الأبحاث في مجلة: BMC Genomics
-
تكشف الميتوجينوميات المقارنة عن المحركات التطورية للديدان الخيطية من نوع Strongyloidea التي تعيش في الجهاز الهضمي
2025 | المؤلف: Junyan Li وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تبحث الدراسة في الجينوم الميتوكوندري للسوبر عائلة سترونجيلايد، وهي مجموعة هامة من الطفيليات المعوية التي تؤثر على المجترات والماشية. هذه الدراسة هي الأولى من نوعها التي تعيد بناء النشوء والتطور للسترونجيلايد وتفحص ديناميات الاختيار الخاصة بالموائل عبر موائل معوية مختلفة، وهي الكرش، الأمعاء الدقيقة، والأمعاء الغليظة. تكشف النتائج عن تجمعات نشوء قوية بين الأنواع، تتميز…
-
تحليل RNA-seq يحدد الجينات الرئيسية التي تعزز قوة الحافر لتحمل السباقات بدون حوافر في الخيول من سلالة ستاندردبريد
2025 | المؤلف: Doreen Schwochow وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: فرسي (Equine)تبحث الدراسة في الأساس الجيني لقوة الحافر في الخيول من نوع ستاندردبريد القادرة على السباق بدون حوافر، وهي ممارسة شائعة في صناعة سباقات الحبال السويدية. يعتمد المدربون غالبًا على الخبرة بدلاً من القياسات الموضوعية لتحديد ملاءمة الحصان للسباق بدون حوافر، مما قد يؤدي إلى مخاوف تتعلق بالرفاهية بسبب تآكل الحافر المفرط. لتقديم تقييم موضوعي، استخدمت…
-
scAMZI: مشفر تلقائي عميق قائم على الانتباه مع طبقة مضخمة للصفر لتجميع بيانات scRNA-seq
2025 | المؤلف: Lin Yuan وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث نموذج تعلم عميق جديد، scAMZI، مصمم لتجميع بيانات تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). يدمج هذا النموذج وحدة انتباه بسيطة (SimAM)، ومشفّر تلقائي، ونموذج سالب ثنائي متضخم بالصفر (ZINB)، بالإضافة إلى طبقة متضخمة بالصفر (ZI) للتعامل بفعالية مع التحديات المرتبطة ببيانات scRNA-seq، مثل أحداث التسرب والحاجة إلى دمج مرن للميزات الخلوية والعلاقات بين الخلايا.…
-
تحليل النسخ الجيني المقارن يكشف عن اختلافات في الاستجابات المناعية لأيونات النحاس في Sepia esculenta تحت ظروف درجات الحرارة العالية
2025 | المؤلف: Yancheng Zhao وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)تدرس الدراسة الاستجابات المناعية ليرقات *Sepia esculenta* لتعرضها للنحاس (Cu) تحت ظروف درجات حرارة متغيرة، باستخدام تقنيات النسخ الجيني. تشير النتائج إلى أن اليرقات المعرضة لكل من النحاس ودرجات الحرارة المرتفعة (مجموعة CuT) أظهرت زيادة ملحوظة في إثراء جينات عائلة ناقلات المحاليل (SLC) والجينات المرتبطة بتكرار الحمض النووي والتلف مقارنة بتلك المعرضة للنحاس فقط. سلط…
-
تحليلات GWAS ونسخ الجينوم تكشف أن ZmGRAS15 ينظم تحمل الجفاف وإطالة الجذور في الذرة
2025 | المؤلف: Dongmei Wang وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علوم النبات (Plant Science)تبحث هذه الدراسة في الآليات الجزيئية لتحمل الجفاف في الذرة، وهو عامل حاسم لنموها وتطورها تحت الضغط غير الحيوي. تستخدم الدراسة نموذجًا خطيًا مختلطًا (MLM) على 362 خطًا من الذرة، حيث تم تحديد 40 موضعًا مرتبطًا و150 جينًا مرشحًا مرتبطًا بمعدلات البقاء تحت ظروف الجفاف. بالإضافة إلى ذلك، كشفت تحليل النسخ الجيني لخطوط تحمل الجفاف…
-
الآليات التي تفسر تكيف الطحالب الكبيرة (Saccharina japonica) مع درجات حرارة مياه البحر المرتفعة نسبيًا
2025 | المؤلف: Li Guo وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم المحيطات (Oceanography)تظهر الأبحاث حول *Saccharina japonica*، وهي نوع من الطحالب البحرية المزروعة في الصين منذ ما يقرب من قرن، تكيّفات كبيرة مع ارتفاع درجات حرارة مياه البحر، التي زادت بمقدار 14 درجة مئوية و8 درجات مئوية في المناطق الشمالية والجنوبية على التوالي. للتحقيق في الآليات الأساسية لهذا التكيف، قامت الدراسة بتسلسل الجينومات لكل من الأمشاج الأنثوية…
-
استراتيجيات جينومية لتسهيل التربية لزيادة محتوى β-غلوكان في الشوفان (Avena sativa L.)
