الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الفحص الافتراضي
-
اكتشاف قائم على الهيكل لمثبطات مجال Mac1 للبروتين غير الهيكلي-3 من SARS-CoV-2 من خلال فحص معزز بتعلم الآلة لمساحة المواد الكيميائية
2026 | المؤلف: Fuqiang Ban وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)في الأبحاث الأخيرة، تم التركيز بشكل كبير على تحديد مثبطات الجزيئات الصغيرة التي تستهدف ماكرودومين 1 (Mac1) من البروتين غير الهيكلي 3 (NSP3) كعوامل مضادة للفيروسات محتملة لـ SARS-CoV-2. تم اختيار Mac1 كهدف لتقييم التجارب لإيجاد الأهداف (CACHE) التحدي #3، حيث طورت فريقنا استراتيجية حسابية تصدرت بين 23 مشاركًا. أدت هذه الطريقة إلى اكتشاف سلسلة…
-
النسخ الجيني المتكامل والفحص القائم على الهيكل يحدد المركبات النباتية من Phyllanthus amarus كمنظمات محتملة لـ WNT5A في سرطان المبيض
2026 | المؤلف: Shreya Shibu وآخرون | المجلة: Frontiers in Bioinformatics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)تقدم ورقة البحث نهجًا حسابيًا تكامليًا لتحديد الأهداف العلاجية المحتملة والمركبات النشطة حيويًا لسرطان المبيض، مع التركيز على الجين المسرطن WNT5A. يتميز سرطان المبيض بتشخيصه في مراحل متأخرة ومنظومة جزيئية معقدة، مما يستلزم تحديد المحركات المسرطنة الرئيسية. استخدمت الدراسة مجموعات بيانات التعبير الجيني من Gene Expression Omnibus لتحديد 103 جينًا تم تنظيمها بشكل مستمر، مع…
-
نموذج متعدد المقاييس تم معايرته تجريبياً يتنبأ بتأثيرات تركيبات الأدوية المعتمدة على الجدول الزمني
2026 | المؤلف: Othmane Hayoun-Mya وآخرون | المجلة: npj Systems Biology and Applications | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)تقدم البحث نموذجًا متعدد المقاييس يدمج تأثيرات الأدوية الجزيئية، والإشارات داخل الخلايا، وديناميات النقل على مستوى الأنسجة للتنبؤ بتأثيرات تركيبات الأدوية في خط خلايا AGS. تم معايرة هذا النموذج باستخدام منحنيات نمو الأدوية الفردية، ويتنبأ بنجاح بنتائج على مستوى السكان لتركيبات الأدوية دون الحاجة إلى تدريب محدد لكل تركيبة. تسلط هذه القدرة الضوء على إمكانيات…
-
توجيه الذكاء الاصطناعي للتصميم التنافسي للفحص الافتراضي وتوقع فعالية المركبات
2026 | المؤلف: Manon Mirgaux وآخرون | المجلة: npj Drug Discovery. | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول الورقة البحثية التأثير التحويلي لتعلم الآلة، وخاصة طرق التداخل القائم على إزالة الضوضاء مثل AlphaFold3 و Boltz-1/2، على توقع بنية البروتين وتفاعلاته في اكتشاف الأدوية. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا يسمى التداخل التنافسي الزوجي، والذي يصنف الجزيئات المرشحة بناءً على تقاربها النسبي مع هدف بروتيني. تم اختبار هذه الطريقة على 17 نظامًا مرجعيًا للبروتين، مما…
-
التوصيف الكيميائي للمركبات المستخلصة من أنونا موريكاتا المستهدفة لـ COX-2 في سرطان الثدي
2026 | المؤلف: Vitalis Mbayo وآخرون | المجلة: Discover Chemistry. | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تتناول ورقة البحث القضية الملحة لسرطان الثدي (BC)، الذي لا يزال أكثر الأورام الخبيثة تشخيصًا على مستوى العالم، مما يساهم بشكل كبير في الاعتلال والوفيات. تحدد الدراسة Annona muricata كمصدر واعد لمركبات البوليفينول ذات الألفة الحسابية القوية لـ COX-2، وهو وسيط حاسم في تقدم سرطان الثدي. باستخدام سير عمل متكامل يشمل الفحص الافتراضي عالي الإنتاجية،…
