الأبحاث ضمن الموضوع : تقنيات البروتيوميات المتقدمة وتطبيقاتها
-
تحليل سريع وعميق للبروتينات الفوسفاتية باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral
2024 | المؤلف: Noah M. Lancaster وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم أهمية فسفرة البروتينات في العمليات الخلوية والتحديات المرتبطة بالكشف عنها وقياسها. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral، مع دمج اكتساب البيانات المستقل (DIA)، مما يسمح بتحليل سريع وشامل للفسفورومات في نماذج الإنسان والفأر. لقد نجحوا في رسم خريطة لحوالي 30,000 موقع فسفرة بروتيني فريد في غضون 30 دقيقة وكشفوا…
-
كوانتيمز: خط أنابيب قائم على السحابة للبروتيوميات الكمية يمكّن من إعادة تحليل بيانات البروتيوميات العامة
2024 | المؤلف: Chengxin Dai وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)إن الزيادة في حجم بيانات البروتيوميات العامة تقدم تحديات حسابية كبيرة لإعادة التحليل على نطاق واسع. لمعالجة ذلك، يقدم المؤلفون quantms، وهو خط أنابيب مفتوح المصدر قائم على السحابة مصمم لتحليل بيانات البروتيوميات بشكل متوازي بشكل كبير. باستخدام quantms، أعادوا تحليل 83 مجموعة بيانات عامة من ProteomeXchange، تشمل 29,354 ملف أداة من 13,132 عينة بشرية،…
-
تحسين تحليل التعبير التفاضلي لبيانات البروتيوميات من خلال قواعد عالية الأداء واستنتاج جماعي
2024 | المؤلف: Hui Peng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تستعرض هذه القسم دراسة شاملة تهدف إلى تحسين سير العمل لتحديد البروتينات المعبر عنها بشكل مختلف في علم البروتيوميات. يتكون سير العمل من خمس خطوات أساسية: قياس البيانات الخام، بناء مصفوفة التعبير، تطبيع المصفوفة، تقدير القيم المفقودة (MVI)، وتحليل التعبير التفاضلي (DEA). نظرًا للعدد الكبير من الطرق المتاحة في كل خطوة، فإن تحديد سير العمل…
-
تتيح تقنية One-Tip تغطية شاملة للبروتيوم في الخلايا الدنيا والزيجوت الفردية
2024 | المؤلف: Zilu Ye وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)التزمت الدراسة بجميع اللوائح الأخلاقية ذات الصلة، مما يضمن الامتثال للمعايير المعمول بها في أبحاث الحيوانات. على وجه التحديد، تم إجراء التجارب الحيوانية تحت رقم الترخيص 2021-15-0201-00851، الذي منحته الهيئة الوطنية الدنماركية لتجارب الحيوانات. اتبعت المنهجية التوجيهات الوطنية والمحلية للحفاظ على الاعتبارات الأخلاقية طوال عملية البحث. يقدم قسم “النتائج” نتائج الدراسة، مع تسليط الضوء على…
-
التحليل الشامل والمدهش وسرعة جهاز تحليل الكتلة الأستري للعينات المعقدة للغاية هو قفزة نوعية في التحليل الوظيفي للميكروبيومات
2024 | المؤلف: Thibaut Dumas وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)في هذا القسم، يناقش المؤلفون التقدم في الميتابروتيوميات، وهو مجال يركز على تحليل البروتينات لفهم المجتمعات الميكروبية ووظائفها داخل الأنظمة البيولوجية. يقدمون استراتيجية جديدة لتحديد هياكل المجتمعات الميكروبية بسرعة وإنشاء قواعد بيانات تسلسل البروتينات المخصصة التي تعزز تحليل بيانات مطياف الكتلة المتسلسل. تستخدم هذه الطريقة قدرات مطياف الكتلة من الجيل الأول Quadrupole Orbitrap المزود بمحلل…
