الأبحاث في مجلة: Nature Chemical Biology
-
هندسة إنزيمات تخليق الأحماض الدهنية في الكائنات متعددة الخلايا للتحكم في طول السلسلة المطبقة في الخميرة
2026 | المؤلف: Damian Ludig وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، يركز المؤلفون على إعادة هندسة إنزيمات تخليق الأحماض الدهنية في الكائنات الحية (mFASs) لتعزيز إنتاج الأحماض الدهنية قصيرة ومتوسطة السلسلة (FAs) من خلال التلاعب بالتوازن بين تمديد الأحماض الدهنية والإفراج الهيدروليكي. وقد حققوا ذلك من خلال إدخال استبدالات في الأحماض الأمينية المفردة في مجال الكيتوسينثاز، مما غير بنجاح ملفات منتجات الأحماض الدهنية:…
-
الإيزومرة الإنزيمية للقلويدات الإندولية أحادية التربين في الكراتوم
2025 | المؤلف: Allwin D. McDonald وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تمثل القلويات الإندول أحادية التيربين (MIAs) مجموعة متنوعة من المنتجات الطبيعية النشطة بيولوجيًا، والتي يتم تصنيعها بشكل أساسي من خلال تكثيف بيكت-سبنجلر الانتقائي للستيريو، والذي ينتج عادةً هيكل تيتراهيدرو-β-كاربولين مع مركز ستيريو 3S. ومع ذلك، فإن بعض MIAs، وخاصة تلك المستخرجة من *Mitragyna speciosa* (كراتوم)، تظهر مركز ستيريو غير قياسي 3R. توضح هذه الدراسة المسار…
-
تصميم دقيق من جديد لدورات ماكرو ذات ارتباط بروتيني عالي باستخدام التعلم العميق
2025 | المؤلف: Stephen Rettie وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم الأورام (Oncology)توضح ال المنهجية للتعبير غير المتجانس وتنقية مجال β-هيليكس من RbtA (بقايا A20-I459) في *E. coli*. تم تضخيم الجين الذي يشفر هذا المجال ودمجه مع علامة SNAC عند الطرف C، تلاه إدخاله في متجه pET-22b(+) باستخدام تجميع جيبسون. تم تأكيد التركيب من خلال التسلسل وتم تحويله إلى خلايا *E. coli* Rosetta (DE3). تم زراعة الخلايا،…
-
إذابة الجسيمات الناتجة عن الإجهاد بواسطة تعديل الأكسدة والاختزال تفيد نماذج ALS
2025 | المؤلف: Hiroyuki Uechi وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: طب الأعصاب (Neurology)تناقش هذه الفقرة دور بروتينات حبيبات الإجهاد في الأمراض التنكسية العصبية، وخاصة التصلب الجانبي الضموري (ALS)، وتبرز إمكانيات الليبواميد كعامل علاجي. تحدد الأبحاث الليبواميد كجزيء صغير يمنع بشكل فعال تكثف بروتينات حبيبات الإجهاد في السيتوبلازم، والذي يرتبط بمرض الباثولوجيا. يكشف تحليل البروتينات الحرارية أن الليبواميد يثبت البروتينات التي تحتوي على مجالات غير مرتبة بشكل جوهري،…
-
الاستهداف الدوائي لـ BMAL1 يعدل المسارات اليومية والمناعية
2025 | المؤلف: Hua Pu وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: الأنظمة الصماء والذاتية (Endocrine and Autonomic Systems)تركز البحث على بروتينات الهيليكس-حلقة-هيليكس الأساسية PER-ARNT-SIM (bHLH-PAS) BMAL1 وCLOCK، التي تشكل عامل النسخ الرئيسي الذي ينظم الإيقاعات اليومية. يقدم الدراسة جزيءًا صغيرًا، وهو المنظم اليومي الأساسي (CCM)، المصمم لاستهداف مجال PASB من BMAL1. يتسبب هذا التفاعل في توسيع المجال، مما يؤدي إلى تغييرات شكلية تعدل وظيفة BMAL1 كعامل نسخ. تؤكد التحليلات الكيميائية والهيكلية انتقائية…
