تحليل الميتابولوم غير المستهدف للسوائل الخلوية الحرة (CFSs) من عزلات سريرية مختلفة من سكروميسيس سيريفيسيا وتأثيراتها على ضراوة كانديدا ألبيكانس Untargeted Metabolomic Analysis of Cell-Free Supernatants (CFSs) from Different Clinical Isolates of Saccharomyces cerevisiae and Their Effects on Candida albicans Virulence

شارك:
المجلة: Journal of Fungi، المجلد: 12، العدد: 2
DOI: https://doi.org/10.3390/jof12020081
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41745224
تاريخ النشر: 2026-01-23
المؤلف: Luca Spaggiari وآخرون
الموضوع الرئيسي: مقاومة الفطريات وقابلية الإصابة

نظرة عامة

تدرس الدراسة الخصائص البروبيوتيك لـ *Saccharomyces cerevisiae* في مكافحة العدوى التي تسببها العامل الممرض الانتهازي *Candida albicans*. قام الباحثون بتحليل المستخلصات الخلوية (CFSs) من ثلاثة عزلات برازية وسلالة واحدة من ATCC لـ *S. cerevisiae* لتقييم آثارها على نمو *C. albicans* وعوامل الضراوة. كشفت النتائج أنه بينما كانت CFSs تثبط نمو *C. albicans* بشكل معتدل، إلا أنها أضعفت الضراوة بشكل كبير من خلال تقليل الالتصاق، وتكوين الأغشية الحيوية، والنشاط الأيضي لخلايا الفطريات، كما يتضح من وحدات تشكيل المستعمرات (CFUs)، وصبغة الكريستال البنفسجي، واختبارات XTT.

بالإضافة إلى ذلك، سلط تحليل الميتابولوم غير المستهدف للمستخلصات الخلوية الضوء على وجود عدة مستقلبات، بما في ذلك N-acetyl-DL-tryptophan، وحمض الكينورينيك، وحمض الإندول-3-أكريليك، وبعض الثنائي الببتيدات، التي كانت أكثر وفرة في العزلات البرازية مقارنة بالسلالة المرجعية. تشير هذه النتائج إلى أن CFSs من *S. cerevisiae* قد تعمل كملحق بوستبيوتيك محتمل للعلاجات المضادة للفطريات، في انتظار مزيد من التحقق والتوصيف في الجسم الحي لملفاتها الميتابولومية.

مقدمة

تناقش مقدمة ورقة البحث الأهمية التاريخية والمعاصرة لـ *Saccharomyces cerevisiae* (S. cerevisiae)، وهو نوع من الخميرة تم استخدامه في عمليات التخمير لأكثر من 10,000 سنة. لقد تم “تدجين” هذه الخميرة من خلال ارتباطها الطويل بالأنشطة البشرية، وهي الآن تستخدم على نطاق واسع كـ “مصنع خلايا” في صناعات الغذاء والأدوية بسبب قدرتها على أن تُهندَس لإنتاج مواد كيميائية متنوعة، تتراوح من الوقود الحيوي إلى الأدوية. كما أن S. cerevisiae هو كائن متعايش يوجد في مواقع مختلفة من جسم الإنسان، حيث يتفاعل مع ميكروبات أخرى، وقد يساهم تعطيله في أمراض مثل مرض الأمعاء الالتهابي (IBD).

تسلط الورقة الضوء على الدور المزدوج لـ S. cerevisiae في صحة الإنسان، مشيرة إلى احتمال مشاركتها في التهاب الأمعاء وآثارها المفيدة كبروبيوتيك. بينما تشير بعض الدراسات إلى وجود صلة بين S. cerevisiae واضطرابات الأمعاء، تشير دراسات أخرى إلى دورها الإيجابي في استعمار الأمعاء والنشاط المضاد للميكروبات ضد العوامل الممرضة. تتناول المقدمة أيضًا مفهوم “البوستبيوتيك”، الذي يشير إلى الميكروبات غير الحية ومنتجاتها الأيضية التي تمنح فوائد صحية. يهدف المؤلفون إلى دراسة تأثيرات المستخلصات الخلوية (CFSs) من سلالات مختلفة من S. cerevisiae على نمو *Candida albicans*، والالتصاق، وتكوين الأغشية الحيوية، ساعين لفهم النشاط المعزز المحتمل لهذه المستقلبات ضد *C. albicans*.

