رسم خرائط المواقع الجينية للسمات الكمية للهيتروسيس للسمات الشكلية للأوراق وتحديد الجينات المرشحة في الذرة Quantitative trait loci mapping of heterosis for leaf morphological traits and candidate gene identification in maize

شارك:
المجلة: BMC Plant Biology، المجلد: 26، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12870-025-08017-0
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41526813
تاريخ النشر: 2026-01-13
المؤلف: Xingyi Li وآخرون
الموضوع الرئيسي: التخطيط الجيني والتنوع في النباتات والحيوانات

نظرة عامة

تبحث الدراسة في الأساس الجيني لشكل الأوراق في الذرة، مع التركيز على الصفات التي تؤثر على كفاءة التمثيل الضوئي وإنتاج الحبوب. تم تطوير ستة تجمعات اختبار من خطوط هجين معادلة (RILs) باستخدام ثلاثة خطوط هجين تمثل مجموعات هتروتيك الرئيسية: سوان، ريد، وغير ريد. تم إجراء تحليل الجينوم عبر التسلسل الجيني، وتم إجراء تحليل الظواهر لوسط الأبوين من صفات هيكل الأوراق على مدى عامين في موقعين. أظهر تحليل الارتباط على مستوى الجينوم أن مجموعة ريد × غير ريد الهتروتيك أظهرت أكبر تأثيرات لمواقع الصفات الكمية (QTL) لطول الورقة (LL)، مع تباين ظاهري مفسر (PVE) قدره 23.31%. بالنسبة لعرض الورقة (LW) وزاوية الورقة (LA)، تم تحديد مواقع QTL مهمة أيضًا، لا سيما في مجموعة ريد × غير ريد، مع PVE قدره 32.32% و23.13%، على التوالي.

في المجموع، تم تحديد سبعة مواقع QTL مستقرة و14 جينًا مرشحًا، مع تحليل التعبير الجيني الذي يبرز ستة جينات متعددة التأثير، بما في ذلك Zm00001d022618 وZm00001d008625، كعوامل حاسمة لتنظيم الهتروتيك في شكل الأوراق. تعزز هذه النتائج الفهم للهتروتيك في الذرة وتوفر أهدافًا قيمة للتربية الدقيقة التي تهدف إلى تحسين هيكل النبات وزيادة الإنتاج.

مقدمة

تناقش مقدمة ورقة البحث أهمية الذرة كمحصول حبوب مزروع عالميًا، مع تسليط الضوء على هتروتيك القوي بسبب نظامها التناسلي المتقاطع وتنوعها الجيني. تحدد الأنماط الهتروتيكية الرئيسية في مناطق مختلفة، مثل ريد × لانكستر في المناطق المعتدلة وETO × توكسبيو في المناطق الاستوائية. تؤكد الورقة أنه بينما ركزت الأبحاث السابقة بشكل أساسي على الإنتاج وخصائص مكونات الإنتاج، فإن فهم الآليات وراء الهتروتيك في صفات شكل الورقة أمر بالغ الأهمية لتحسين إنتاج الذرة، لا سيما في سياق مرونة المناخ وأمن الغذاء.

يشير المؤلفون إلى أن صفات الأوراق، بما في ذلك طول الورقة (LL)، عرض الورقة (LW)، زاوية الورقة (LA)، وقيمة اتجاه الورقة (LOV)، ضرورية لتحسين هيكل النبات وزيادة كفاءة التمثيل الضوئي. يلخصون النتائج من دراسات مختلفة التي حددت أكثر من 1,000 موقع صفة كمية (QTL) مرتبطة بهذه الصفات، ومع ذلك يبرزون الفهم المحدود لمواقع QTL المتعلقة بالهتروتيك في صفات الأوراق. تهدف الورقة إلى معالجة هذه الفجوة من خلال استخدام تجمعات الهجين المتقدمة لاستكشاف مواقع QTL المرتبطة بالهتروتيك في شكل الأوراق عبر تنوع جينات الذرة، مما يمثل جهدًا منهجيًا لتعزيز إنتاج الحبوب من خلال الفهم الجيني لصفات الأوراق.

الطرق

في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون ثلاثة خطوط هجين تمثيلية من الذرة—Y46 (سوان)، Ye107 (ريد)، وMON2 (غير ريد)—لإنشاء تقاطعات ثنائية وتطوير ثلاثة تجمعات من خطوط الهجين المعادلة (RIL) F7 من خلال نزول البذور الفردية. من هذه التجمعات، تم اختيار خطوط عشوائيًا وإعادة تهجينها مع خطوطها الأبوية، مما أدى إلى توليد ستة تجمعات TC/M وTC/P، تتكون من إجمالي 807 خطوط.

