تطور التحمل للأدوية داخل المضيف في المتفطرة السلية Within-host evolution of drug tolerance in Mycobacterium tuberculosis

شارك:
المجلة: JAC-Antimicrobial Resistance، المجلد: 8، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1093/jacamr/dlag007
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41674995
تاريخ النشر: 2026-01-07
المؤلف: Valerie F. A. March وآخرون
الموضوع الرئيسي: أبحاث وعلم وبائيات السل

نظرة عامة

تبحث هذه الدراسة في دور تحمل المضادات الحيوية في تأخير تحويل الثقافة وزيادة المقاومة لدى مرضى السل (TB)، مع التركيز بشكل خاص على المتفطرة السلية (Mtb). تفترض الدراسة أن تحمل المضادات الحيوية قد يسهم في ردود الفعل الضعيفة للعلاج، خاصة في حالات السل المقاوم للعلاج والسل المقاوم لعدة أدوية (MDR-TB).

لاستكشاف ذلك، جمع الباحثون عزلات Mtb المتسلسلة من مجموعتين من المرضى: أولئك الذين يعانون من السل القابل للعلاج والذين ظلوا إيجابيين في الثقافة لمدة تصل إلى ست سنوات وأولئك الذين يعانون من MDR-TB ويختبرون زيادة المقاومة أثناء العلاج. قاموا بتقييم تحمل الريفامبين (RIF) في السلالات القابلة للعلاج وتحمل الموكسي فلوكساسين (MFX) في سلالات MDR-TB باستخدام اختبار قتل في الوقت الحقيقي. كشفت النتائج أن تحمل RIF تطور داخل المضيف، وزاد بمقدار حوالي 1.5 مرة؛ ومع ذلك، لم يسهم هذا التحمل بشكل كبير في تأخير تحويل الثقافة. على العكس، كان تحمل MFX في مرضى MDR-TB مرتبطًا سلبًا بزيادة المقاومة وأظهر انخفاضًا مستمرًا مع مرور الوقت، مما يشير إلى إمكانية تحسين نتائج العلاج في هذه الفئة من السكان.

مقدمة

تسلط المقدمة الضوء على التحدي الكبير الذي تمثله المتفطرة السلية (Mtb) للصحة العامة، والتي كانت مسؤولة عن حوالي 1.2 مليون وفاة في عام 2023، مما يجعلها أكثر العوامل المعدية فتكًا. بينما تظل العلاج الكيميائي بالمضادات الحيوية المركبة فعالًا للسل القابل للعلاج (DS-TB)، فإن ظهور السل المقاوم لعدة أدوية (MDR-TB) يعقد العلاج، خاصة بسبب المقاومة للأدوية الأساسية مثل الريفامبين (RIF) والإيزونيازيد. تشمل أنظمة العلاج لـ MDR-TB الآن عوامل من الخط الثاني وأدوية جديدة مضادة للسل؛ ومع ذلك، فإن السلالات التي تحتوي على طفرات تسبب المقاومة موجودة بالفعل في التداول، مما يزيد من مشكلة زيادة المقاومة.

كما تؤكد هذه الفقرة على تأثير العوامل الاجتماعية والديموغرافية والأمراض المصاحبة، مثل العدوى المشتركة بفيروس نقص المناعة البشرية، على نتائج علاج السل. تزيد ردود الفعل الضعيفة للعلاج، التي تتميز بتأخير تحويل الثقافة وزيادة مقاومة الأدوية، من خطر النتائج السلبية. أظهرت الأبحاث الحديثة أن المحددات الجينومية البكتيرية يمكن أن تؤثر على نتائج العلاج، مما يستدعي مزيدًا من التحقيق في دور تحمل المضادات الحيوية – وهو ظاهرة لم يتم استكشافها بشكل كافٍ في السل. يقترح المؤلفون دراسة تأثير تحمل المضادات الحيوية لـ RIF والموكسي فلوكساسين (Mfx) على تأخير تحويل الثقافة وزيادة المقاومة في السلالات من مرضى DS-TB وMDR-TB، باستخدام عزلات سريرية من مرضى السل التاريخيين في جورجيا.

الطرق

تحدد فقرة “الطرق” في ورقة البحث التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، مع دمج التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من المشاركين. شملت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، واستطلاعات، ودراسات رصدية، مما يضمن فهمًا شاملاً للظواهر قيد التحقيق.

شملت جمع البيانات أدوات موحدة لقياس المتغيرات ذات الصلة، تلتها اختبارات إحصائية صارمة لتقييم أهمية النتائج. تم استخدام تقنيات مثل تحليل الانحدار وANOVA لتحليل العلاقات بين المتغيرات، مما يسمح باستخلاص استنتاجات قوية من النتائج. تؤكد الفقرة على أهمية الصرامة المنهجية في ضمان صحة وموثوقية نتائج الدراسة.

