DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-025-06500-5
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41518554
تاريخ النشر: 2026-01-10
المؤلف: Sead Sabanadzovic وآخرون
الموضوع الرئيسي: أبحاث تفاعلات النباتات والفطريات
نظرة عامة
ترتيب Martellivirales يشمل سبع عائلات من الفيروسات ذات الحمض النووي الريبي الإيجابي (+) ، بما في ذلك Bromoviridae و Closteroviridae و Endornaviridae و Kitaviridae و Mayoviridae و Togaviridae و Virgaviridae ، والتي تصيب مجموعة متنوعة من المضيفين مثل الحيوانات والفطريات والنباتات. تظهر هذه الفيروسات هياكل فيروسية متنوعة تتكون من بروتينات غلاف غير متجانسة (CPs) ، ومع ذلك تشترك في خاصية مشتركة في وحدات النسخ المتماثل الشبيهة بالألفا فيروس. يقدم هذا البحث عائلة جديدة ، “Tobaliviridae” ، لتصنيف مجموعة من الفيروسات الناشئة التي تم التعرف عليها في الفطريات ، وتحديداً تحت جنس “Tobalivirus” ، والذي يشمل تسع أنواع. تمتلك Tobaliviruses بروتين غلاف متجانس مع تلك الموجودة في closteroviruses و potyviruses و alphaflexiviruses ، ومن المعروف أن بعضها يشكل فيروسات ليفية مرنة. الاقتراح الرسمي لهذه العائلة في انتظار التصديق من قبل اللجنة الدولية لتصنيف الفيروسات (ICTV).
في الختام ، يشمل ترتيب Martellivirales ، الذي تم تأسيسه في عام 2020 ، حالياً سبع عائلات من الفيروسات ذات الحمض النووي الريبي (+) التي تصيب مجموعة واسعة من الكائنات الحية. على الرغم من هياكلها الفيروسية المتنوعة ، تتوحد هذه الفيروسات من خلال وحدات النسخ المتماثل الشبيهة بالألفا فيروس المتجانسة التي تتميز بثلاثة مجالات إنزيمية محفوظة. تهدف العائلة المقترحة “Tobaliviridae” إلى تصنيف سلالة مميزة من “فيروسات شبيهة بالتوبامو” (TLVs) ذات الجينوم غير المجزأ الموجودة في الفطريات من نوع Ascomycetes و Basidiomycetes. تتكون العائلة من جنس واحد ، “Tobalivirus” ، مع تسع أنواع محددة بأكثر من 10% من تباين الأحماض الأمينية عبر جميع البروتينات ، مدعومة بتجمعات فيلو جينية قوية. ومن الجدير بالذكر أن TLVs مرتبطة بشكل بعيد فقط بالتوبامورفيروسات ، التي تنتمي إلى عائلة Virgaviridae.
مقدمة
تناقش مقدمة هذه الورقة البحثية تحديد وتصنيف عائلة جديدة من الفيروسات الفطرية ، المسماة “Tobaliviridae” ، والتي تشمل عدة فيروسات غير مصنفة ذات جينومات RNA غير المجزأة (+) تتراوح من حوالي 10-13 كيلوبايت. تُعرف هذه الفيروسات باسم “فيروسات شبيهة بالتوبامو” (TLVs) ، وتظهر بنية جينومية مشابهة لتلك الخاصة بالتوبامورفيروسات ، تحتوي على أربعة إطارات قراءة مفتوحة (ORFs). ترمز أول إطاري قراءة إلى مركب النسخ المتماثل ، بينما يرمز ORF3 إلى بروتين له نشاط هيليكاز ، ويقترح أن يكون ORF4 بروتينًا هيكليًا يشارك في تشكيل الفيروس. ومن الجدير بالذكر أن الخصائص الهيكلية لـ TLVs تختلف عن تلك الخاصة بالتوبامورفيروسات ، لا سيما في مورفولوجيا الفيروس ، حيث تشكل TLVs جزيئات طويلة ومرنة ، على عكس القضبان الصلبة للتوبامورفيروسات.
تكشف التحليلات الفيلوجينية المستندة إلى مجال بوليميراز RNA المعتمد على RNA (RdRP) أن TLVs تشكل مجموعة أحادية النمط مميزة ، مما يبرر تصنيفها في عائلة جديدة. تقترح الدراسة تسع أنواع جديدة ضمن جنس واحد ، “Tobalivirus” ، استنادًا إلى تباين تسلسل الأحماض الأمينية والعلاقات الفيلوجينية. تؤكد هذه النتائج الفروق البيولوجية والجزيئية بين TLVs وعائلات الفيروسات الموجودة ، مما يدعم إنشاء Tobaliviridae ضمن ترتيب Martellivirales. تؤكد الأبحاث على الحاجة إلى مزيد من التوضيح التجريبي لوظائف بروتينات TLV ، لا سيما دور ORF3 في دورة حياة الفيروس.