2025 | المؤلف: Sumandeep K. Bazzer وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تبحث الدراسة في السيطرة الجينية على محتوى β-glucan في الشوفان سداسي الصبغيات (Avena sativa L.)، وهو محصول حبوب معروف بفوائده الصحية، خاصة في الوقاية من الأمراض القلبية الوعائية. باستخدام دراسة ارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) على 1,230 خط تربية من برنامج تربية الشوفان في جامعة ولاية داكوتا الجنوبية، حددت الدراسة مواقع جينية مهمة مرتبطة بمحتوى…
-
التجميع من جديد لجينوم الميتوكوندريا لنبات الجذور العرقية وتحديد نوعين من تكوينات إعادة التركيب المتماثلة الناتجة عن تسلسلات متكررة
2025 | المؤلف: Guang Yu Zhou وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)في هذه الدراسة، تم تجميع وتوضيح الجينومات الميتوكوندرية والكلوروبلاستية لنبات *Glycyrrhiza glabra*، وهو نبات طبي بارز، بنجاح باستخدام تقنيات تسلسل القراءة القصيرة (Illumina) والطويلة (Oxford Nanopore). وُجد أن الجينوم الميتوكوندري له هيكل دائري يمتد على 421,293 قاعدة مع محتوى GC يبلغ 45.1%، ويحتوي على 56 جينًا موضحًا. كانت إحدى النتائج المهمة هي تحديد 514 تسلسلًا…
-
vSNP: خط أنابيب SNP لتوليد مصفوفات SNP الشفافة وأشجار النشوء والتطور من مجموعات بيانات تسلسل الجينوم الكامل
2024 | المؤلف: Jessica Hicks وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تعتبر أنبوب vSNP أداة متخصصة تم تطويرها على مدار العقد الماضي لمعالجة التحديات الفريدة التي تواجهها المختبرات التشخيصية أثناء التحقيقات في تفشي الأمراض. تسهل تسلسل الجينوم الكامل بسرعة وتضمن التحقق من دقة التسلسل والتحقق منها عبر مختلف مسببات الأمراض. ينتج الأنبوب مخرجات سهلة الاستخدام، بما في ذلك مصفوفات SNP والأشجار النشوء والتطور، والتي تم تصميمها…
-
يظهر النسخ الجيني الأدوار والآليات المحتملة لـ lncRNAs في تنظيم مقاومة الألبندازول في Haemonchus contortus
2024 | المؤلف: Xindi Chen وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تستكشف هذه الدراسة الآليات الجزيئية الكامنة وراء مقاومة الألبندازول (ABZ) في الدودة الطفيلية هيمونشوس كونتورتوس، والتي تشكل تحديات كبيرة في إدارة صحة المجترات. من خلال تسلسل النسخ الجينية لكل من السلالات الحساسة لـ ABZ والسلالات المقاومة، حدد الباحثون 276 RNA غير مشفر طويل معبر عنه بشكل مختلف (DElncRNAs) تلعب أدوارًا حاسمة في تنظيم مقاومة الأدوية.…