النتائج

في هذه الدراسة، قمنا بتحليل بيانات سريرية استعادية من مجموعة من المرضى الجورجيين الذين يعانون من السل الرئوي النشط (TB)، مصنفين إلى أربع مجموعات متميزة بناءً على ملفات حساسية الأدوية ونتائجهم السريرية: مجموعة التحكم في DS-TB (المجموعة A، $n = 3$)، مجموعة DS-TB المقاوم (المجموعة B، $n = 6$)، مجموعة التحكم في MDR-TB (المجموعة C، $n = 4$)، ومجموعة زيادة المقاومة في MDR-TB (المجموعة D، $n = 5$). حقق المرضى في المجموعة A سلبية الثقافة في غضون 12 شهرًا من العلاج، بينما ظل أولئك في المجموعة B إيجابيين في الثقافة لمدة تصل إلى ست سنوات دون تطوير مقاومة للأدوية. كانت المجموعتان C وD تتكونان من مرضى تم تشخيصهم بـ MDR-TB، حيث شهدت المجموعة D زيادة في المقاومة أثناء العلاج. قدمت هذه المجموعة، التي تضم 18 مريضًا و28 سلالة، مجموعة بيانات قيمة لفحص الآثار السريرية لتحمل المضادات الحيوية في السل.

لضمان أن المرضى كانوا مصابين بنفس سلالة المتفطرة السلية طوال فترة علاجهم، قمنا بإجراء تسلسل الجينوم الكامل على جميع العزلات. كشفت التحليلات النشوء والتطور أن العزلات من نفس المريض، التي تم جمعها على مر الزمن، تكتلوا معًا عن كثب مع أقصى مسافة لتعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة (SNP) تبلغ 16، مما يشير إلى أنهم كانوا فعليًا نفس السلالة. ومن الجدير بالذكر أن عزلات MDR كانت تنتمي في الغالب إلى سلالة المتفطرة السلية المعقدة 2، بينما كانت العزلات القابلة للعلاج تأتي أساسًا من السلالة 4، مما يتماشى مع علم الأوبئة الجزيئية المعروف للسل في جورجيا. تؤكد هذه النتيجة على الأهمية الوبائية لمجموعة عيناتنا وتبرز الاستقرار الجيني للسلالات أثناء العلاج.

المناقشة

في هذه الدراسة، تم الحصول على الموافقة الأخلاقية من مجالس المراجعة المؤسسية ذات الصلة لاستخدام عينات وبيانات المرضى المجهولة الهوية. قام الباحثون بتحليل قاعدة بيانات لحالات السل (TB) من مرضى جورجيين بين يناير 2008 وديسمبر 2022، مع التركيز على حالات السل القابل للعلاج (DS-TB) والسل المقاوم لعدة أدوية (MDR-TB). اختاروا ثلاثة مرضى من DS-TB تم شفاؤهم (المجموعة A) وستة مرضى من DS-TB المقاوم الذين كانت لديهم ثقافات بلغم إيجابية لفترة طويلة (المجموعة B). بالإضافة إلى ذلك، شملوا مرضى MDR-TB الذين ظلت ملفات مقاومتهم دون تغيير.

قامت الدراسة بقياس تحمل المضادات الحيوية باستخدام اختبار قتل في الوقت الحقيقي للريفامبين (RIF) والموكسي فلوكساسين (Mfx). أشارت النتائج إلى عدم وجود اختلافات كبيرة في تحمل RIF بين المجموعتين A وB، مما يشير إلى أن حساسية RIF لا تفسر السل المقاوم. من المثير للاهتمام، لوحظ انخفاض تحمل Mfx في السلالات من المرضى الذين طوروا مقاومة للفلوروكينولونات (المجموعة D) مقارنة بأولئك الذين ظلوا MDR (المجموعة C)، مما يتعارض مع النتائج السابقة في بكتيريا أخرى. كشفت تحليل العزلات المتسلسلة عن ديناميات تحمل RIF غير المتجانسة داخل المجموعة B، حيث أظهرت بعض السلالات زيادة في التحمل مع مرور الوقت، ربما بسبب التعرض المتقطع للأدوية. على العكس، أظهرت المجموعة C انخفاضًا مستمرًا في تحمل Mfx مع مرور الوقت. يستنتج المؤلفون أن تحمل المضادات الحيوية في المتفطرة السلية يتطور بطريقة خاصة بكل مريض، مع آثار على نتائج العلاج تستدعي مزيدًا من التحقيق في مجموعات أكبر.

Journal: JAC-Antimicrobial Resistance, Volume: 8, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1093/jacamr/dlag007
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41674995
Publication Date: 2026-01-07
Author(s): Valerie F. A. March et al.
Primary Topic: Tuberculosis Research and Epidemiology

Overview

This research investigates the role of antibiotic tolerance in delayed culture conversion and resistance amplification in tuberculosis (TB) patients, particularly focusing on Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The study hypothesizes that antibiotic tolerance may contribute to poor treatment responses, specifically in cases of recalcitrant TB and multidrug-resistant TB (MDR-TB).