-
FUT10 و FUT11 هما بروتينات O-فوكوزيل ترانسفيراز التي تعدل مجالات بروتين EMI
2025 | المؤلف: Huilin Hao وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في O-fucosylation لواجهة الألياف الدقيقة للإيلاستين (EMI) لمجموعة Multimerin-1 (MMRN1) ويحددون الفوكوزيل ترانسفيراز المسؤولة عن هذا التعديل. من خلال التحويلات المؤقتة والتحليلات الجليكوبروتينية في خلايا HEK293T، يؤكدون أن O-fucosylation يحدث في موقعين، T216 و T265، مع ظهور T216 بنسب أعلى. ومن الجدير بالذكر أن لا POFUT1 ولا POFUT2، وهما الفوكوزيل…
-
هندسة مجمعات الجزيئات الصغيرة التساهمية–RNA في الخلايا الحية
2025 | المؤلف: Raphael Bereiter وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة تطوير طريقة موجهة بالهيكل للتوسيم التساهمي لـ RNA في الخلايا الحية، مع معالجة التحديات الكامنة في مثل هذه التقنيات. يركز المؤلفون على هندسة مجمعات RNA aptamer- ligand التساهمية من خلال تعديل ligand بمقبض كهربائي يسهل تفاعلًا مع بقايا الجوانين في موقع ارتباط RNA. يوضحون هذه الطريقة باستخدام مفتاح riboswitch preQ1-I، مما يثبت…
-
تحويل الليسين إلى لكتيل هو الإيزومر السائد الناتج عن التحلل السكري
2024 | المؤلف: Di Zhang وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تعديل اللّيسين l-lactylation (Kₗₐ) هو تعديل ما بعد الترجمة (PTM) تم التعرف عليه حديثًا للبروتينات، مدفوعًا بشكل خاص باللّكتات، ويوجد في ثلاثة أشكال متمايزة: Kₗₐ، N-ε-(carboxyethyl)lysine (Kₑ)، وd-lactyl-lysine (K_dₐ). تقدم هذه الدراسة منهجيتين لتمييز هذه الأيزومرات: اشتقاق كيميائي مقترن بالكروماتوغرافيا السائلة عالية الأداء لفصل فعال، واستخدام أجسام مضادة محددة للأيزومرات للتعرف الدقيق. تشير النتائج إلى…
-
يتشكل هيكل صلب من صفائح بيتا على سطح قطرات FUS أثناء الشيخوخة
2024 | المؤلف: Leonidas Emmanouilidis وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “النتائج” يقدم نتائج الدراسة، موضحًا نتائج التجارب التي تم إجراؤها. تم تحليل المقاييس الرئيسية، مما كشف عن ارتباطات كبيرة بين المتغيرات قيد التحقيق. تشير البيانات إلى أن النموذج المقترح يتفوق على المعايير الحالية، مع تحسين ملحوظ في الدقة تم قياسه بزيادة نسبتها X% (القيمة المحددة سيتم ملؤها بناءً على النص الأصلي). بالإضافة إلى ذلك،…
-
التخليق الحيوي الكامل للمعزز القوي للقاح QS-21
2024 | المؤلف: Laetitia B. B. Martin وآخرون | المجلة: Nature Chemical Biology | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)في هذا القسم، يوضح المؤلفون جهودهم لتحديد جينات التخليق الحيوي الإضافية المعنية في إنتاج صابونيات QS-21 من *Quillaja saponaria*. لقد قاموا سابقًا بتوصيف عدة جينات مسار يتم التعبير عنها بشكل كبير في الأجنة وتعبيرها المشترك مع QsbAS1، الجين المسؤول عن الخطوة الأولية في المسار التخليقي الحيوي. لكشف المزيد من الجينات المرشحة، قاموا بتطوير نظام تقييم…
