الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: استنتاج شبكة تنظيم الجينات
-
تقييم منهجي لقابلية تفسير نموذج الخلية الواحدة: درجات الحافة المستمدة من الانتباه لا تضيف قيمة إضافية على ميزات مستوى الجين لتوقع الاستجابة المستهدفة
2026 | المؤلف: Ihor Kendiukhov | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقيّم الورقة البحثية فعالية أنماط الانتباه في نماذج الأساس أحادية الخلية، مثل scGPT و Geneformer، لاستنتاج الشبكات التنظيمية الجينية (GRNs). على الرغم من أن درجات الحواف المستمدة من الانتباه تُفسر كبدائل للعلاقات التنظيمية، تكشف الدراسة أن هذه الأنماط لا تلتقط بشكل موثوق الإشارات التنظيمية السببية. من خلال إطار شامل يتضمن سبعة وثلاثين تحليلًا و153 اختبارًا…
-
SPSID: انكماش عكسي بمعامل واحد لتقليل الضوضاء في الشبكات التنظيمية الجينية
2026 | المؤلف: Hao Chen وآخرون | المجلة: IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم إطار عمل جديد، SPSID (تقلص المعامل الواحد العكسي)، مصمم لتعزيز استنتاج الشبكات التنظيمية الجينية (GRNs) من بيانات التعبير من خلال معالجة التحديات التي تطرحها الضوضاء الهيكلية والارتباطات الانتقالية. غالبًا ما تؤدي هذه التفاعلات غير المباشرة إلى عدم دقة في تحديد العلاقات التنظيمية الحقيقية، مما يؤدي إلى ارتفاع معدل الإيجابيات الكاذبة. يستخدم SPSID…
-
طرق تعلم الآلة لاستنتاج الشبكات التنظيمية الجينية
2026 | المؤلف: Akshata Hegde وآخرون | المجلة: Briefings in Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)شبكات تنظيم الجينات (GRNs) هي أنظمة معقدة تحكم التعبير الجيني استجابةً لمجموعة متنوعة من الإشارات البيئية والتنموية. لقد عززت التقدمات الأخيرة في علم الأحياء الحاسوبي والتسلسل عالي الإنتاجية دقة استنتاج ونمذجة GRN. أصبح دمج الذكاء الاصطناعي، وخاصة تقنيات التعلم الآلي مثل التعلم الخاضع للإشراف، والتعلم غير الخاضع للإشراف، والتعلم شبه الخاضع للإشراف، والتعلم التبايني، محورياً…