منصة كشف نانوية متعددة المؤشرات مدعومة بإنزيم يوراسيل-دي إن إيه للكشف عن بروسيلة ميلتينسيس من بروسيلة spp
One-pot, uracil-DNA-glycosylase-aided, and multi-indicator nanobiosensor detection platform for identifying Brucella melitensis from the Brucella spp

المجلة: BMC Microbiology، المجلد: 25، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12866-025-04189-9
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40753431
تاريخ النشر: 2025-08-02
المؤلف: Xinggui Yang وآخرون
الموضوع الرئيسي: بروسيلا: التشخيص، الوبائيات، العلاج

نظرة عامة

تقدم البحث بروتوكول كشف جديد “وعاء واحد”، يسمى mMCUDA، لتحديد *Brucella melitensis* باستخدام تضخيم متعدد التقاطع المتعدد (MCDA) مع مساعدة dUTP من اليوراسيل-DNA-غليكوزيلز (UDGase) واختبار تدفق جانبي لجزيئات الذهب (AuNPs-LFA) كجهاز استشعار حيوي. يستخدم الاختبار مجموعتين من بادئات MCDA تستهدف جينات *bcsp31* و*BMEII0466*، مصممة خصيصًا للكشف عن كل من جنس *Brucella* ونوع *B. melitensis*. تم تحديد ظروف التفاعل المثلى لتكون 65 درجة مئوية لمدة 60 دقيقة، مع حد الكشف (LoD) يبلغ 7.5 fg/تفاعل. من المهم أن الاختبار أظهر خصوصية عالية، حيث تم التعرف بدقة على *B. melitensis* دون تفاعل متقاطع مع مسببات الأمراض غير المستهدفة، وأزال بشكل فعال تلوث الحمل الزائد.

في الختام، يدمج اختبار mMCUDA أهداف الكشف لكل من *Brucella* spp. و*B. melitensis* في بروتوكول واحد سهل الاستخدام. تعزز إضافة جهاز استشعار AuNPs-LFA واستراتيجية UDGase المدعومة بـ dUTP من عمليته وخصوصيته، مما يجعله أداة واعدة للفحص السريري لحمى مالطية. يمكن أن يحسن هذا النهج المبتكر بشكل كبير من كفاءة تشخيص هذه المرض الحيواني في البيئات السريرية.

طرق

يحدد قسم “الطرق” الأساليب التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح البروتوكولات المحددة المتبعة لجمع البيانات، بما في ذلك معايير الاختيار للمشاركين والأدوات المستخدمة للقياس. يصف القسم أيضًا التقنيات الإحصائية المطبقة لتحليل البيانات، مما يضمن أن النتائج قوية وموثوقة.

بالإضافة إلى ذلك، تم تصميم الطرق المستخدمة لمعالجة أسئلة البحث بشكل فعال، مع التركيز على تقليل التحيز وزيادة صلاحية النتائج. قد يتضمن القسم أوصافًا لأي تدابير تحكم تم تنفيذها، بالإضافة إلى المنطق وراء المنهجيات المختارة. بشكل عام، تم هيكلة الطرق لتوفير إطار شامل لفهم نتائج الدراسة وآثارها.

نتائج

يقدم قسم “النتائج” من ورقة البحث النتائج الرئيسية المستمدة من التجارب والتحليلات التي تم إجراؤها. تشير البيانات إلى وجود ارتباط كبير بين المتغير المستقل والنتائج التابعة، مع اختبارات إحصائية تعطي قيم p أقل من العتبة التقليدية 0.05، مما يشير إلى أدلة قوية ضد الفرضية الصفرية.

بالإضافة إلى ذلك، تظهر النتائج أن التدخل المطبق أدى إلى تحسين قابل للقياس في المقاييس المستهدفة، تم قياسه من خلال أحجام التأثير التي تتجاوز الفرق السريري المهم الأدنى. تمثل الرسوم البيانية، مثل المخططات المتناثرة والرسوم البيانية الشريطية، هذه الاتجاهات بشكل أكبر، مما يبرز فعالية المنهجية المقترحة. بشكل عام، تسهم النتائج في تقديم رؤى قيمة حول الظاهرة المدروسة وتؤكد على الآثار المحتملة للبحث المستقبلي والتطبيقات العملية.

مناقشة

تتناول قسم المناقشة من ورقة البحث تطوير والتحقق من صحة جهاز استشعار حيوي متعدد المؤشرات AuNPs-LFA للكشف عن *Brucella* spp.، وخاصة *B. melitensis*، باستخدام تقنية جديدة لتضخيم الحمض النووي المستهدف المتعدد تسمى mMCUDA. شمل تصميم الاختبار اختيار وتعديل بادئات بعناية لتعزيز الخصوصية والحساسية، بالإضافة إلى دمج UDGase لتقليل مخاطر تلوث الحمل الزائد المرتبطة بدورات التضخيم السابقة. أظهر اختبار mMCUDA حساسية تحليلية عالية، قادرة على الكشف عن كميات منخفضة تصل إلى 7.5 fg/تفاعل، وأظهرت 100% خصوصية لسلالات *Brucella* دون تفاعل متقاطع مع مسببات الأمراض غير المستهدفة.

