكلت التسلسلات من منطقة البحر الأبيض المتوسط الغربي مجموعة فريدة، ظهرت حوالي مارس 2023، متداخلة ضمن مجموعة أكبر من المحيط الأطلسي الجنوبي التي تعود إلى حوالي أكتوبر 2020. شكلت تسلسلات منطقة باريس، التي تم تحليلها في 2025، مجموعة ضمن مجموعة المحيط الأطلسي الجنوبي، ومن المحتمل أنها ظهرت قبل نهاية 2024. تسلط هذه النتائج الضوء على التطور الديناميكي والانتشار الجغرافي لـ WNV-L2 في فرنسا.
المناقشة
في عام 2024، زادت دورة فيروس غرب النيل (WNV) عبر أوروبا، حيث أبلغت 19 دولة عن 1,436 حالة بشرية محلية مكتسبة، بما في ذلك تفشيات كبيرة في ألبانيا وبولندا. في فرنسا، تم اكتشاف سلالة WNV 2 (WNV-L2) في ثلاث مناطق، مما يمثل تحولًا من السلالة السائدة تاريخيًا WNV 1 (WNV-L1). يشير هذا التحول إلى اتجاه أوسع لتوسع WNV-L2 نحو الغرب والشمال، كما يتضح من تزايد انتشاره في المناطق الحضرية واستبداله التدريجي لـ WNV-L1 في إيطاليا. تشمل العوامل المساهمة في هذا الاتجاه تعزيز اللياقة الفيروسية، والظروف المناخية، والتغيرات في استخدام الأراضي وأنماط هجرة الطيور، والتي تؤثر مجتمعة على ديناميات WNV.
تسلط الدراسة الضوء على التنوع الجيني لـ WNV في منطقة المحيط الأطلسي الجنوبي في فرنسا، مما يشير إلى أنه قد يكون مصدرًا لظهور الفيروس في المستقبل. من الجدير بالذكر أن المنطقة شهدت حريقًا كبيرًا في عام 2022، مما قد يكون قد أثر على النظم البيئية المحلية وغير ديناميات الانتقال. يدعو المؤلفون إلى تعزيز علم الأوبئة الجزيئية لمراقبة التطور الجيني لـ WNV وتوزيعه الجغرافي، مؤكدين على الحاجة إلى مراقبة مبكرة في الموسم وتسلسل روتيني للعينات الإيجابية. يهدف هذا النهج إلى تحسين فهم انتقال WNV ودعم الاستجابات المنسقة للزوالات الناشئة، مما يعزز الاستعداد الوطني في مواجهة نشاط WNV المتزايد عبر أوروبا.
القيود
تعترف الدراسة بعدة قيود تؤثر على فهم ديناميات فيروس غرب النيل (WNV). يبرز الظهور غير المتوقع لـ WNV في باريس الفجوات الكبيرة في المعرفة بشأن العوامل البيئية والوبائية التي تسهم في استمرار الفيروس وانتشاره. تشمل المجالات الرئيسية للشكوك أدوار الطيور المقيمة والمهاجرة، وحركة الناقلات، والتقلبات المناخية. تشير تقديرات النشوء والتطور إلى أن WNV قد يكون قد انتشر دون اكتشاف في منطقة المحيط الأطلسي الجنوبي لعدة سنوات قبل تحديد الحالات البشرية، مما يبرز الحاجة إلى تحسين المراقبة.
للتنبؤ بشكل فعال بالتوسعات الجغرافية المستقبلية لـ WNV وتكييف استراتيجيات الصحة العامة، من الضروري معالجة هذه الشكوك. من الضعف الملحوظ الذي تم تحديده في الدراسة هو نقص المراقبة الشاملة لسكّان الطيور البرية لـ WNV، وهو أمر ضروري لفهم بيئة الفيروس وإبلاغ التدخلات الفعالة في الصحة العامة.
DOI: https://doi.org/10.1001/jamanetworkopen.2025.59588
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41697700
Publication Date: 2026-02-16
Author(s): Raphaëlle Klitting et al.
Primary Topic: Mosquito-borne diseases and control
Overview
The research paper investigates the spatial and temporal dynamics of West Nile virus (WNV) circulation in France from 2022 to 2025, particularly focusing on the emergence of WNV lineage 2 (WNV-L2) in the Paris metropolitan area in July 2025. The study employs genomic epidemiology, integrating human, veterinary, and entomological data, alongside viral genome sequencing and Bayesian phylogenetic analysis, to trace the origins and dispersal patterns of the virus. Surveillance efforts included monitoring confirmed human infections, avian and equine cases, and mosquito populations across regions with known WNV activity.
The findings reveal that WNV-L2 was the sole lineage detected during the study period, with genomic data derived from 52 WNV-positive samples. Notably, the analysis indicated a close genetic relationship between Western Mediterranean strains and those from the South Atlantic, suggesting a west-to-south introduction of the virus. The outbreak strains identified in Paris in 2025 were linked to the South Atlantic lineage from the preceding years. These results highlight the dual role of local virus maintenance and long-distance dispersal in the dynamics of WNV circulation in France, emphasizing the necessity for enhanced genomic surveillance to better anticipate future outbreaks.