يتميز Y46 بأنه خط هجين استوائي مشتق من سوان-1 في تايلاند، بينما Ye107 هو خط هجين معتدل الأصل من الهجين الأمريكي DeKalb XL80، الذي يعد أحد الآباء للهجين الصيني المستخدم على نطاق واسع Yedan 2. يُصنف MON2 ضمن مجموعة غير ريد، وهو خط هجين شبه استوائي تم تطويره من هجين تايلاندي معروف بنوع حبوبه شبه المسطحة. تهدف هذه الطريقة المنهجية إلى تعزيز الفهم للاختلافات الجينية والصفات داخل تجمعات الذرة.

النتائج

يقدم قسم “النتائج” من ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب أو التحليلات التي تم إجراؤها. عادةً ما يتضمن بيانات كمية، وتحليلات إحصائية، وتمثيلات بصرية مثل الرسوم البيانية أو الجداول التي توضح نتائج البحث. غالبًا ما تتم مقارنة النتائج مع الفرضيات أو الأهداف الموضوعة في المقدمة، مما يبرز ما إذا كانت البيانات تدعم أو تنفي هذه الادعاءات الأولية.

في هذا القسم، يتم مناقشة الاتجاهات أو الارتباطات أو الأنماط المهمة التي لوحظت في البيانات، جنبًا إلى جنب مع تداعياتها. يتم أيضًا تناول أي شذوذ أو نتائج غير متوقعة، مما يوفر نظرة شاملة على النتائج. تعتبر النتائج حاسمة لفهم التأثير الأوسع للبحث ولتوجيه الدراسات المستقبلية في هذا المجال.

المناقشة

في هذه الدراسة، أجرى المؤلفون تجارب ميدانية لتقييم صفات شكل الأوراق—طول الورقة (LL)، عرض الورقة (LW)، وزاوية الورقة (LA)—في ستة تجمعات من الذرة الاستوائية وشبه الاستوائية (TC/M وTC/P) عبر موقعين في مقاطعة يونان، الصين. أشارت النتائج إلى وجود اختلافات كبيرة في هذه الصفات بين التجمعات، حيث لعبت التأثيرات الأمومية دورًا حاسمًا في LL. من الجدير بالذكر أن تجمعات TC/M وTC/P المشتقة من مجموعة ريد × غير ريد الهتروتيك أظهرت قيم LL وLA متفوقة مقارنة بالمجموعات الأخرى، مما يشير إلى هتروتيك أقوى في هذا التركيب. أظهر التحليل أن العوامل الجينية، لا سيما التفاعل السائد والتفاعل الإيبيستاتيكي، تحكم هذه الصفات بشكل أساسي، مع ظهور مواقع الصفات الكمية (QTL) المحددة تأثيرات سائدة كبيرة على الهتروتيك.

حددت الدراسة ما مجموعه 1,027 موقع QTL لهتروتيك صفات شكل الورقة، مع وجود عدة مواقع QTL تتواجد معًا عبر صفات وبيئات مختلفة. من بين هذه، تم رسم سبعة مواقع QTL مستقرة، وتم التنبؤ بأن 14 جينًا مرشحًا قد تكون متورطة في الهتروتيك لهذه الصفات. أشارت تحليلات الإثراء الوظيفي إلى أن هذه الجينات المرشحة مرتبطة بعمليات بيولوجية حيوية مثل تنظيم النسخ ونقل الأوكسين، والتي تعتبر ضرورية لتطوير الأوراق. تؤكد النتائج على التعقيد الجيني الكامن وراء شكل الأوراق في الذرة وتبرز الإمكانية لاستخدام الجينات المرشحة المحددة في استراتيجيات التربية الدقيقة لتعزيز أداء هجن الذرة.

Journal: BMC Plant Biology, Volume: 26, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12870-025-08017-0
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41526813
Publication Date: 2026-01-13
Author(s): Xingyi Li et al.
Primary Topic: Genetic Mapping and Diversity in Plants and Animals

Overview

The research investigates the genetic basis of leaf morphology in maize, focusing on traits that influence photosynthetic efficiency and grain yield. Six testcross populations were developed from recombinant inbred lines (RILs) using three inbred lines representing major heterotic groups: Suwan, Reid, and Non-Reid. Genotyping was performed via genotyping-by-sequencing, and phenotyping for mid-parent heterosis of leaf architecture traits was conducted over two years at two locations. Genome-wide association analysis revealed that the Reid × Non-Reid heterotic group exhibited the largest quantitative trait loci (QTL) effects for leaf length (LL), with a phenotypic variance explained (PVE) of 23.31%. For leaf width (LW) and leaf angle (LA), significant QTLs were also identified, particularly in the Reid × Non-Reid group, with PVEs of 32.32% and 23.13%, respectively.