الطرق

يستعرض قسم “المواد والطرق” تصميم التجربة والإجراءات المستخدمة في الدراسة. يوضح المواد المحددة المستخدمة، بما في ذلك مصادرها وأي مواصفات ذات صلة، بالإضافة إلى المنهجيات المطبقة لجمع البيانات وتحليلها. يبرز القسم أهمية القابلية للتكرار والدقة في إعداد التجربة، مما يضمن إمكانية تكرار الطرق في الأبحاث المستقبلية.

بالإضافة إلى ذلك، قد يصف القسم التقنيات الإحصائية المستخدمة لتحليل البيانات، بما في ذلك أي برامج أو أدوات تم استخدامها للحساب. من الضروري أن تكون الطرق موضحة بوضوح للسماح بالتحقق من النتائج ولتسهيل المزيد من التحقيقات من قبل باحثين آخرين في هذا المجال. بشكل عام، يعد هذا القسم مكونًا أساسيًا من البحث، حيث يوفر الشفافية والوضوح بشأن النهج التجريبي.

النتائج

يقدم قسم “النتائج” من ورقة البحث النتائج المستمدة من التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. يوضح النتائج الرئيسية، بما في ذلك البيانات الإحصائية، والاتجاهات الملحوظة، وأي ارتباطات هامة تم تحديدها. غالبًا ما يتم توضيح النتائج من خلال الأشكال، والجداول، أو المعادلات لتعزيز الوضوح ودعم الاستنتاجات المستخلصة.

يؤكد القسم على تداعيات النتائج، مناقشًا أهميتها بالنسبة للفرضيات المطروحة في بداية الدراسة. قد يسلط الضوء أيضًا على أي نتائج غير متوقعة أو شذوذ ظهرت خلال عملية البحث، مما يوفر نظرة شاملة على البيانات التي تم جمعها وتفسيرها في سياق أهداف الدراسة.

المناقشة

في هذه الدراسة، تم تقييم أربعة سلالات من *Saccharomyces cerevisiae* لقدرتها على إنتاج المستخلصات الخلوية (CFSs) وآثارها على نمو وضرواة *Candida albicans*. تضمنت السلالات ثلاثة عزلات برازية من أشخاص أصحاء وسلالة مرجعية واحدة. تم إعداد CFSs تحت ظروف مضبوطة، مما يضمن تركيزات فطرية متسقة ومستويات pH، والتي تراوحت من 7.0 إلى 7.4. أشارت النتائج إلى أنه بينما لم تقم CFSs بإيقاف نمو *C. albicans* تمامًا، لوحظت تخفيضات كبيرة، خاصة مع السلالة المرجعية، التي أضعفت أيضًا التصاق الخميرة، وتكوين الأغشية الحيوية، والنشاط الأيضي.

كشف التحليل الميتابولومي عن ملفات متميزة بين CFSs، مع وجود مستقلبات محددة مثل N-acetyl-DL-tryptophan وحمض الكينورينيك التي كانت مرتفعة في العزلات البرازية. ترتبط هذه المستقلبات بخصائص مفيدة متنوعة، بما في ذلك التأثيرات المضادة للأكسدة والمضادة للالتهابات. تشير الدراسة إلى أن هذه المركبات قد تساهم في التأثيرات المثبطة الملحوظة على خصائص ضراوة *C. albicans*. تؤكد النتائج على إمكانية استخدام CFSs من *S. cerevisiae* في تعديل ضراوة الفطريات وتبرز الحاجة إلى مزيد من البحث للتحقق من أدوار هذه المستقلبات في البيئات السريرية.

Journal: Journal of Fungi, Volume: 12, Issue: 2
DOI: https://doi.org/10.3390/jof12020081
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41745224
Publication Date: 2026-01-23
Author(s): Luca Spaggiari et al.
Primary Topic: Antifungal resistance and susceptibility

Overview

The study investigates the probiotic properties of *Saccharomyces cerevisiae* in combating infections caused by the opportunistic pathogen *Candida albicans*. The researchers analyzed cell-free supernatants (CFSs) from three fecal isolates and one ATCC strain of *S. cerevisiae* to assess their effects on *C. albicans* growth and virulence factors. The findings revealed that while the CFSs moderately inhibited *C. albicans* growth, they significantly impaired virulence by reducing adhesion, biofilm formation, and metabolic activity of the fungal cells, as evidenced by colony-forming units (CFUs), crystal violet, and XTT assays.