Introduction
The introduction of the research paper discusses the West Nile virus (WNV), an orthoflavivirus primarily transmitted by Culex mosquitoes, with birds serving as amplifying hosts. Initially isolated in Uganda in 1937, WNV has become the most widespread arbovirus globally, causing outbreaks in various regions, including Africa, Europe, and the Americas. In metropolitan France, WNV circulation was historically limited to the Camargue wetland until the emergence of WNV lineage 2 (WNV-L2) in 2018, which has since expanded its geographic range, leading to detections in both Eastern and Western Mediterranean areas as well as the South Atlantic.
The introduction highlights a significant shift in WNV activity in France, particularly with the detection of WNV-L2 in humans and other hosts in the Paris area for the first time in 2025. This marks a notable expansion beyond previously affected regions, with confirmed local transmission evidenced by neuroinvasive cases and positive mosquito excreta. The authors emphasize the need for comprehensive genomic data to better understand the viral dynamics and circulation routes of WNV within France and its connections to broader European transmission networks. The study aims to utilize genomic sequencing alongside nationwide surveillance data from 2022 to 2025 to elucidate the spatiotemporal dynamics of WNV in France and trace the origins of the recently emerging lineage in the Paris area.
Methods
In this study, human samples were sourced from the national public health surveillance program managed by the National Reference Centre (NRC) for Arboviruses, under the oversight of Santé publique France. As these samples were part of routine epidemiological surveillance, ethical approval from a committee was not necessary. The samples, which included human plasma and serum, were routinely received for standard diagnostic purposes and were accompanied by forms indicating patient consent through a nonopposition clause. Importantly, no additional clinical specimens were collected specifically for this research.
All human samples and the derived viral cultures were anonymized to ensure compliance with the European General Data Protection Regulation and the standards set by the French National Commission on Informatics and Liberties, thereby minimizing any potential risk to the patients involved. This methodological approach underscores the study’s commitment to ethical standards while utilizing existing epidemiological data for research purposes.
Results
In this study, a total of 52 samples were analyzed, comprising 6 human, 2 equine, 19 avian, and 25 entomological specimens. The sequences were sourced from various regions, including the Eastern Mediterranean (8 sequences), Western Mediterranean (11), South Atlantic (23), and Paris (10), all belonging to the WNV-L2 lineage. Phylogenetic analysis revealed that WNV strains from the Eastern Mediterranean are distinct from those detected in previous years (2018, 2022, and 2023) and cluster separately from the South Atlantic strains, indicating a significant spread of WNV-L2 across Metropolitan France.
Bayesian inference was employed to construct a time-resolved phylogeny, integrating the study’s sequences with 218 public genomes from the PathoPlexus database. The analysis estimated that the Eastern Mediterranean clade emerged around October 2023, while the clade encompassing sequences from 2018 to 2023 dates back to November 2016. Additionally, sequences from the Western Mediterranean area formed a unique cluster, emerging around March 2023, nested within a larger South Atlantic clade that dates back to approximately October 2020. The Paris area sequences, analyzed in 2025, formed a cluster within the South Atlantic clade, likely emerging before the end of 2024. These findings highlight the dynamic evolution and geographic spread of WNV-L2 in France.
Discussion
In 2024, the circulation of West Nile Virus (WNV) intensified across Europe, with 19 countries reporting 1,436 locally acquired human cases, including significant outbreaks in Albania and Poland. In France, WNV lineage 2 (WNV-L2) was detected in three regions, marking a shift from the historically prevalent WNV lineage 1 (WNV-L1). This shift indicates a broader trend of WNV-L2’s westward and northward expansion, as evidenced by its increasing prevalence in urban areas and its gradual supplanting of WNV-L1 in Italy. Factors contributing to this trend include enhanced viral fitness, climatic conditions, and changes in land use and bird migration patterns, which collectively influence WNV dynamics.
The study highlights the genetic diversity of WNV in the South Atlantic region of France, suggesting it may serve as a source for future viral emergence. Notably, the region experienced a significant wildfire in 2022, which may have disrupted local ecosystems and altered transmission dynamics. The authors advocate for enhanced molecular epidemiology to monitor WNV’s genetic evolution and geographic distribution, emphasizing the need for early-season surveillance and routine sequencing of positive samples. This approach aims to improve the understanding of WNV transmission and support coordinated responses to emerging zoonoses, thereby strengthening national preparedness in the face of expanding WNV activity across Europe.
Limitations
The study acknowledges several limitations that impact the understanding of West Nile Virus (WNV) dynamics. The unexpected emergence of WNV in Paris underscores significant gaps in knowledge regarding the ecological and epidemiological factors that contribute to the virus’s persistence and dissemination. Key areas of uncertainty include the roles of resident and migratory birds, vector movement, and climatic variability. Phylogenetic dating indicates that WNV may have circulated undetected in the South Atlantic region for several years prior to the identification of human cases, highlighting the need for improved surveillance.
To effectively anticipate future geographic expansions of WNV and adapt public health strategies, it is crucial to address these uncertainties. A notable weakness identified in the study is the lack of comprehensive surveillance of wild bird populations for WNV, which is essential for understanding the virus’s ecology and informing effective public health interventions.