تستعرض هذه الفقرة التقدم في البروتيوميات الوظيفية التي تهدف إلى تعزيز فهمنا لآليات السرطان وتسهيل تحديد العلامات الحيوية والأهداف العلاجية الجديدة. أنشأ المؤلفون موردًا شاملاً يستخدم مصفوفات البروتين العكسية (RPPAs)، والتي تدمج البيانات من حوالي 8,000 عينة من المرضى من أطلس جينوم السرطان (TCGA) وحوالي 900 عينة من موسوعة خطوط خلايا السرطان (CCLE). تحتوي مجموعة…

تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في قياس الببتيدات والبروتينات من خلال الاستحواذ المستقل عن البيانات (DIA) في علم البروتيوميات باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة-مطيافية الكتلة (LC-MS/MS). يسلط الضوء على دمج فصل حركة الأيونات عبر تقنية diaPASEF على منصة timsTOF من Bruker، مما يعزز دقة القياس وتغطية البروتين. يقدم المؤلفون diaTracer، أداة حسابية مصممة لبيانات diaPASEF،…

تدرس هذه الدراسة تشكيل أغلفة البروتين على الجسيمات النانوية (NPs) وإمكاناتها في تعزيز تحليل بروتينات البلازما. من خلال إدخال جزيئات صغيرة مثل المستقلبات، والدهون، والفيتامينات، والمواد المغذية إلى البلازما، لاحظ الباحثون تغييرات كبيرة في أنماط أغلفة البروتين على الجسيمات النانوية من البوليمر. أسفرت هذه الطريقة عن اكتشاف 1793 بروتينًا، مما يمثل زيادة بمقدار 8.25 مرة…

اتبعت الدراسة جميع اللوائح المعنية بالمشاركين البشريين وتم تنفيذها بما يتماشى مع إعلان هلسنكي. تم الحصول على الموافقة لجمع واستخدام الأنسجة البشرية من لجنة الأخلاقيات المؤسسية في المستشفى الثاني التابع لجامعة تشجيانغ كلية الطب، وكذلك من لجنة الأخلاقيات في جامعة ويستليك. يضمن هذا الإشراف الأخلاقي أن البحث يتوافق مع المعايير المعمول بها لعلاج الموضوعات البشرية.…

تستعرض هذه القسم دراسة شاملة تهدف إلى تحسين سير العمل لتحديد البروتينات المعبر عنها بشكل مختلف في علم البروتيوميات. يتكون سير العمل من خمس خطوات أساسية: قياس البيانات الخام، بناء مصفوفة التعبير، تطبيع المصفوفة، تقدير القيم المفقودة (MVI)، وتحليل التعبير التفاضلي (DEA). نظرًا للعدد الكبير من الطرق المتاحة في كل خطوة، فإن تحديد سير العمل…