التصنيف: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)
-
بانوراما مناعية شاملة للالتهاب الرئوي البكتيري تكشفها خريطة تعبير الجينات على مستوى الخلية الواحدة على نطاق واسع A pan-immune panorama of bacterial pneumonia revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas
الالتهاب الرئوي البكتيري هو عبء كبير على الصحة العامة، حيث يساهم في معدلات مرضية ووفاة مرتفعة وتكاليف الرعاية الصحية. الاستراتيجيات العلاجية الحالية بخلاف المضادات الحيوية والعلاجات المساعدة محدودة، مما يبرز الحاجة إلى فهم أعمق لآلية تطور المرض. هنا، استخدمنا تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لـ 444,146 خلية من سائل غسل القصبات الهوائية (BALFs) من…
-
اكتشاف الببتيدات المضادة للميكروبات في الميكروبيوم العالمي باستخدام التعلم الآلي Discovery of antimicrobial peptides in the global microbiome with machine learning
الملخص: هناك حاجة ماسة لمضادات حيوية جديدة لمكافحة أزمة مقاومة المضادات الحيوية. نقدم نهجًا قائمًا على التعلم الآلي للتنبؤ بالببتيدات المضادة للميكروبات (AMPs) ضمن الميكروبيوم العالمي ونستفيد من مجموعة بيانات ضخمة تضم 63,410 ميتاجينومات و87,920 جينومًا بدائي النواة من المواطن البيئية والمترابطة مع المضيف لإنشاء AMPSphere، وهو كتالوج شامل يتضمن 863,498 ببتيد غير متكرر، القليل…