الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الترانسكريبتوميات المكانية

العلاج الكيميائي المساعد المعدل FOLFIRINOX مع نيفولوماب في سرطان البنكرياس القنوي الحدودي القابل للاستئصال: تجربة تجريبية للمرحلة 1 Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial

2026 | المؤلف: Zev A. Wainberg وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأورام (Oncology)

تدرس هذه الدراسة فعالية وسلامة العلاج الكيميائي المعدل FOLFIRINOX (mFFX) بالاشتراك مع نيفولوماب في المرضى الذين يعانون من سرطان البنكرياس القنوي الحدودي (PDAC)، مع معالجة القيود التي واجهتها تركيبات العلاج الكيميائي السابقة ومثبطات نقاط التفتيش المناعية. أجريت كدراسة أحادية الذراع، تجربة مستقبلية من المرحلة 1b/2 (NCT03970252)، حققت الدراسة أهدافها الأولية المشتركة، حيث أظهرت أن 79%…
تحليل النسخ المكاني يكشف عن التأثيرات الجزيئية للسموم العصبية ثنائي الفينيل متعدد الكلور (PCBs) في أدمغة الفئران البالغة Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice

2026 | المؤلف: Budhaditya Basu وآخرون | المجلة: Molecular Psychiatry | المجال: الصحة والسمية والطفرات (Health, Toxicology and Mutagenesis)

تبحث هذه الدراسة في تأثير ثنائي الفينيل متعدد الكلور (PCBs) على الوظيفة الإدراكية وتعبير الجينات في الدماغ، مع تسليط الضوء على دورها المحتمل في التدهور الإدراكي. تم اكتشاف PCBs، وهي مركبات صناعية مستقرة توجد في وسائط بيئية متنوعة، في أدمغة البشر، مما يشير إلى وجود صلة بمخاطر الأمراض. في هذه الدراسة، تم إعطاء ذكور الفئران…
قسم واحد، عالمين: دمج الخلايا المفردة لتقنية MALDI-MSI وعلم النسخ المكاني على نفس قسم الأنسجة المفرد One section, two worlds: single-cell integration of MALDI-MSI and spatial transcriptomics on the same single tissue section

2026 | المؤلف: Tim Hendriks وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تقدم هذه الدراسة سير عمل جديد يدمج التصوير الطيفي الكتلي بالليزر المساعد بالمصفوفة (MALDI-MSI) بدقة عالية مع النسخ الجزيئي المكاني (SPT) على شريحة نسيج واحدة، مما يلبي الحاجة إلى بيانات متعددة الأوميات ذات دقة مكانية على مستوى الخلية الواحدة. يضمن هذا النهج تطابقًا مكانيًا على مستوى البكسل بين الميزات الأيضية والنسخ الجزيئية، مما يقلل من…
أنماط ATP الميتوكوندري تتنبأ بطي الأنسجة Patterns of mitochondrial ATP predict tissue folding

2026 | المؤلف: Bezia Lemma وآخرون | المجلة: Science Advances | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تناقش ورقة البحث الدور الحاسم للتشكل في تغييرات شكل الأنسجة المدفوعة بتعبير الجينات والقوى الميكانيكية، مع التأكيد على العلاقة غير المستكشفة بين استقلاب الطاقة، وخاصة إنتاج ATP الميتوكوندري، وهذه العمليات. بينما تم ملاحظة تدرجات جليكولية في التطور الجنيني، يبرز المؤلفون فجوة في فهم كيفية تنظيم استقلاب الطاقة الميتوكوندري مكانيًا للأحداث التشكيلية، مثل الانقباض القمي، حيث…
الانحدار العكسي المقطعي الموزون لتقليل الأبعاد الخاضع للإشراف القابل للتوسع لبيانات النسخ الجيني المكاني Weighted sliced inverse regression for scalable supervised dimensionality reduction of spatial transcriptomics data

2026 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تناقش هذه القسم أهمية النسخ الجيني الموزع مكانياً والحاجة إلى تقنيات تحليل فعالة لتعزيز الفهم البيولوجي. يبرز القيود التي تواجه طرق تقليل الأبعاد التقليدية، التي غالباً ما تفشل في الحفاظ على التباين المكاني البيولوجي المعنوي في بيانات التعبير الجيني. لمعالجة هذه المشكلة، يقدم المؤلفون الانحدار العكسي الموزون المقطوع (wSIR)، وهي تقنية جديدة لتقليل الأبعاد مصممة…
فك رموز المشهد المكاني للأمراض العضلية: نهج ترنسكريبتومي لدوشين وبيكر Unraveling the spatial landscape of dystrophinopathies: a transcriptomic approach to Becker and Duchenne muscular dystrophies