-
RNAmigos2: الفحص الافتراضي المعتمد على الهيكل المتسارع للـ RNA باستخدام التعلم العميق للرسوم البيانية
2025 | المؤلف: Juan G. Carvajal-Patiño وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من المشاركين. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، واستطلاعات، ودراسات رصدية، مما يضمن تقييمًا شاملاً للمتغيرات ذات الاهتمام. تم تحليل البيانات باستخدام برامج إحصائية مناسبة، مع تحديد مستويات الدلالة…
-
منصة فحص افتراضية معززة بالذكاء الاصطناعي لاكتشاف الأدوية
2024 | المؤلف: Guangfeng Zhou وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)يقدم القسم نظرة عامة على طريقة جديدة تعتمد على الهيكل لفحص المركبات الافتراضية، RosettaVS، التي تم تطويرها لتعزيز دقة التنبؤ بوضعيات الربط وقوى الارتباط في اكتشاف الأدوية المبكر. تعالج هذه الطريقة قيود الأساليب الحالية من خلال نمذجة مرونة المستقبل بشكل فعال، مما يساهم في أدائها المتفوق على معايير مختلفة. يقدم المؤلفون منصة مفتوحة المصدر تستفيد…
-
الذكاء الاصطناعي هو بديل قابل للتطبيق للفحص عالي الإنتاجية: دراسة تستهدف 318 هدفًا
2024 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم ورقة البحث تقييمًا شاملاً لبرنامج Atomwise AIMS، الذي يستخدم شبكة AtomNet® العصبية التلافيفية لإجراء فحص افتراضي عالي الإنتاجية (HTS) عبر 318 مشروعًا. تسلط هذه الدراسة الضوء على قيود HTS التقليدي، الذي يعتمد على توفر المركبات الفيزيائية، مما يحد من استكشاف الفضاء الكيميائي. تشير النتائج إلى أن AtomNet® يحدد بنجاح جزيئات حيوية جديدة عبر مجالات…
-
الذكاء الاصطناعي التوليدي في اكتشاف الأدوية: الإطار الأساسي، التقدمات الحديثة، التحديات، والفرص
2024 | المؤلف: Amit Gangwal وآخرون | المجلة: Frontiers in Pharmacology | المجال: النظرية الحسابية والرياضيات (Computational Theory and Mathematics)تقدم هذه القسم نظرة عامة على منهجيتين رئيسيتين لاكتشاف أو تصميم جزيئات الأدوية الصغيرة: تحسين المركبات الموجودة من خلال علاقات الهيكل-النشاط الكمية والفحص الافتراضي، وتوليد جزيئات جديدة عبر تصميم الأدوية de novo أو علاقات الهيكل-النشاط العكسية الكمية. تهدف كلا الطريقتين إلى تحسين الخصائص الدوائية والدوائية الحيوية، ومع ذلك، تظل عملية تطوير الأدوية مكلفة وطويلة، بمتوسط…
-
DynamicBind: التنبؤ بهيكل معقد البروتين-الليغاند المحدد بواسطة ليغاند باستخدام نموذج توليدي عميق متساوي
2024 | المؤلف: Wei Lu وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تحدد هذه القسم قيود الطرق التقليدية في التنبؤ بتفاعلات البروتين-الليغاند، وخاصة المعالجة الصارمة للبروتينات في دراسات الربط وكثافة الحوسبة لمحاكاة الديناميات الجزيئية. مع إدراك أهمية ديناميات البروتين لفهم الوظيفة والمساعدة في اكتشاف الأدوية، يقدم المؤلفون DynamicBind، وهو نهج جديد للتعلم العميق يستخدم شبكات الانتشار الهندسية المتكافئة. هذه الطريقة تبني مشهد طاقة سلس يسهل الانتقالات الفعالة…