الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: أتمتة سير العمل
-
Frag’n’Flow: سير عمل آلي للبروتيوميات الكمية على نطاق واسع في بيئات الحوسبة عالية الأداء Frag’n’Flow: automated workflow for large-scale quantitative proteomics in high performance computing environments
2026 | المؤلف: István Szepesi-Nagy وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تقدم البحث Frag’n’Flow، وهو خط أنابيب قائم على Nextflow مصمم لتعزيز تحليل مجموعات بيانات البروتيوميات القائمة على مطياف الكتلة على نطاق واسع. الطرق التقليدية، مثل FragPipe، فعالة في تحديد الببتيدات عبر أوضاع تحضير العينات المختلفة وطرق الاكتساب (DDA، DIA، TMT)، لكنها تواجه صعوبات في قابلية التوسع وغالبًا ما تتطلب تكوينًا يدويًا. يقوم Frag’n’Flow بأتمتة إنشاء…
-
SimplySQS: سير عمل آلي وقابل للتكرار لتوليد هيكل كوازيراندوم خاص باستخدام ATAT SimplySQS: An automated and reproducible workflow for special quasirandom structure generation with ATAT
2026 | المؤلف: M. Lebeda وآخرون | المجلة: Journal of Computational Science | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)تقدم البحث SimplySQS، وهو سير عمل آلي مصمم لتعزيز توليد وتحليل الهياكل شبه العشوائية الخاصة (SQS) باستخدام وحدة ATAT mcsqs. تعمل هذه المنصة عبر الإنترنت على تبسيط عملية توليد SQS من خلال توجيه المستخدمين خلال الخطوات الأساسية مثل استيراد الهيكل، وتعريف التركيب، واختيار معلمات الكتلة. من خلال أتمتة إنشاء ملفات الإدخال ونصوص التنفيذ، تقلل SimplySQS…