تشكيل مجموعة TCR من خلايا T الساذجة في تطور الإنسان TCR repertoire shaping of naïve T cell subsets in human ontogeny

شارك:
المجلة: Frontiers in Immunology، المجلد: 17
DOI: https://doi.org/10.3389/fimmu.2026.1738633
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41958674
تاريخ النشر: 2026-03-25
المؤلف: Mikhail Yu. Myshkin وآخرون
الموضوع الرئيسي: علم المناعة للخلايا التائية والخلايا البائية

نظرة عامة

تستكشف هذه الدراسة مجموعة مستقبلات الخلايا التائية (TCR) بيتا (TCRβ) عبر مجموعات خلايا T غير الناضجة المختلفة – CD4+ وCD8+ وخلايا T التنظيمية (Tregs) – من دم الحبل السري (UCB) في أعمار حمل مختلفة (24-42 أسبوعًا) وتقارنها مع عينات الدم المحيطي من الأطفال والبالغين وكبار السن. تكشف التحليلات أن مجموعات TCRβ من UCB تتميز بأطوال أقصر لمناطق تحديد التكامل 3 (CDR3) وزيادة في تقارب المجموعة وارتفاع انتشار الأنماط العامة، مما يشير إلى تنوع محدود في الوصلات خلال التطور المبكر.

يتم ملاحظة نضوج كبير في مجموعة TCRβ من UCB بحلول أواخر الحمل (~29 أسبوعًا)، مع ميزات مميزة في Tregs غير الناضجة المشتقة من UCB مقارنة بـ Tregs البالغة، مما يشير إلى تشكيل محدد للمجموعة لمجموعة TCRβ. بالإضافة إلى ذلك، يتم ملاحظة تحول يعتمد على العمر في هيكل مجموعة TCRβ، لا سيما في استخدام جينات مستقبلات الخلايا التائية بيتا المتغيرة (TRBV)، والتي تتوافق مع انخفاض تدريجي في القوة المتوقعة لارتباط CDR2 في Tregs غير الناضجة وCD8+ T cells. تعزز هذه النتائج فهمنا لتطور مجموعة TCRβ خلال تطور الإنسان وتبرز المسارات الفريدة لمجموعات خلايا T في الحياة المبكرة.

مقدمة

تناقش مقدمة ورقة البحث تطوير ونضوج الجهاز المناعي التكيفي البشري خلال الحمل، مع تسليط الضوء على أهميته من الناحيتين النظرية والعملية. توضح الانتقالات المتسلسلة لتكوين الدم من كيس المح إلى كبد الجنين ثم إلى نخاع العظام الجنيني، مشددة على أن الخلايا المناعية المستمدة مبكرًا توفر حماية شبيهة بالفطرية بينما تولد الموجات اللاحقة سلالات لمفاوية. يعتبر تشكيل واستعمار الغدة الصعترية بواسطة السلالات اللمفاوية حوالي 7-8 أسابيع من الحمل أمرًا حيويًا لتطوير خلايا T، مما يؤدي إلى تصدير خلايا T وظيفية بحلول 12-13 أسبوعًا. من الجدير بالذكر أن مجموعات خلايا T الجنينية، بما في ذلك خلايا T التنظيمية (Tregs) وCD4+ وCD8+ التقليدية، تظهر خصائص ظاهرة ووظيفية مميزة مقارنة بخلايا T البالغة، حيث تظهر خلايا CD4+ الجنينية ميلاً للتمايز إلى Tregs، وهو أمر ضروري للتسامح تجاه المستضدات الأمومية والذاتية.

تتوسع هذه الفقرة في تشكيل مجموعة مستقبلات الخلايا التائية (TCR) خلال التطور الجنيني، وهو أمر حاسم لوظيفة المناعة عند الولادة ويؤثر على الاستجابات المناعية مدى الحياة. يتم توليد تنوع TCR من خلال إعادة التركيب V(D)J، مما يؤدي إلى مجموعة واسعة من TCRs، مع تقديرات لسلاسل TCR بيتا الفريدة تصل إلى 10^8 إلى 10^9. خلال التطور الجنيني، تتميز مجموعات TCR بأطوال أقصر لمناطق تحديد التكامل 3 (CDR3) وانخفاض التنوع، الذي يزداد بشكل كبير بحلول أواخر الحمل. بعد الولادة، يميل تنوع TCR إلى الانخفاض مع تقدم العمر، حيث يظهر البالغون الأكبر سنًا عودة جزئية إلى ميزات مجموعة شبيهة بالجنين. تهدف الورقة إلى التحقيق في تشكيل ونضوج مجموعات TCRβ، لا سيما في مجموعات CD4+ غير الناضجة وCD8+ غير الناضجة وTreg غير الناضجة خلال التطور الجنيني والحياة المبكرة، مما يعزز الفهم لنضوج مجموعة المناعة الجنيني على مستوى TCR.

الطرق

تحدد فقرة “المواد والطرق” تصميم التجربة والإجراءات المستخدمة في الدراسة. توضح المواد المحددة المستخدمة، بما في ذلك أي مواد كيميائية ومعدات وعينات بيولوجية، لضمان إمكانية تكرار التجارب. تشمل المنهجية التقنيات المستخدمة لجمع البيانات وتحليلها، بما في ذلك أي طرق إحصائية تم تطبيقها لتفسير النتائج.