مناقشة
في مناقشة ترتيب Martellivirales ، الذي تم تأسيسه في عام 2020 ، يتم تسليط الضوء على أن هذا الترتيب يشمل سبع عائلات من الفيروسات ذات الحمض النووي الريبي (+) التي تصيب مجموعة متنوعة من المضيفين ، بما في ذلك الحيوانات والنباتات والفطريات. تظهر هذه الفيروسات مجموعة واسعة من الهياكل الفيروسية ، حيث تفتقر عائلة Endornaviridae بشكل ملحوظ إلى الفيروسات. على الرغم من هذا التنوع ، تشترك في خاصية مشتركة في آليات النسخ المتماثل الخاصة بها ، والتي تتميز بوحدات متجانسة شبيهة بالألفا فيروس تحتوي على ثلاثة مجالات إنزيمية محفوظة.
يقترح المؤلفون إنشاء عائلة جديدة ، “Tobaliviridae” ، لتصنيف سلالة محددة من “فيروسات شبيهة بالتوبامو” (TLVs) التي تم التعرف عليها في الفطريات من نوع Ascomycetes و Basidiomycetes. تمثل هذه العائلة جنسًا واحدًا فقط ، “Tobalivirus” ، والذي يشمل تسع أنواع تميزت بأكثر من 10% من تباين الأحماض الأمينية عبر جميع البروتينات ، مدعومة بأدلة فيلو جينية قوية. ومن المثير للاهتمام أن TLVs مرتبطة بشكل بعيد فقط بالتوبامورفيروسات ، التي تنتمي إلى عائلة Virgaviridae ، على الرغم من أن تسميتها تشير إلى علاقة أقرب.
DOI: https://doi.org/10.1007/s00705-025-06500-5
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41518554
Publication Date: 2026-01-10
Author(s): Sead Sabanadzovic et al.
Primary Topic: Plant and Fungal Interactions Research
Overview
The order Martellivirales encompasses seven families of positive-strand (+) RNA viruses, including Bromoviridae, Closteroviridae, Endornaviridae, Kitaviridae, Mayoviridae, Togaviridae, and Virgaviridae, which infect a variety of hosts such as animals, fungi, and plants. These viruses exhibit diverse virion structures formed from non-homologous capsid proteins (CPs), yet they share a commonality in their alphavirus-like replication modules. This paper introduces a new family, “Tobaliviridae,” to classify a group of emerging viruses identified in fungi, specifically under the genus “Tobalivirus,” which includes nine species. Tobaliviruses possess a capsid protein homologous to those found in closteroviruses, potyviruses, and alphaflexiviruses, and some are known to form flexible filamentous virions. The formal proposal for this family is pending ratification by the International Committee for Taxonomy of Viruses (ICTV).
In conclusion, the order Martellivirales, established in 2020, currently includes seven families of (+) RNA viruses that infect a wide range of organisms. Despite their diverse virion structures, these viruses are unified by homologous alphavirus-like replication modules characterized by three conserved enzymatic domains. The proposed family “Tobaliviridae” aims to categorize a distinct lineage of “tobamo-like viruses” (TLVs) with non-segmented genomes found in ascomycetous and basidiomycetous fungi. The family consists of a single genus, “Tobalivirus,” with nine species defined by more than 10% amino acid divergence across all proteins, supported by robust phylogenetic clustering. Notably, TLVs are only distantly related to tobamoviruses, which belong to the family Virgaviridae.
Introduction
The introduction of this research paper discusses the identification and classification of a new family of mycoviruses, termed “Tobaliviridae,” which encompasses several unclassified viruses with non-segmented (+)RNA genomes ranging from approximately 10-13 kb. These viruses, referred to as “tobamo-like viruses” (TLVs), exhibit a genome architecture similar to that of tobamoviruses, containing four open reading frames (ORFs). The first two ORFs encode a replication complex, while ORF3 encodes a protein with helicase activity, and ORF4 is proposed to be a structural protein involved in virion formation. Notably, the structural characteristics of TLVs differ from those of tobamoviruses, particularly in virion morphology, as TLVs form long, flexible particles, contrasting with the rigid rods of tobamoviruses.
Phylogenetic analyses based on the RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) domain reveal that TLVs form a distinct monophyletic clade, justifying their classification into a new family. The study proposes nine new species within a single genus, “Tobalivirus,” based on amino acid sequence divergence and phylogenetic relationships. These findings underscore the biological and molecular distinctions between TLVs and existing virus families, supporting the establishment of Tobaliviridae within the order Martellivirales. The research emphasizes the need for further experimental elucidation of the functions of TLV proteins, particularly the role of ORF3 in the viral life cycle.
Discussion
In the discussion of the order Martellivirales, established in 2020, it is highlighted that this order encompasses seven families of (+)RNA viruses that infect a diverse range of hosts, including animals, plants, and fungi. These viruses exhibit a wide variety of virion structures, with the Endornaviridae family notably lacking virions. Despite this diversity, they share a commonality in their replication mechanisms, characterized by homologous alphavirus-like modules that contain three conserved enzymatic domains.
The authors propose the establishment of a new family, “Tobaliviridae,” to categorize a specific lineage of “tobamo-like viruses” (TLVs) identified in ascomycetous and basidiomycetous fungi. This family is represented by a single genus, “Tobalivirus,” which includes nine species distinguished by more than 10% amino acid divergence across all proteins, supported by strong phylogenetic evidence. Interestingly, TLVs are only distantly related to tobamoviruses, which belong to the family Virgaviridae, despite their nomenclature suggesting a closer relationship.