Additionally, an untargeted metabolomic analysis of the CFSs highlighted the presence of several metabolites, including N-acetyl-DL-tryptophan, kynurenic acid, indole-3-acrylic acid, and specific dipeptides, which were more abundant in the fecal isolates compared to the reference strain. These results suggest that *S. cerevisiae* CFSs may serve as a potential postbiotic adjunct to antifungal therapies, pending further in vivo validation and characterization of their metabolomic profiles.

Introduction

The introduction of the research paper discusses the historical and contemporary significance of *Saccharomyces cerevisiae* (S. cerevisiae), a yeast species that has been utilized in fermentation processes for over 10,000 years. This yeast has been “domesticated” through its long association with human activities and is now widely employed as a “cell factory” in the food and pharmaceutical industries due to its ability to be engineered for the production of various chemicals, ranging from biofuels to pharmaceuticals. S. cerevisiae is also a commensal organism found in various human body sites, where it interacts with other microorganisms, and its disruption may contribute to diseases such as Inflammatory Bowel Disease (IBD).

The paper highlights the dual role of S. cerevisiae in human health, noting its potential involvement in gut inflammation and its beneficial effects as a probiotic. While some studies suggest a link between S. cerevisiae and gut disorders, others indicate its positive role in gut colonization and antimicrobial activity against pathogens. The introduction also addresses the concept of “postbiotics,” which refers to inanimate microorganisms and their metabolic products that confer health benefits. The authors aim to investigate the effects of cell-free supernatants (CFSs) from different S. cerevisiae strains on *Candida albicans* growth, adhesion, and biofilm formation, seeking to understand the potential enhanced activity of these metabolites against *C. albicans*.

Methods

The “Materials and Methods” section outlines the experimental design and procedures employed in the study. It details the specific materials used, including their sources and any relevant specifications, as well as the methodologies applied for data collection and analysis. The section emphasizes the importance of reproducibility and rigor in the experimental setup, ensuring that the methods can be replicated in future research.

Additionally, the section may describe the statistical techniques utilized to analyze the data, including any software or tools employed for computation. It is crucial that the methods are clearly articulated to allow for validation of the findings and to facilitate further investigation by other researchers in the field. Overall, this section serves as a foundational component of the research, providing transparency and clarity regarding the experimental approach.

Results

The “Results” section of the research paper presents the findings derived from the conducted experiments or analyses. It details the key outcomes, including statistical data, observed trends, and any significant correlations identified. The results are often illustrated through figures, tables, or equations to enhance clarity and support the conclusions drawn.

The section emphasizes the implications of the findings, discussing their relevance to the hypotheses posed at the outset of the study. It may also highlight any unexpected results or anomalies that emerged during the research process, providing a comprehensive overview of the data collected and its interpretation within the context of the study’s objectives.

Discussion

In this study, four strains of *Saccharomyces cerevisiae* were evaluated for their ability to produce cell-free supernatants (CFSs) and their effects on the growth and virulence of *Candida albicans*. The strains included three fecal isolates from healthy subjects and one reference strain. The CFSs were prepared under controlled conditions, ensuring consistent fungal concentrations and pH levels, which ranged from 7.0 to 7.4. The results indicated that while the CFSs did not completely inhibit *C. albicans* growth, significant reductions were observed, particularly with the reference strain, which also impaired the yeast’s adhesion, biofilm formation, and metabolic activity.

Metabolomic analysis revealed distinct profiles among the CFSs, with specific metabolites such as N-acetyl-DL-tryptophan and kynurenic acid being upregulated in the fecal isolates. These metabolites are associated with various beneficial properties, including antioxidant and anti-inflammatory effects. The study suggests that these compounds may contribute to the observed inhibitory effects on *C. albicans* virulence traits. The findings underscore the potential of *S. cerevisiae* CFSs in modulating fungal pathogenicity and highlight the need for further research to validate the roles of these metabolites in clinical settings.