To explore this, the researchers collected serial Mtb isolates from two patient groups: those with drug-susceptible TB who remained culture positive for up to six years and those with MDR-TB experiencing resistance amplification during treatment. They assessed tolerance to rifampicin (RIF) in drug-susceptible strains and moxifloxacin (MFX) in MDR-TB strains using a real-time time-kill assay. The findings revealed that RIF tolerance evolved within-host, increasing by approximately 1.5-fold; however, this tolerance did not significantly contribute to delayed culture conversion. Conversely, MFX tolerance in MDR-TB patients was negatively associated with resistance amplification and showed a consistent decrease over time, suggesting a potential avenue for improving treatment outcomes in this population.

Introduction

The introduction highlights the significant public health challenge posed by Mycobacterium tuberculosis (Mtb), which was responsible for approximately 1.2 million deaths in 2023, making it the deadliest infectious agent. While combination antibiotic chemotherapy remains effective for drug-susceptible tuberculosis (DS-TB), the emergence of multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) complicates treatment, particularly due to resistance to frontline drugs such as rifampicin (RIF) and isoniazid. Treatment regimens for MDR-TB now include second-line agents and novel anti-TB drugs; however, strains with resistance-conferring mutations are already in circulation, exacerbating the issue of resistance amplification.

The section also emphasizes the influence of sociodemographic factors and comorbidities, such as HIV coinfection, on TB treatment outcomes. Poor treatment responses, characterized by delayed culture conversion and increased drug resistance, further heighten the risk of adverse outcomes. Recent research has indicated that bacterial genomic determinants can affect treatment outcomes, prompting further investigation into the role of antibiotic tolerance—a phenomenon that has been underexplored in TB. The authors propose to examine the impact of antibiotic tolerance to RIF and moxifloxacin (Mfx) on delayed culture conversion and resistance amplification in strains from both DS-TB and MDR-TB patients, utilizing clinical isolates from historical TB patients in Georgia.

Methods

The “Methods” section of the research paper outlines the experimental design and analytical techniques employed to investigate the research questions. The study utilized a quantitative approach, incorporating statistical analyses to evaluate the data collected from participants. Specific methodologies included controlled experiments, surveys, and observational studies, ensuring a comprehensive understanding of the phenomena under investigation.

Data collection involved standardized instruments to measure relevant variables, followed by rigorous statistical testing to assess the significance of the findings. Techniques such as regression analysis and ANOVA were employed to analyze the relationships between variables, allowing for robust conclusions to be drawn from the results. The section emphasizes the importance of methodological rigor in ensuring the validity and reliability of the study’s outcomes.

Results

In this study, we analyzed retrospective clinical data from a cohort of Georgian patients with active pulmonary tuberculosis (TB), categorized into four distinct groups based on their drug susceptibility profiles and clinical outcomes: DS-TB control (Group A, $n = 3$), DS-TB recalcitrant (Group B, $n = 6$), MDR-TB control (Group C, $n = 4$), and MDR-TB resistance amplification (Group D, $n = 5$). Patients in Group A achieved culture negativity within 12 months of treatment, while those in Group B remained culture-positive for up to six years without developing drug resistance. Groups C and D consisted of patients diagnosed with MDR-TB, with Group D experiencing further resistance during treatment. This cohort, comprising 18 patients and 28 strains, provided a valuable dataset for examining the clinical implications of antibiotic tolerance in TB.

To ensure that the patients were infected with the same Mycobacterium tuberculosis strain throughout their treatment, we conducted whole genome sequencing on all isolates. Phylogenetic analysis revealed that isolates from the same patient, collected over time, clustered closely together with a maximum single nucleotide polymorphism (SNP) distance of 16, indicating they were effectively the same strain. Notably, MDR isolates predominantly belonged to the Mycobacterium tuberculosis complex lineage 2, while drug-susceptible isolates were primarily from lineage 4, aligning with the known molecular epidemiology of TB in Georgia. This finding underscores the endemic relevance of our sample set and highlights the genetic stability of the strains during treatment.

Discussion

In this study, ethical approval was obtained from the relevant institutional review boards for the use of anonymized patient samples and data. The researchers analyzed a database of tuberculosis (TB) cases from Georgian patients between January 2008 and December 2022, focusing on drug-susceptible TB (DS-TB) and multidrug-resistant TB (MDR-TB) cases. They selected three DS-TB patients who were cured (Group A) and six recalcitrant DS-TB patients with prolonged positive sputum cultures (Group B). Additionally, they included MDR-TB patients whose resistance profiles remained unchanged.

The study measured antibiotic tolerance using a real-time killing assay for rifampicin (RIF) and moxifloxacin (Mfx). Results indicated no significant differences in RIF tolerance between Groups A and B, suggesting that RIF susceptibility does not account for recalcitrant TB. Interestingly, lower Mfx tolerance was observed in strains from patients who developed fluoroquinolone resistance (Group D) compared to those who remained MDR (Group C), contradicting previous findings in other bacteria. The analysis of serial isolates revealed heterogeneous RIF tolerance dynamics within Group B, with some strains exhibiting increased tolerance over time, potentially due to intermittent drug exposure. Conversely, Group C showed a consistent decrease in Mfx tolerance over time. The authors conclude that antibiotic tolerance in Mycobacterium tuberculosis evolves in a patient-specific manner, with implications for treatment outcomes that warrant further investigation in larger cohorts.