الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: المجمعات البروتينية
-
طريقة تعلم آلة لحساب استقرار البروتينات المحلية للغاية A machine learning method for calculating highly localized protein stabilities
2026 | المؤلف: Chenlin Lu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم تطوير PFNet، وهو إطار عمل للتعلم الآلي مصمم لحساب الطاقة الحرة على مستوى البقايا لفتح ($\Delta G_{op}$) للبروتينات والمجمعات باستخدام مجموعات بيانات تبادل الهيدروجين/الطيف الكتلي (HX-MS) على مستوى الببتيد التقليدي. تعتبر $\Delta G_{op}$ وصفًا حراريًا حاسمًا لاستقرار البروتين المحلي، مما يوفر رؤى حول التجمعات الت conformational الديناميكية التي تحدد وظيفة البروتين في…
-
AlphaFold3 في CASP16 AlphaFold3 at CASP16
2026 | المؤلف: Arne Elofsson | المجلة: Proteins Structure Function and Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)أقام تجربة CASP16 معيارًا لـ AlphaFold3، الذي يتميز عن AlphaFold2 بقدرته على توقع هياكل الجزيئات غير البروتينية. تقيم هذه الدراسة أداء AlphaFold3 من خلال تقديمات تلقائية من الخادم وتوقعات يدوية من مجموعة إلوفسون، مما يكشف أن AlphaFold3 يحقق نتائج مماثلة لأفضل المتنبئين للبروتينات والمجمعات، كما يتضح من متوسط درجات GDT_TS وDockQ. من الجدير بالذكر أن…