الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تصميم بروتين جديد
-
استخدام النتائج التجريبية لتصميم البروتينات لتوجيه تطوير دالة الطاقة الجزيئية الحيوية Using experimental results of protein design to guide biomolecular energy-function development
2026 | المؤلف: Hugh K. Haddox وآخرون | المجلة: PLoS Computational Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في قيود النماذج الحسابية للجزيئات الكبيرة، وخاصة تلك التي تستخدم دوال الطاقة المستندة إلى الميكانيكا الكلاسيكية، والتي غالبًا ما تعاني من عدم دقة فيزيائية بسبب نقص مجموعات بيانات التدريب المتنوعة. يقترح المؤلفون نهجًا جديدًا لتدريب دالة الطاقة الخاصة بروزيتا من خلال استخدامها لتصميم بروتينات جديدة، تليها التحقق التجريبي لتحديد أنماط فشل التصميم. سمح…
-
MechFind: إطار حسابي للتنبؤ من جديد بآليات الإنزيمات MechFind: a computational framework for de novo prediction of enzyme mechanisms
2026 | المؤلف: Austin D. Hartley وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم MechFind، وهو أداة حسابية مصممة لتوليد آليات إنزيمية افتراضية متوازنة من حيث العناصر والشحنات بناءً فقط على ستوكيومترية التفاعل، متجاوزة الحاجة إلى بيانات هيكلية. من خلال تجريد خطوات التفاعل ك تغييرات في الوحدات الكيميائية، يحدد MechFind أوصافًا آلية أكثر اقتصادية ويصنفها وفقًا لتشابهها مع الآليات المعروفة. تُظهر الأداة معدل استرداد يبلغ 72%…