الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تحليل التسلسل، RNA

تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لعينات خزعة الأمعاء الدقيقة النهائية يكشف عن توقيعات مرض كرون

2026 | المؤلف: Monika Krzak وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)

يحدد قسم “الطرق” الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح معايير اختيار المشاركين، وتصميم التجارب، والتحليلات الإحصائية المستخدمة لتفسير البيانات. يتم وصف منهجيات محددة، مثل استخدام مجموعات التحكم، وتقنيات العشوائية، والأدوات لجمع البيانات (مثل الاستطلاعات، والقياسات)، لضمان إمكانية تكرار النتائج وصحتها. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات عن النماذج الرياضية أو المعادلات المطبقة في…
تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لكريات الدم البيضاء عند واجهة الأم والجنين في حالات الحمل الطبيعية والمرضية التي تفتقر إلى العقدة

2026 | المؤلف: Sarah Yull وآخرون | المجلة: Frontiers in Immunology | المجال: علم المناعة (Immunology)

تقدم هذه القسم نظرة عامة على الأدوار الحرجة لكريات الدم البيضاء عند واجهة الأم والجنين خلال الحمل، وخاصة في منع ردود الفعل المناعية للأم تجاه الأنتيجينات الجنينية، وإدارة الالتهاب، وتسهيل تكوين الأوعية الدموية في المشيمة. يبرز أن التكيفات المناعية غير الكافية لدى الأم يمكن أن تؤدي إلى قصور في المشيمة ومضاعفات إنجابية خطيرة. تشير النتائج…
رسم خرائط تسلسل mRNA المباشر عبر الإنترنت باستخدام هضمات RNase T1 الجزئية

2026 | المؤلف: Jessica S. Dale وآخرون | المجلة: Analytical Chemistry | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تتناول هذه الفقرة تطوير وتطبيق طريقة تعتمد على مطيافية الكتلة لرسم تسلسل مباشر لـ mRNA، باستخدام هضمات RNase T1 الجزئية عبر الإنترنت مع مطيافية الكتلة السائلة ثنائية الأبعاد (2D LC-MS). تتيح هذه الطريقة تحليل الخصائص النوعية الحرجة لأدوية mRNA، مثل هوية التسلسل، وكفاءة التغطية 5′، وخصائص ذيل poly(A) 3′، والتي تعتبر ضرورية لضمان جودة وسلامة…
تسلسل RNA طويل القراءة عالي الدقة يعزز التشخيصات السريرية في الاضطرابات النادرة

2026 | المؤلف: Carolina Jaramillo Oquendo وآخرون | المجلة: European Journal of Human Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)

تدرس الدراسة فعالية تسلسل RNA طويل القراءة من PacBio (LRS) في الكشف عن أحداث التقطيع المرضية في الاضطرابات النادرة، خاصة بالمقارنة مع تسلسل RNA قصير القراءة (RNAseq). غالبًا ما تظل المتغيرات التي تعطل التقطيع، والتي تُعتبر مساهمات هامة في المرض، غير مكتشفة بسبب القيود في طرق التسلسل الحالية. شملت الأبحاث 25 مشاركًا من المملكة المتحدة…
يكشف تسلسل فيروس نقص المناعة البشرية عن اختلافات في التعبير الجيني بين خلايا فيروس نقص المناعة البشرية المفرطة النشاط والمكبوحة

2026 | المؤلف: J. Frouard وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

قسم “طرق” يوضح الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون مجموعة من التقنيات الكمية والنوعية لجمع البيانات، مما يضمن تحليلًا شاملاً لأسئلة البحث. شملت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، ونمذجة إحصائية، ومحاكاة، تم تصميمها لاختبار الفرضيات التي تم صياغتها في المراحل الأولية من البحث. شمل جمع البيانات عملية عينة منهجية، حيث تم اختيار المشاركين بناءً…
تسلسل الأمبليكون القائم على الحمض النووي DNA والحمض النووي الريبي RNA للبلاك الناتج عن الآفات السنية فوق اللثة والمينا في الأطفال الذين يعانون من تسوس الأسنان الشديد في مرحلة الطفولة المبكرة