2026 | المؤلف: Laura G.M. Heezen وآخرون | المجلة: The Journal of Pathology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تستكشف هذه الدراسة التغيرات الخلوية والجزيئية في العضلات المتأثرة بضمور العضلات بيكر ودوشين (BMD وDMD)، وكلاهما ناتج عن طفرات في جين DMD ويؤديان إلى تدهور العضلات يتميز باستبدال الأنسجة العضلية بأنسجة ليفية ودهنية، مما يؤدي في النهاية إلى الوفاة المبكرة. باستخدام تقنية النسخ الجزيئي المكاني، أجرى الباحثون تحليلًا لعينات من العضلات مأخوذة من مرضى يعانون…
تصوير الطيف الكتلي متعدد الأبعاد لعلم الأعصاب الدهني المحدد باللويحات والمناطق في نماذج الفئران لمرض الزهايمر Multimodal mass spectrometry imaging for plaque- and region-specific neurolipidomics in Alzheimer’s disease mouse models

2026 | المؤلف: Timothy J. Trinklein وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)

تبحث الدراسة في الآليات الحيوية الكيميائية التي تكمن وراء تشكيل لويحات الأميلويد بيتا (Aβ)، وهي سمة رئيسية من سمات مرض الزهايمر (AD). باستخدام فئران 5xFAD و APP NL-G-F الأنثوية، تعتمد الدراسة إطارًا متعدد الوسائط يجمع بين التصوير الطيفي الكتلي بتقنية تفريغ الليزر المساعد بالمصفوفة/التحليل الأيوني مع التحليل الطيفي للحركة الأيونية المحصورة، وميكروسكوبية الفلورية. يعزز هذا…
مقاييس موحدة لتقييم وإعادة إنتاج مجموعات بيانات النسخ المكانية المعتمدة على التصوير Standardized metrics for assessment and reproducibility of imaging-based spatial transcriptomics datasets

2026 | المؤلف: Jasmine Plummer وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تتناول ورقة البحث نقص المقاييس الموحدة لتقييم تقنيات التهجين في الموقع المعتمدة على التصوير في علم النسخ الجزيئي المكاني. لمواجهة هذه المشكلة، أنشأ المؤلفون مجموعة بيانات Spatial Touchstone (ST)، التي تشمل ستة أنواع من الأنسجة من مواقع عالمية مختلفة، تم تحليلها باستخدام منصات Xenium وCosMx. تم اختيار هذه المنصات لشعبيتها وكيميائياتها المختلفة. تقيم الدراسة مقاييس…
STPath: نموذج أساسي توليدي لدمج النسخ المكانية وصور الشرائح الكاملة STPath: a generative foundation model for integrating spatial transcriptomics and whole-slide images

2026 | المؤلف: Tinglin Huang وآخرون | المجلة: npj Digital Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يقدم هذا القسم STPath، وهو نموذج أساسي توليدي جديد مصمم لتعزيز النسخ الجزيئي المكاني (ST) من خلال التنبؤ بأنماط التعبير الجيني مباشرة من صور الشرائح الكاملة (WSIs). تواجه طرق ST الحالية قيودًا بسبب تغطية الجينات الضيقة، والتدريب المحدد للأعضاء، والحاجة إلى ضبط دقيق خاص بمجموعات البيانات، مما يحد من قابليتها للتوسع وتطبيقها. يتناول STPath هذه…
دمج بيانات العينة المتقاطعة والبيانات المتعددة الأنماط للترانسكريبتوميات المكانية والميتابولوميات باستخدام SpatialMETA Integrating cross-sample and cross-modal data for spatial transcriptomics and metabolomics with SpatialMETA

2026 | المؤلف: Ruonan Tian وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يقدم القسم نظرة عامة على إطار عمل جديد، SpatialMETA، مصمم لدمج بيانات النسخ الجيني المكاني (ST) وبيانات الأيض المكاني (SM) من نفس أو أقسام الأنسجة المجاورة. تتناول هذه الطريقة التحديات التي تطرحها التوزيعات المختلفة لعدد النسخ وكثافات المستقلبات، فضلاً عن التباينات في الشكل المكاني والدقة. يستخدم SpatialMETA مشفرًا تلقائيًا متغيرًا شرطيًا (CVAE) لتسهيل الدمج بين…