الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الترانسكريبتوميات المكانية
-
علم الأحياء الجزيئي على مستوى الخلية الواحدة المكاني: رؤى جديدة حول أمراض الكبد Spatial single-cell omics: new insights into liver diseases
2026 | المؤلف: Yuan Suo وآخرون | المجلة: Gut | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)البنية الدقيقة المعقدة للكبد ضرورية لوظائفه الأيضية والمناعية المتعددة الأوجه، والانقطاعات في هذه البنية شائعة في أمراض الكبد. تسمح التقدمات الحديثة في تقنيات الأوميكس المكانية بفحص مفصل لبروتيوم الكبد وترانسكريبتومه وميتابولومه بدقة قريبة من مستوى الخلية الواحدة وتحت الخلوية. تعزز هذه البعد المكاني فهمنا لفيزيولوجيا الكبد والآليات الجزيئية المعنية في أمراض الكبد، مما يسهل تحديد…
-
ارتفاع سرطان الثدي الثلاثي السلبي: الاكتشافات وما بعدها Triple-Negative Breast Cancer on the Rise: Breakthroughs and Beyond
2026 | المؤلف: Alex M. Agelidis وآخرون | المجلة: Breast Cancer Targets and Therapy | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)تتناول المراجعة الطبيعة العدوانية وزيادة حدوث سرطان الثدي الثلاثي السلبي (TNBC)، لا سيما بين النساء الأصغر سناً، مع تسليط الضوء على الفجوات الديموغرافية الكبيرة التي تؤثر على الوصول إلى العلاج ونتائج البقاء. تفحص المشهد الجزيئي والوراثي لـ TNBC، مع التركيز على المسارات الحرجة التي تشمل TP53، طفرات BRCA1/2، وإشارات PI3K/AKT، والتي وجهت تطوير العلاجات المستهدفة.…
-
SpaIM: تقدير النسخ الجزيئي المكاني على مستوى الخلية الواحدة عبر نقل الأسلوب SpaIM: single-cell spatial transcriptomics imputation via style transfer
2026 | المؤلف: Bo Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم التقدم في تقنيات النسخ الجزيئي المكاني (ST)، والتي عززت بشكل كبير فهمنا لتنظيم الخلايا ولكن تواجه تحديات مثل الإشارات النادرة والتغطية المحدودة للجينات. للتغلب على هذه القيود، يقدم المؤلفون SpaIM، نموذج تعلم نقل الأسلوب الذي يستخدم بيانات تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq) للتنبؤ بتعبيرات الجينات غير المقاسة في ملفات ST. من خلال…
-
تحليل النسخ البديلة المكاني والخلايا الفردية باستخدام تسلسل القراءة الطويل من نانو بورا Single cell and spatial alternative splicing analysis with Nanopore long read sequencing
2026 | المؤلف: Yuntian Fu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم التحديات والتقدم في تحليل التقطيع البديل باستخدام تقنيات تسلسل القراءة الطويلة، وخاصة في سياقات الخلايا الفردية والمكانية. بينما يعزز تسلسل القراءة الطويلة، مثل ذلك الذي توفره تقنيات أكسفورد نانوبور، تحليل التقطيع البديل، إلا أنه يعيقه ارتفاع معدلات الخطأ التي تؤثر على استرداد رموز الخلايا ومعرفات الجزيئات الفريدة (UMI)، بالإضافة إلى مشكلات تقصير…
-
دمج التحليل المكاني وترانسكريبتوميات الخلايا الفردية لوصف عملية شفاء كسور العظام الطويلة في الفئران Integrating spatial and single-cell transcriptomics to characterize mouse long bone fracture healing process
2026 | المؤلف: Hanning Wang وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يحدد قسم “المواد والطرق” تصميم التجربة والإجراءات المستخدمة في الدراسة. يوضح المواد المحددة المستخدمة، بما في ذلك أي مواد كيميائية، معدات، وعينات بيولوجية، مما يضمن إمكانية تكرار التجارب. تشمل المنهجية التقنيات المطبقة لجمع البيانات وتحليلها، مثل الطرق الإحصائية أو النماذج الحاسوبية، والتي تعتبر حاسمة لتفسير النتائج. بالإضافة إلى ذلك، قد يصف القسم إعداد التجربة، بما…