2026 | المؤلف: Allison A. Naumann وآخرون | المجلة: International Journal of Oral Science | المجال: أمراض الروماتيزم (Rheumatology)

تؤثر تسوس الأسنان في مرحلة الطفولة المبكرة (ECC) على أكثر من 514 مليون طفل على مستوى العالم، حيث تمثل تسوس الأسنان الشديد في مرحلة الطفولة المبكرة (S-ECC) الشكل الأكثر عدوانية. يتميز S-ECC بعدد محدد من الأسطح المثقوبة أو المفقودة أو المحشوة في الأسنان الأمامية العلوية الأولية، أو العدد الإجمالي للأسطح السنية المتسوسة أو المفقودة أو…
تحديد تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة لتماثل البلعميات الشبيهة بـ M2 المرتبطة بعلاج الخلايا الجذعية الميزانشيمية في نموذج إنتان فئري

2026 | المؤلف: Takehiko Oami وآخرون | المجلة: Biomolecules and Biomedicine | المجال: علم المناعة (Immunology)

تستخدم الدراسة تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة للتحقيق في تأثيرات علاج الخلايا الجذعية الميزانشيمية (MSC) على استقطاب البلعميات في نموذج فئري للإنتان. تكشف النتائج عن تحول كبير نحو استقطاب البلعميات الشبيهة بـ M2 بعد إعطاء MSC، مما يشير إلى أن MSC قد تلعب دورًا حاسمًا في تعديل الاستجابة المناعية خلال الإنتان. يتميز هذا الاستقطاب…
DRfold2 هو أداة تعتمد على التعلم العميق تمكن من التنبؤ بكفاءة ودقة بهيكل RNA

2026 | المؤلف: Yang Li وآخرون | المجلة: PLoS Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم البحث DRfold2، وهو إطار عمل جديد للتعلم العميق مصمم لتوقع بنية RNA من بيانات التسلسل. يدمج هذا الإطار نموذج لغة مركب RNA مدرب مسبقًا (RCLM) مع وحدة هيكلية لإزالة الضوضاء، مما يمكّن من التوقعات من البداية إلى النهاية. يتفوق DRfold2 بشكل كبير على الطرق الحالية الرائدة في كل من التوبولوجيا العالمية وتوقعات البنية الثانوية…
تغييرات النسخ الجيني في خلايا المناعة الدائرة لمرضى COVID-19 الحادين تتنبأ ببصمة أيضية وإيبيجينية محددة

2026 | المؤلف: Federico Virga وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)

تدرس الدراسة آليات الاستجابة المناعية التي تكمن وراء التقدم إلى COVID-19 الحاد من خلال تحليل النسخ الجيني لخلايا الدم المحيطية الوحيدة النواة (PBMCs) من مرضى يعانون من شدة متفاوتة في المرض. باستخدام بيانات من التجربة السريرية COntAGIouS ومجموعات بيانات RNA-seq والبروتيوم المستقلة، تحدد الأبحاث تغييرات كبيرة في الشبكات التنظيمية التي تشمل الميكروRNAs (miRNAs) وRNA غير…
رسم شامل لديناميات تعديل RNA والتواصل عبر التعلم العميق وتسلسل RNA المباشر باستخدام المسام النانوية

2026 | المؤلف: Han Dong وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم البحث ORCA (توصيف وتوضيح تعديل Omni-RNA)، وهو إطار عمل جديد للتعلم العميق مصمم لرسم خريطة مشهد تعديل RNA من خلال تسلسل RNA المباشر باستخدام تقنية النانو. يعالج هذا الإطار قيود الطرق الحالية من خلال تمكين الكشف والتقدير المتزامن لمختلف تعديلات RNA. يستخدم ORCA التعلم المعاكس للاستفادة من الاختلافات في الإشارة وتنوع التسلسل بين النيوكليوتيدات…