الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تحديد البروتين
-
تصحيح تأثير الدفعات على مستوى البروتين يعزز المتانة في البروتيوميات المعتمدة على MS Protein-level batch-effect correction enhances robustness in MS-based proteomics
2026 | المؤلف: Qiaochu Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)قسم “الطرق” يوضح تصميم التجارب والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث تم استخدام التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية. تم إجراء…
-
تحليل متعمق لخصائص البيانات وتقييم مقارن لدقة dda و dia في البروتيوميات الكمية بدون علامات للعينات البيولوجية In-depth analysis of data characteristics and comparative evaluation of dda and dia accuracy in label-free quantitative proteomics of biological samples
2026 | المؤلف: Xun Zou وآخرون | المجلة: Clinical Proteomics | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)في هذه الدراسة، قمنا بمقارنة منهجيات الاكتساب المعتمد على البيانات (DDA) والاكتساب المستقل عن البيانات (DIA) بشكل منهجي في علم البروتيوميات القائم على مطيافية الكتلة عبر ثلاثة أنواع من العينات النموذجية: نموذج مرضي ونموذجان معالجتان بالأدوية، جنبًا إلى جنب مع ضوابطها. شمل تقييمنا مجموعة من المقاييس تتجاوز التدابير التقليدية مثل إجمالي عدد البروتينات والببتيدات، بما…
-
تحليل مقارن وتحسين لأساليب استخراج المعلومات البروتينية للمواد اللاصقة في القطع الفنية المطلية Comparative analysis and optimization of proteomic information mining approaches for proteinaceous binders in painted artifacts
2026 | المؤلف: Jin Dong وآخرون | المجلة: npj Heritage Science | المجال: علم الآثار (Archeology)تقدم هذه الدراسة مقارنة منهجية بين حزمتين بارزتين من برامج البروتيوميات، FragPipe (FP) وProteome Discoverer (PD)، مع التركيز على كفاءتهما في تحديد الروابط البروتينية في القطع الفنية المطلية. تشير النتائج إلى أن كلا الأداتين البرمجيتين تحققان أعدادًا مشابهة من التعرف على البروتينات ودقة متقاربة؛ ومع ذلك، فإن FP تتفوق بشكل كبير على PD من حيث…
-
DIA-BERT: نماذج تحويلية مدربة مسبقًا من البداية إلى النهاية لتحليل بيانات البروتيوميات المحسنة DIA-BERT: pre-trained end-to-end transformer models for enhanced DIA proteomics data analysis
2026 | المؤلف: Zhiwei Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)يقدم القسم نظرة عامة على تطوير وقدرات DIA-BERT، أداة برمجية جديدة مصممة لتحليل بيانات قياس الطيف الكتلي المستقل عن البيانات (DIA-MS) في البروتيوميات الكمية. يستخدم DIA-BERT نموذج ذكاء اصطناعي مدرب مسبقًا قائم على المحولات، تم تدريبه على مجموعة بيانات كبيرة تضم أكثر من 276 مليون سلف ببتيد عالي الجودة من ملفات DIA-MS الحالية و34 مليون…