الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ارتباط بروتين البلازما
-
تحديد قوة ارتباط البروتين-الليغاند العالمية عبر الوسم الضوئي
2026 | المؤلف: Charles David Warren وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)تقدم هذه القسم نظرة عامة على منصة جديدة تُدعى خريطة الألفة، مصممة لتعزيز تحديد وقياس تفاعلات البروتين-الليغاند، والتي تعتبر حاسمة لفهم تأثيرات الأدوية وانتقائيتها. تتضمن الطرق التقليدية لتقييم هذه التفاعلات عادةً تحليلات نوعية لبيانات الأوميكس تليها قياسات كمية لمدى الارتباط باستخدام بروتينات نقية أو أنظمة مهندسة. ومع ذلك، غالبًا ما تفتقر هذه الأساليب إلى القدرة…
-
بروتين النوكليوكابسيد لفيروس SARS-CoV-2 يشكل مجمعات مع بروتينات تنظيم المكمل القابلة للذوبان التي يمكن أن ترتبط بالفيروس
2026 | المؤلف: Jakub Víglaský وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)تدرس الدراسة التفاعل بين بروتين النوكليوكابسيد لفيروس SARS-CoV-2 ونظام المكمل، مع التركيز بشكل خاص على بروتينات تنظيم المكمل (CRPs). وُجد أن بروتين النوكليوكابسيد موجود في بلازما مرضى COVID-19 وأن مستوياته تت correlates مع شدة المرض. على عكس بروتين السنبلة، يرتبط بروتين النوكليوكابسيد بعدة بروتينات تنظيم المكمل، بما في ذلك مثبط C1، وبروتين ربط C4، والعامل…
-
المحددات الجزيئية لارتباط Smc5/6 مع تقاطعات الحمض النووي
2026 | المؤلف: Jeremy Chang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)مجمع Smc5/6 ضروري لصيانة الجينوم، حيث يتفاعل مع أشكال مختلفة من الحمض النووي، بما في ذلك الحمض النووي مزدوج الشريطة (ds) والحمض النووي أحادي الشريطة (ss). تستخدم هذه الدراسة تقنيات الجزيئات الفردية للتحقيق في ديناميات ارتباط Smc5/6 بركيزة dsDNA تحتوي على فجوة ssDNA محددة. تكشف النتائج أن Smc5/6 يرتبط بشكل تفضيلي مع الوصلات 3′ مقارنة…
-
التثبيط الذاتي بين المونومرات لـ HEXIM1 يتحكم في خصوصية ارتباط RNA 7SK وتفعيل P-TEFb
2026 | المؤلف: Yuan Yang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الفيروسات (Virology)تلعب بروتينات Hexim دورًا حاسمًا في تنظيم النسخ حقيقيات النوى من خلال احتجاز وتفعيل كيناز P-TEFb (Cdk9-CyclinT1/2) عبر مركب الريبونوكليوبروتين 7SK (RNP). يعتبر P-TEFb ضروريًا لإطلاق RNA polymerase II من التوقف القريب من المحفز، وهو أمر حيوي لكل من النسخ حقيقيات النوى وHIV-1. تتناول الدراسة الآلية الجزيئية غير المحلولة التي تتغلب من خلالها ارتباط 7SK…
-
يقيّد EPOP استهداف PRC2.1 للكروماتين من خلال تعديل تفاعل إنزيمات الديمر مباشرة
2026 | المؤلف: Lihu Gong وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث الدراسة في دور الوحدة الفرعية المساعدة EPOP ضمن المركب الكابح Polycomb 2 (PRC2)، مع التركيز بشكل خاص على وظيفتها في الهولوكومبلكس PRC2.1. على عكس الوحدات الفرعية المساعدة الأخرى التي تسهل استهداف PRC2، يبدو أن EPOP تلعب دورًا مثبطًا من خلال التأثير مباشرة على حالة أوليغوميراز PRC2.1. تكشف الدراسة أن EPOP تعطل ثنائي الشكل PRC2.1،…
-
خصائص الربط الغشائي المميزة للنوعين غير البصريين من الأريستين
