الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تعديل RNA
-
DirectRM: الكشف المتكامل عن المناظر الطبيعية والتداخل بين تعديلات RNA المتعددة باستخدام تسلسل RNA المباشر DirectRM: integrated detection of landscape and crosstalk between multiple RNA modifications using direct RNA sequencing
2026 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم DirectRM، أداة جديدة لتوصيف تعديلات RNA، تستفيد من تسلسل RNA المباشر عبر النانو بورت لاكتشاف ست تعديلات شائعة: N4-acetylcytidine، 1-methyladenosine، 5-methylcytidine، N7-methylguanosine، N6-methyladenosine، و pseudouridine. يستخدم DirectRM خط أنابيب من مرحلتين حيث يتم أولاً تحديد الكمرات المعدلة المرشحة من خلال مصنف ثنائي، يليه شبكة عصبية قائمة على الانتباه لتحديد التعديلات المحددة ومواقعها.…
-
مشهد كمي للبيوريدين RNA يكشف أنماط تعديل ديناميكية والحفاظ التطوري عبر الأنواع البكتيرية Quantitative RNA pseudouridine landscape reveals dynamic modification patterns and evolutionary conservation across bacterial species
2026 | المؤلف: Letong Xu وآخرون | المجلة: eLife | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه الدراسة أول خريطة شاملة لتعديلات البسيدوريدين (Ψ) على مستوى النسخ في خمسة أنواع بكتيرية: *باسيلاس سيريوس*، *إشريشيا كولاي*، *كليبسيلا رئوية*، *مزودوموناس أيروجينوزا*، و*مزودوموناس سيرينغاي*. باستخدام طريقة BID-seq المحسّنة، حقق الباحثون دقة على مستوى القاعدة الواحدة في تحليلهم الكمي، مما كشف أن ديناميات البسيدوريديل في tRNA وmRNA البكتيرية تتأثر بمراحل النمو، وخاصة في الجينات…
-
Deep-m6Am: نموذج تعلم عميق لتحديد مواقع N6، 2′-O-Dimethyladenosine (m6Am) باستخدام ميزات هجينة Deep-m6Am: a deep learning model for identifying N6, 2′-O-Dimethyladenosine (m6Am) sites using hybrid features
2026 | المؤلف: Islam Uddin وآخرون | المجلة: AIMS bioengineering | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تركز الأبحاث على N6,2′-O-dimethyladenosine (m6Am)، وهو تعديل أساسي للـ RNA يؤثر على تعبير الجينات واستقرار الـ RNA. إن التعرف الدقيق على m6Am أمر حاسم لفهم الآليات الخلوية ومسارات الأمراض. يقدم المؤلفون Deep-m6Am، وهو نموذج تعلم عميق مصمم لتحديد مواقع m6Am في تسلسلات الـ RNA. يستخدم هذا النموذج استراتيجية شاملة لاستخراج الميزات تجمع بين التركيب الأحادي…