بالإضافة إلى ذلك، قد تصف الفقرة إعداد التجربة، بما في ذلك الضوابط والمتغيرات، لتوضيح كيفية معالجة أسئلة البحث. بشكل عام، تعتبر هذه الفقرة أساسًا حيويًا لفهم صحة وموثوقية النتائج المقدمة في الدراسة.

النتائج

في هذه الدراسة، أجرينا تحليلًا شاملاً لمجموعات مستقبلات الخلايا التائية (TCR) من خلايا CD8\(^+\) غير الناضجة وCD4\(^+\) غير الناضجة وخلايا T التنظيمية (T reg) المعزولة من دم الحبل السري (UCB) للمواليد في أعمار حمل مختلفة: مبكرًا قبل الأوان (<30 أسبوعًا) وولادة كاملة وولادة متأخرة. قارننا هذه المجموعات مع مجموعات خلايا T غير الناضجة المقابلة المأخوذة من عينات الدم المحيطي للأطفال والبالغين وكبار السن، باستخدام تحليل عميق لمجموعات TCR بيتا (TCRβ) لتقييم التنوع الوظيفي. تم جمع عينات UCB من مواليد تتراوح أعمارهم من 24 إلى 42 أسبوعًا من الحمل، مع مجموعات محددة تشمل مبكرًا قبل الأوان (N = 3؛ 25-29 أسبوعًا) وولادة كاملة (N = 6؛ 38-39 أسبوعًا) وولادة متأخرة (N = 4؛ 40-42 أسبوعًا). كان الهدف من هذا التحليل هو توضيح المسار التطوري لمجموعات خلايا T عبر أعمار مختلفة، مع تضمين مجموعات بيانات التسلسل المنشورة سابقًا لمقارنة أوسع عبر الفئات العمرية، بما في ذلك الأطفال والبالغين (20-35 سنة) وكبار السن (55-87 سنة). تسهم النتائج في فهمنا لتطوير خلايا T ونضوج الاستجابات المناعية في الحياة المبكرة.

المناقشة

في هذه الدراسة، بحث المؤلفون في مجموعات مستقبلات الخلايا التائية (TCR) من خلايا CD4+ وCD8+ وTregs غير الناضجة المعزولة من دم الحبل السري (UCB) وقارنوها مع عينات الدم المحيطي (PB) من أفراد بأعمار مختلفة. كانت إحدى النتائج الملحوظة هي الزيادة في تكرار الأنماط غير الوظيفية لمستقبلات TCRβ في UCB، مما قد يعكس تنظيم تطوري لانحلال mRNA غير المفيد (NMD). كشفت التحليلات أن مجموعات TCRβ قبل الأوان أظهرت أطوال CDR3 أقصر ونسبة أعلى من الأنماط ذات الإدخال الصفري، على الأرجح بسبب النشاط المحدود للديكسي نيوكليوتيديل ترانسفيراز (TdT) خلال الحمل المبكر. تشير هذه النمط إلى توقيع جزيئي مميز في مجموعات TCR قبل الأوان، يتميز بزيادة تقارب المجموعة ووجود أنماط عامة من المحتمل أن تتطابق مع الخصائص الفيروسية المعروفة.

علاوة على ذلك، سلطت الدراسة الضوء على التغيرات التطورية الكبيرة في خصائص مجموعة TCR، بما في ذلك استخدام أجزاء V والقوة المتوقعة لارتباط مناطق CDR، والتي وُجد أنها تؤثر على تفاعلات TCR-MHC. أشارت النتائج إلى أنه بينما تلعب الميزات المشفرة في الجينوم دورًا بارزًا في تشكيل مجموعات TCR خلال الحياة المبكرة، يصبح تأثير تنوع CDR3 أكثر وضوحًا بعد الولادة. خلص المؤلفون إلى أن الاختلافات الملحوظة في تنظيم مجموعة TCR ووظيفتها عبر مراحل التطور قد تكون لها آثار على فهم الاستجابات المناعية في الحياة المبكرة وعلى التطبيقات السريرية المحتملة التي تشمل Tregs المستمدة من UCB في علاج الأمراض المناعية.

Journal: Frontiers in Immunology, Volume: 17
DOI: https://doi.org/10.3389/fimmu.2026.1738633
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41958674
Publication Date: 2026-03-25
Author(s): Mikhail Yu. Myshkin et al.
Primary Topic: T-cell and B-cell Immunology

Overview

This study investigates the T cell receptor (TCR) beta (TCRβ) repertoire across various naïve T cell subsets—CD4+, CD8+, and regulatory T cells (Tregs)—from umbilical cord blood (UCB) at different gestational ages (24-42 weeks) and compares these to peripheral blood samples from children, adults, and older individuals. The analysis reveals that UCB TCRβ repertoires are characterized by shorter complementarity-determining region 3 (CDR3) lengths, increased repertoire convergence, and a higher prevalence of public clonotypes, indicating limited junctional diversity during early development.