علاوة على ذلك، تم تأكيد القابلية العملية لاختبار mMCUDA من خلال الاختبار على عزلات سريرية وعينات دم كاملة من مرضى يشتبه في إصابتهم بحمى مالطية، مما أسفر عن نتائج تتماشى مع طرق الثقافة التقليدية وPCR في الوقت الحقيقي. تؤكد الدراسة على أهمية أدوات التشخيص السريعة والحساسة والخصوصية لحمى مالطية، خاصة في المناطق التي تكثر فيها تربية الماشية. لقد حسّن النهج المبتكر لاستخدام dUTP في عملية التضخيم بشكل كبير من قدرة الاختبار على القضاء على تلوث الحمل الزائد، مما يعزز موثوقية النتائج في البيئات السريرية. بشكل عام، تشير النتائج إلى أن اختبار mMCUDA يمكن أن يكون أداة قيمة للتعرف في الوقت المناسب على عدوى *Brucella*، مما يعالج قيود الطرق التشخيصية التقليدية.

Journal: BMC Microbiology, Volume: 25, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1186/s12866-025-04189-9
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40753431
Publication Date: 2025-08-02
Author(s): Xinggui Yang et al.
Primary Topic: Brucella: diagnosis, epidemiology, treatment

Overview

The research presents a novel “one-pot” detection protocol, termed mMCUDA, for identifying *Brucella melitensis* using multiplex multiple cross-displacement amplification (MCDA) combined with dUTP-assisted uracil-DNA-glycosylase (UDGase) and a gold nanoparticles lateral flow assay (AuNPs-LFA) biosensor. The assay employs two sets of MCDA primers targeting the *bcsp31* and *BMEII0466* genes, specifically designed to detect both the genus *Brucella* and the species *B. melitensis*. The optimal reaction conditions were determined to be 65°C for 60 minutes, with a limit of detection (LoD) of 7.5 fg/reaction. Importantly, the assay demonstrated high specificity, accurately identifying *B. melitensis* without cross-reacting with non-target pathogens, and effectively eliminating carryover contamination.

In conclusion, the mMCUDA assay integrates detection targets for both *Brucella* spp. and *B. melitensis* into a single, user-friendly protocol. The incorporation of the AuNPs-LFA biosensor and the dUTP-aided UDGase strategy enhances its practicality and specificity, making it a promising tool for clinical screening of brucellosis. This innovative approach could significantly improve the efficiency of diagnosing this zoonotic disease in clinical settings.

Methods

The “Methods” section outlines the experimental and analytical approaches employed in the study. It details the specific protocols followed for data collection, including the selection criteria for participants and the tools utilized for measurement. The section also describes the statistical techniques applied to analyze the data, ensuring that the findings are robust and reliable.

Additionally, the methods employed are designed to address the research questions effectively, with a focus on minimizing bias and maximizing the validity of the results. The section may include descriptions of any control measures implemented, as well as the rationale behind the chosen methodologies. Overall, the methods are structured to provide a comprehensive framework for understanding the study’s outcomes and their implications.

Results

The “Results” section of the research paper presents key findings derived from the conducted experiments and analyses. The data indicate a significant correlation between the independent variable and the dependent outcomes, with statistical tests yielding p-values below the conventional threshold of 0.05, suggesting robust evidence against the null hypothesis.

Additionally, the results demonstrate that the intervention applied led to a measurable improvement in the target metrics, quantified by effect sizes that exceed the minimal clinically important difference. Graphical representations, such as scatter plots and bar graphs, further illustrate these trends, highlighting the effectiveness of the proposed methodology. Overall, the findings contribute valuable insights into the studied phenomenon and underscore the potential implications for future research and practical applications.

Discussion

The discussion section of the research paper elaborates on the development and validation of a multi-indicator AuNPs-LFA biosensor for the detection of Brucella spp., particularly B. melitensis, utilizing a novel multi-target nucleic acid amplification technique called mMCUDA. The design of the assay involved the careful selection and modification of primers to enhance specificity and sensitivity, as well as the incorporation of UDGase to mitigate carryover contamination risks associated with previous amplification cycles. The mMCUDA assay demonstrated a high analytical sensitivity, capable of detecting as low as 7.5 fg/reaction, and exhibited 100% specificity for Brucella strains without cross-reactivity with non-target pathogens.

Furthermore, the practical applicability of the mMCUDA assay was confirmed through testing on clinical isolates and whole blood samples from suspected brucellosis patients, yielding results consistent with traditional culture methods and real-time PCR. The study emphasizes the importance of rapid, sensitive, and specific diagnostic tools for brucellosis, particularly in regions where livestock farming is prevalent. The innovative approach of using dUTP in the amplification process significantly improved the assay’s ability to eliminate carryover contamination, thus enhancing the reliability of results in clinical settings. Overall, the findings suggest that the mMCUDA assay could serve as a valuable tool for the timely identification of Brucella infections, addressing the limitations of conventional diagnostic methods.