In total, seven stable QTLs and 14 candidate genes were identified, with gene expression analysis highlighting six pleiotropic genes, including Zm00001d022618 and Zm00001d008625, as crucial for regulating heterosis in leaf morphology. These findings enhance the understanding of heterosis in maize and provide valuable targets for precision breeding aimed at optimizing plant architecture and improving yield.

Introduction

The introduction of the research paper discusses the significance of maize as a globally cultivated cereal crop, highlighting its strong heterosis due to its outcrossing reproductive system and genetic diversity. It identifies key heterotic patterns in different regions, such as Reid × Lancaster in temperate areas and ETO × Tuxpeño in tropical regions. The paper emphasizes that while previous research has primarily focused on yield and yield-component traits, understanding the mechanisms behind heterosis in leaf morphological traits is crucial for improving maize production, particularly in the context of climate resilience and food security.

The authors note that leaf traits, including leaf length (LL), leaf width (LW), leaf angle (LA), and leaf orientation value (LOV), are essential for optimizing plant architecture and enhancing photosynthetic efficiency. They summarize findings from various studies that have identified over 1,000 quantitative trait loci (QTLs) associated with these traits, yet highlight the limited understanding of QTLs related to heterosis in leaf traits. The paper aims to address this gap by utilizing advanced backcross populations to explore QTLs linked to heterosis in leaf morphology across diverse maize germplasm, marking a systematic effort to enhance grain yield through the genetic understanding of leaf traits.

Methods

In this study, the authors utilized three representative maize inbreds—Y46 (Suwan), Ye107 (Reid), and MON2 (Non-Reid)—to create pairwise crosses and develop three recombinant inbred line (RIL) F7 populations through single-seed descent. From these populations, lines were randomly selected and backcrossed with their respective parental inbreds, resulting in the generation of six TC/M and TC/P populations, comprising a total of 807 lines.

Y46 is characterized as a tropical inbred line derived from Suwan-1 in Thailand, while Ye107 is a temperate inbred line originating from the American hybrid DeKalb XL80, which is a parent of the widely used Chinese hybrid cultivar Yedan 2. MON2, classified within the Non-Reid group, is a subtropical inbred line developed from a Thai hybrid known for its semi-dent grain type. This methodological approach aims to enhance the understanding of genetic variations and traits within maize populations.

Results

The “Results” section of the research paper presents the key findings derived from the conducted experiments or analyses. It typically includes quantitative data, statistical analyses, and visual representations such as graphs or tables that illustrate the outcomes of the research. The results are often compared against the hypotheses or objectives set forth in the introduction, highlighting whether the data supports or refutes these initial claims.

In this section, significant trends, correlations, or patterns observed in the data are discussed, along with their implications. Any anomalies or unexpected results are also addressed, providing a comprehensive overview of the findings. The results are crucial for understanding the broader impact of the research and for guiding future studies in the field.

Discussion

In this study, the authors conducted field experiments to assess leaf morphological traits—leaf length (LL), leaf width (LW), and leaf angle (LA)—in six populations of tropical and subtropical maize (TC/M and TC/P) across two locations in Yunnan Province, China. The results indicated significant variations in these traits among populations, with maternal effects playing a crucial role in LL. Notably, the TC/M and TC/P populations derived from the Reid × Non-Reid heterotic group exhibited superior LL and LA values compared to other groups, suggesting stronger heterosis in this combination. The analysis revealed that genetic factors, particularly dominance and epistatic interactions, primarily govern these traits, with identified quantitative trait loci (QTLs) showing significant dominant effects on heterosis.

The study identified a total of 1,027 QTLs for the heterosis of leaf morphological traits, with several QTLs co-localizing across different traits and environments. Among these, seven stable QTLs were mapped, and 14 candidate genes were predicted to be involved in the heterosis of these traits. Functional enrichment analyses indicated that these candidate genes are associated with critical biological processes such as transcription regulation and auxin transport, which are essential for leaf development. The findings underscore the genetic complexity underlying leaf morphology in maize and highlight the potential for utilizing identified candidate genes in precision breeding strategies to enhance maize hybrid performance.