Significant maturation of the UCB TCRβ repertoire is observed by late gestation (~29 weeks), with distinct features in UCB-derived naïve Tregs compared to adult Tregs, suggesting subset-specific shaping of the TCRβ repertoire. Additionally, an age-dependent shift in TCRβ repertoire structure is noted, particularly in the usage of T cell receptor beta variable (TRBV) genes, which correlates with a progressive decrease in the predicted binding strength of CDR2 in naïve Tregs and CD8+ T cells. These findings enhance our understanding of TCRβ repertoire development during human ontogeny and underscore the unique trajectories of T cell subsets in early life.

Introduction

The introduction of the research paper discusses the development and maturation of the human adaptive immune system during gestation, highlighting its significance both theoretically and practically. It outlines the sequential transitions of hematopoiesis from the yolk sac to the fetal liver and then to the fetal bone marrow, emphasizing that early-derived immune cells provide innate-like protection while later waves generate lymphoid progenitors. The formation and colonization of the thymus by lymphoid progenitors around 7-8 weeks of gestation is crucial for T cell development, leading to the export of functional T cells by 12-13 weeks. Notably, fetal T cell subpopulations, including regulatory T cells (Tregs) and conventional CD4+ and CD8+ T cells, exhibit distinct phenotypic and functional characteristics compared to adult T cells, with fetal CD4+ T cells showing a propensity to differentiate into Tregs, which is essential for tolerance to maternal and self-antigens.

The section further elaborates on the shaping of the T cell receptor (TCR) repertoire during fetal development, which is critical for immune function at birth and influences lifelong immune responses. The TCR diversity is generated through V(D)J recombination, resulting in a vast array of TCRs, with estimates of unique TCR beta chains reaching 10^8 to 10^9. During fetal development, TCR repertoires are characterized by shorter complementarity-determining region 3 (CDR3) sequences and reduced diversity, which increase significantly by late gestation. Postnatally, TCR diversity tends to decrease with age, with older adults showing a partial return to fetal-like repertoire features. The paper aims to investigate the formation and maturation of TCRβ repertoires, particularly in naïve CD4+, naïve CD8+, and naïve Treg subsets during fetal development and early life, thereby enhancing the understanding of fetal immune repertoire maturation at the TCR level.

Methods

The “Materials and Methods” section outlines the experimental design and procedures employed in the study. It details the specific materials used, including any reagents, equipment, and biological samples, ensuring reproducibility of the experiments. The methodology encompasses the techniques for data collection and analysis, including any statistical methods applied to interpret the results.

Additionally, the section may describe the experimental setup, including controls and variables, to clarify how the research questions were addressed. Overall, this section serves as a critical foundation for understanding the validity and reliability of the findings presented in the study.

Results

In this study, we conducted a comprehensive analysis of T cell receptor (TCR) repertoires from naïve CD8\(^+\), naïve CD4\(^+\), and naïve T regulatory (T reg) lymphocytes isolated from umbilical cord blood (UCB) of neonates at different gestational ages: early preterm (<30 weeks), term, and late-term. We compared these repertoires with corresponding naïve T cell subsets obtained from peripheral blood samples of children, adults, and older adults, utilizing deep TCR beta (TCRβ) repertoire profiling to assess functional diversity. The UCB samples were collected from neonates ranging from 24 to 42 weeks of gestation, with specific groups including early preterm (N = 3; 25-29 weeks), term (N = 6; 38-39 weeks), and late-term (N = 4; 40-42 weeks). This analysis aimed to elucidate the developmental trajectory of T cell repertoires across different ages, incorporating previously published sequencing datasets for a broader comparison across age groups, including children, adults (20-35 years), and older adults (55-87 years). The findings contribute to our understanding of T cell development and the maturation of immune responses in early life.

Discussion

In this study, the authors investigated the T cell receptor (TCR) repertoires of sorted naïve CD4+, CD8+, and regulatory T cells (Tregs) from umbilical cord blood (UCB) and compared them with peripheral blood (PB) samples from individuals of varying ages. A notable finding was the elevated frequency of non-functional TCRβ clonotypes in UCB, which may reflect developmental regulation of nonsense-mediated mRNA decay (NMD). The analysis revealed that preterm TCRβ repertoires exhibited shorter CDR3 lengths and a higher proportion of zero-insertion clonotypes, likely due to limited terminal deoxynucleotidyl transferase (TdT) activity during early gestation. This pattern suggests a distinct molecular signature in preterm TCR repertoires, characterized by increased repertoire convergence and the presence of public clonotypes that are more likely to match known viral specificities.

Furthermore, the study highlighted significant developmental changes in TCR repertoire characteristics, including V-segment usage and predicted binding strength of CDR regions, which were found to influence TCR-MHC interactions. The results indicated that while germline-encoded features play a prominent role in shaping TCR repertoires during early life, the influence of CDR3 diversity becomes more pronounced postnatally. The authors concluded that the observed differences in TCR repertoire organization and functionality across developmental stages could have implications for understanding immune responses in early life and for potential clinical applications involving UCB-derived Tregs in treating immune-mediated diseases.