الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الميكروبيوم

تقوم الميكروبات الأساسية بتنظيم مرونة النبات والتربة من خلال الحفاظ على مرونة الشبكة خلال الاستعادة طويلة الأمد للمراعي الجبلية.
Core microbes regulate plant-soil resilience by maintaining network resilience during long-term restoration of alpine grasslands

قسم “الطرق” يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون نهجًا كميًا، حيث تم استخدام التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة تأثيراتها على النتائج المعنية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان الموثوقية والصلاحية. تم إجراء…
البكتيريا المنقولة عبر البذور تحفز تجميع الميكروبيوم الجذري للقمح من خلال تقسيم الفضاء البيئي والتيسير
Seed-borne bacteria drive wheat rhizosphere microbiome assembly via niche partitioning and facilitation

في هذه الدراسة، شمل التصميم التجريبي استخدام تربة ضخمة من مرج سويسري مجاور لحقل قمح لإنشاء ميكروكوزم للتحقيق في المجتمعات الميكروبية. حصل الباحثون على غسيل التربة، الذي احتوى على تعليق ميكروبي، واستخراج تربة معقم ومصفى لتوفير المغذيات الدقيقة القابلة للذوبان والجزيئات العضوية. تم إدخال هذه المكونات في أنابيب زجاجية معقمة مليئة بمصفوفة التربة (0.5-4 مم…
جينات مقاومة المضادات الحيوية في الميكروبيوم الفموي
Antimicrobial resistance genes in the oral microbiome

تستعرض هذه المراجعة المنهجية وجود جينات مقاومة مضادات الميكروبات (ARGs) داخل الميكروبيوم الفموي، مما يبرز الحاجة إلى مزيد من البحث لفهم تداعياتها على الأمراض الجهازية وخطر تطوير عدوى مقاومة للمضادات الحيوية. تشير النتائج إلى أنه بينما توفر الدراسة رؤى قيمة حول مقاومة الفم، إلا أنها لا تغير الممارسات السريرية الحالية. تؤكد المراجعة على أهمية الالتزام…
اختلال توازن ميكروبيوم الفم: العلاقة بين الميكروبات وحدوث تسوس الأسنان
Imbalance of oral microbiome homeostasis: the relationship between microbiota and the occurrence of dental caries

تبحث الدراسة في دور اختلال الميكروبيوم الفموي في بدء تسوس الأسنان، وخاصة في سياق نظام غذائي يحتوي على السكروز. يُعتبر *Streptococcus mutans*، الذي يُنظر إليه تقليديًا على أنه العامل المسبب الرئيسي في تسوس الأسنان، الآن مفهوماً ضمن إطار أوسع من عدم التوازن الميكروبي. استخدمت الدراسة تسلسل جين 16S rRNA لتحليل اللعاب واللويحات السنية من مجموعتين…
وفرة العقدية والتوجه الموضع الفموي في البشر والرئيسيات غير البشرية تعكس اختلافات المضيف ونمط الحياة
Streptococcus abundance and oral site tropism in humans and non-human primates reflects host and lifestyle differences

تبحث الدراسة في وفرة أنواع *Streptococcus* وتفضيلاتها المحددة لمواقع الفم في كل من البشر والرئيسيات غير البشرية، مع تسليط الضوء على تأثير خصائص المضيف وعوامل نمط الحياة. تكشف الدراسة عن اختلافات كبيرة في تجمعات *Streptococcus* عبر مواقع فموية مختلفة، مما يشير إلى أن المواطن البيئية داخل تجويف الفم تتشكل من خلال الجوانب البيولوجية والسلوكية للمضيف.…
بروتيوميات اللعاب والميتابروتيوميات تحدد بصمات جزيئية وتصنيفية مميزة لمرض السكري من النوع الثاني
Salivary proteomics and metaproteomics identifies distinct molecular and taxonomic signatures of type-2 diabetes

تستقصي هذه الدراسة البروتينات اللعابية والبروتينات الميتابروتينية لدى الأفراد الذين تم تشخيصهم حديثًا بمرض السكري من النوع الثاني (T2D) مقارنةً بالأشخاص الأصحاء. باستخدام تقنيات مطيافية الكتلة المتقدمة (MS)، حدد الباحثون أكثر من 4500 بروتين بشري وبكتيري من عينات اللعاب لـ 15 مريضًا بمرض السكري من النوع الثاني و15 شخصًا صحيًا متطابقين في العمر ومؤشر كتلة…
تنبؤ الأنظمة الديناميكية الجماعية بنجاح الغزو وتأثيراته في المجتمعات الميكروبية
Collective dynamical regimes predict invasion success and impacts in microbial communities

في هذه الدراسة، كان التصميم التجريبي لاختبارات الغزو يتضمن إدخال أنواع غازية إلى هياكل مجتمعية تم تأسيسها مسبقًا. تم تطوير هذه المجتمعات على مدى ستة أيام من خلال دورات من النمو والتشتت. في اليوم السادس، تمت إضافة نوع غازي مختار إلى المجتمع المقيم بنسبة $10^{-3}$ من حجم زراعته الأحادية إلى حجم المجتمع المقيم. بعد إدخال…
الميزات الرئيسية والإرشادات لتطبيق مقاييس تنوع الألفا الميكروبي
Key features and guidelines for the application of microbial alpha diversity metrics

تناقش هذه الفقرة التحديات والاختلافات في تحليل المجتمعات الميكروبية، لا سيما فيما يتعلق بمقاييس التنوع الألفا. وتبرز أن العديد من هذه المقاييس مستعارة من مجالات أخرى وقد لا تكون مناسبة لبيانات الميكروبيوم، مما يؤدي إلى تفسيرات غير واضحة في الدراسات الحالية. يقوم المؤلفون بإجراء تحليل نظري وتجريبي ومقارن لـ 19 مقياس تنوع ألفا، مصنفين إياها…
الأدوار المزدوجة للميكروبات في التوسط في ديناميات الكربون في التربة استجابةً للاحتباس الحراري
Dual roles of microbes in mediating soil carbon dynamics in response to warming

في هذه الدراسة، تم التحقيق في تأثيرات الاحترار التجريبي على القدرات الأيضية والفيزيولوجيا الميكروبية من خلال تسلسل الميتاجينوم وقياسات فيزيولوجية متنوعة. أظهر التحليل أن الهيدرازات الجليكوسيدية (GHs) ونقل الجليكوزيل (GTs) كانت الفئات السائدة من الإنزيمات النشطة للكربوهيدرات (CAZy)، مع تحديد ما مجموعه 237 عائلة CAZy. ومن الجدير بالذكر أنه بينما ظل الوفرة العامة لعائلات جينات…
تساهم الميكروبات المقيمة في الورم في انتشار سرطان القولون إلى الكبد من خلال اللاتيل والتعديل المناعي
Tumor-resident microbiota contributes to colorectal cancer liver metastasis by lactylation and immune modulation

تبحث هذه الدراسة في تأثير الميكروبات المقيمة في الورم على مناعة الورم، مع التركيز بشكل خاص على وجود البكتيريا داخل الورم، مثل *Escherichia coli*، في نقائل الكبد الناتجة عن سرطان القولون والمستقيم (CRLM). تكشف الدراسة أن *E. coli* يعزز إنتاج اللاكتات، مما يعزز بدوره استقطاب البلعميات من النوع M2 عن طريق تثبيط إشارة العامل النووي-κB…