الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل RNA المباشر باستخدام نانو بورا
-
DirectRM: الكشف المتكامل عن المناظر الطبيعية والتداخل بين تعديلات RNA المتعددة باستخدام تسلسل RNA المباشر DirectRM: integrated detection of landscape and crosstalk between multiple RNA modifications using direct RNA sequencing
2026 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم DirectRM، أداة جديدة لتوصيف تعديلات RNA، تستفيد من تسلسل RNA المباشر عبر النانو بورت لاكتشاف ست تعديلات شائعة: N4-acetylcytidine، 1-methyladenosine، 5-methylcytidine، N7-methylguanosine، N6-methyladenosine، و pseudouridine. يستخدم DirectRM خط أنابيب من مرحلتين حيث يتم أولاً تحديد الكمرات المعدلة المرشحة من خلال مصنف ثنائي، يليه شبكة عصبية قائمة على الانتباه لتحديد التعديلات المحددة ومواقعها.…
-
فصل البيانات والعينات التكيفية المحددة بالباركود لتسلسل RNA المباشر عبر المسام النانوية Demultiplexing and barcode-specific adaptive sampling for nanopore direct RNA sequencing
2026 | المؤلف: Wiep van der Toorn وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في ورقة البحث، يناقش المؤلفون تكييف نموذج WarpDemuX مع كيمياء تسلسل RNA المباشر SQK-RNA004 التي أصدرتها Oxford Nanopore Technologies. تتميز هذه الكيمياء الجديدة بوجود مسام محددة لـ RNA وبروتين محرك أسرع، مما استلزم إجراء تعديلات على النموذج الحالي بسبب اختلاف خصائص الإشارة. قام المؤلفون بإنشاء مجموعات بيانات RNA004 باستخدام استراتيجية ترميز مزدوج وأعادوا تدريب نماذجهم،…
-
فك شفرة المشهد الإبيترانسكريبتومي m6A للتطبيقات البيوتكنولوجية باستخدام نهج تسلسل RNA المباشر Decoding the m6A epitranscriptomic landscape for biotechnological applications using a direct RNA sequencing approach
2026 | المؤلف: Chuwei Liu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم أهمية التعديلات الإيبيترانسكريبتومية، وخاصة N6-methyladenosine (m^6A)، في تنظيم التعبير الجيني من خلال آليات مثل استقرار RNA، والقص، والترجمة. تواجه الأساليب الحسابية التقليدية لاكتشاف m^6A من بيانات تسلسل RNA المباشر باستخدام Nanopore (DRS) قيودًا بسبب اعتمادها على تسميات تم التحقق منها تجريبيًا، مما يؤدي غالبًا إلى تقدير غير دقيق لمواقع التعديل. للتغلب على…