2026 | المؤلف: Thomas D. Killeen وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تتناول هذه القسم من ورقة البحث التفاعلات الغشائية التي تنظم تنشيط الأريستين وارتباطه بمستقبلات البروتين المرتبطة بجزيئات G (GPCRs) المثيلة. يستخدم المؤلفون مجموعة من الطرق الفيزيائية الحيوية في المختبر وتحليل تقلبات شدة الفلورسنت المعتمدة على الخلايا لمقارنة خصائص ارتباط الغشاء لأنواع الأريستين غير البصرية، الأريستين-2 والأريستين-3. تكشف الدراسة أن الأريستين-2 لديه affinity أعلى للغشاء الغني…
-
التخليق، الربط، تقييم SAR وADMET لمشتقات جديدة من البيرولوبيرازول-4،6-ديون
2026 | المؤلف: Yasser H. Zaki وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: الكيمياء العضوية (Organic Chemistry)في هذه الدراسة، تم تخليق مشتقات جديدة من 1،6a-ديهيدروبيرولوا[3،4-c]بايرازول-4،6(3aH،5H)-ديون من خلال تفاعل بروميدات هيدرازونيل مع N-أريلمايلاميد، تلاها أكسدة لإنتاج بيرولوا[3،4-c]بايرازول-4،6(1H،5H)-ديونات. أظهرت دراسات الربط الجزيئي ضد البروتين المستهدف (PDB ID: 4N9S) أن المركبات 3c و 4c لها أعلى تقارب ربط بمقدار -7.45 و -7.31 كيلو كالوري/مول، على التوالي. شكلت هذه المركبات تفاعلات مستقرة من نوع π-كاتيون…
-
آلية تجنيد العملاء لتجميع مجموعة الحديد-الكبريت السيتوزولية المستهدفة
2026 | المؤلف: Wenjie Ren وآخرون | المجلة: The EMBO Journal | المجال: الطاقة المتجددة والاستدامة والبيئة (Renewable Energy, Sustainability and the Environment)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في الآليات التي من خلالها تكتسب بروتينات الحديد-الكبريت (Fe-S) حيوية في السيتوسول والنواة عواملها المساعدة الأساسية من خلال التفاعل مع مركب استهداف تجميع الكتلة الحديدية-الكبريتية في السيتوسول (CTC). يحددون نمط ببتيد خماسي متسق يعمل كعلامة تسلسلية حاسمة لغالبية بروتينات Fe-S البشرية المعروفة، وخاصة تلك المعنية في معالجة الحمض النووي/الحمض النووي…
-
اكتشاف الركيزة الخاصة بإنزيم TRIM2 E3 يكشف عن تنظيم الزنك لـ TMEM106B في المسار الداخلي الليزوزومي
2026 | المؤلف: Cecilia Perez-Borrajero وآخرون | المجلة: EMBO Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث الدراسة في دور TRIM2، وهو إنزيم E3 ليغاز الثدييات الذي يتم التعبير عنه بشكل كبير في خلايا بوركينجي العصبية، في تطوير الخلايا العصبية والحفاظ على توازنها. تتناول الدراسة التحدي المتمثل في تحديد الأهداف الخلوية لإنزيمات E3 الليغاز بسبب الطبيعة العابرة لمجمعات الإشارات. باستخدام أداة جديدة لتسمية القرب المحددة باليوبيكويتين، تمكن المؤلفون من تحديد ركائز…
-
إنشاء أدوية الأورام المعتمدة من إدارة الغذاء والدواء كمثبط لـ GPR176 من خلال نمذجة التماثل، والربط الجزيئي، وMMGBSA، وDFT، ومحاكاة الديناميكا الجزيئية
2026 | المؤلف: Felix Oluwasegun Ishabiyi وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)بروتين GPR176، وهو بروتين غشائي خلوي مرتبط بمختلف الأمراض البشرية، وخاصة السرطانات، تم تحديده كعامل مهم في تكوين الأورام بسبب زيادة تعبيره. تبحث هذه الدراسة في إمكانية إعادة استخدام الأدوية المعتمدة من إدارة الغذاء والدواء الأمريكية كمثبطات لـ GPR176، مستفيدة من أدوات المعلوماتية الحيوية الهيكلية لتقييم فعاليتها. من خلال نمذجة التشابه لتحديد الهيكل ثلاثي الأبعاد…