-
الأطلس الموزع مكانيًا لسرطان الثدي يكشف عن الآلية بين الخلوية للبيئة الوعائية التي تحكم تسرب اللمفاويات Spatially resolved atlas of breast cancer uncovers intercellular machinery of venular niche governing lymphocyte extravasation
2026 | المؤلف: Xin Wang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون تسلسل الجينوم القائم على كرات الحمض النووي (Stereo-seq) لإنشاء خريطة مكانية عالية الدقة للبيئة الدقيقة في 30 ورم ثدي أولي وعقد لمفاوية نقيلية، كاشفين عن تباين كبير عبر أنواع جزيئية مختلفة. تسلط النتائج الضوء على الهيكل المعقد للأوعية الدموية للورم، وخاصة دور خلايا العضلات الملساء الوريدية كمنتجين رئيسيين للكيماويات CCL21…
-
تحسين دقة تشخيص الأورام العصبية الروتينية من خلال النسخ الجيني الموزع مكانيًا والتعلم العميق القائم على الرسوم البيانية Spatially resolved transcriptomics and graph-based deep learning improve accuracy of routine CNS tumor diagnostics
2026 | المؤلف: Michael Ritter وآخرون | المجلة: Nature Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقوم المؤلفون بالتحقيق في متانة وثبات قراءات الجودة في تقنيات التعبير الجيني المكاني عبر مجموعتين تم معالجتهما في مؤسسات مختلفة. المجموعة 1، من هايدلبرغ، استخدمت بشكل أساسي الأنسجة المضمنة في البارافين (63.6%)، بينما كانت المجموعة 2 من فرايبورغ تتمتع بتوزيع أكثر توازنًا لأنواع العينات. على الرغم من عدم وجود اختلافات كبيرة في…
-
FineST: التعلم التبايني يدمج علم الأنسجة والترانسكريبتوميات المكانية لتحليل الروابط والمستقبلات بدقة نواة FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026 | المؤلف: Lingyu Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث FineST، وهي مجموعة تحليلية جديدة مصممة لتحديد التفاعلات المهمة بين الليغاند والمستقبلات داخل الميكروبيئة المناعية للورم، وتحديداً في سرطان البلعوم الأنفي (NPC) وسرطان الكبد (HCC). يعزز FineST دقة بيانات النسخ الجزيئي المكاني، مما يسمح بتحليل مفصل للتفاعلات الخلوية على مستوى النواة الواحدة. في عينة NPC المميزة، حسّن FineST الدقة من 100 ميكرومتر…
-
خطة لبرامج الغزو المحلي والبعيد في الورم الدبقي
2026 | المؤلف: Rony Chanoch-Myers وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام إناث صحية من فئران NOD.Cg-PrkdcIL2rg/SzJ (NSG)، التي تتراوح أعمارها بين 6-8 أسابيع، كنموذج تجريبي. تم الحصول على الفئران من مختبر جاكسون وتم الحفاظ عليها في ظروف خالية من مسببات الأمراض المحددة، مع دورات ضوء مسيطر عليها (12 ساعة ضوء/ظلام)، ودرجة حرارة (18-26 درجة مئوية)، ورطوبة نسبية (30-70%). تم إجراء حقن…
-
يكشف التحليل النسخي الزماني المكاني عن زيادة تنظيم جينات مسار التحلل السكري قبل ظهور التاوبيثي الواضح في نموذج الفأر PS19
2026 | المؤلف: Shuai Wang وآخرون | المجلة: Experimental & Molecular Medicine | المجال: علم وظائف الأعضاء (Physiology)تبحث الدراسة في العلاقة بين تراكم التاو المفرط الفسفرة والضعف الإقليمي في الأمراض التنكسية العصبية، وخاصة مرض الزهايمر (AD) والخرف الجبهي الصدغي. باستخدام نموذج الفأر المعدل وراثيًا tau P301S (خط PS19)، تستخدم الدراسة تحليل النسخ الجزيئي المكاني لتحليل الاستجابات النسخية في الحصيني والمناطق القشرية في مراحل مختلفة من المرض. تشير النتائج إلى أن الميكروغليا المرتبطة…