الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ببتيدات
-
Deep-ProBind: التنبؤ بالبروتينات المرتبطة باستخدام نموذج التعلم العميق القائم على المحولات
2025 | المؤلف: Salman Khan وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم أهمية البروتينات المرتبطة في الأنظمة البيولوجية، مع التركيز على تفاعلاتها الانتقائية مع جزيئات مثل الحمض النووي، RNA، والببتيدات، والتي تعتبر حاسمة لمختلف الوظائف الخلوية. غالبًا ما تكون الطرق التقليدية لتحديد الببتيدات المرتبطة بالبروتينات غير فعالة وتفتقر إلى الدقة بسبب تركيزها على ميزات التسلسل القريبة دون النظر في البيانات الهيكلية. لمعالجة هذه التحديات،…
-
تجمعات الببتيد الثنائية كنموذج نشط للكوندنسات البيومولكولية
2025 | المؤلف: Shoupeng Cao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم تخليق مشتقات من الببتيدات القائمة على ثنائي الفينيل ألانين والركائز وفقًا لبروتوكولات الأدبيات المعتمدة، مع تعديلات طفيفة لتحسين العملية. شمل التخليق استخدام مذيبات ومواد كيميائية متنوعة، تم استخدامها جميعًا في أشكالها المستلمة دون مزيد من التنقية. هذه الطريقة ضمنت سلامة وقابلية تكرار المواد المستخدمة في التجارب اللاحقة. تشير نتائج الدراسة إلى…
-
سلسلة إشارات الببتيد TaCLE24b تعدل تطوير الجذور الجانبية وتحمل الجفاف في القمح
2025 | المؤلف: Wen Yang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علوم النبات (Plant Science)في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون أصناف القمح الربيعي ‘CB037’ و ‘Fielder’ (Triticum aestivum L.) لاستنساخ الجينات، وتحليل التعبير، والتحول الجيني. خضعت البذور للتعقيم السطحي بمحلول هيبوكلوريت الصوديوم بنسبة 1% لمدة 15 دقيقة، تلاها شطف بالماء المقطر ونقعها طوال الليل في الظلام عند درجة حرارة الغرفة. ثم تم زراعة البذور المنبتة في دفيئة تحت ظروف مسيطر…
-
الوصول إلى الأحماض الأمينية N-α-deuterated ومركبات الحمض النووي عبر اختزال الديوتيرامين α-أوكسي-الكربونيل بواسطة Ca(II)-HFIP
2025 | المؤلف: Haoran Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: العلوم الصيدلانية (Pharmaceutical Science)تناقش هذه الفقرة التقدم في تخليق الجزيئات الديوتيرية، مع التركيز بشكل خاص على طريقة جديدة مستوحاة من الطبيعة للتخليق الانتقائي للمركبات الديوتيرية من α-أوكسي-كربونيل باستخدام الأمينات. تستخدم هذه الطريقة استر هانتزتش d₂ كمصدر للديوتيريوم، محققة كفاءة ديوتيرية تزيد عن 99% وتمكن من تخليق مجموعة متنوعة من أنماط الأحماض الأمينية N-α-dيوتيرية، مع أكثر من 130 مثالًا…
-
مركب الببتيد-دواء لإعادة برمجة علاجية للبلاعم المرتبطة بالورم في سرطان الثدي
2025 | المؤلف: Anni Lepland وآخرون | المجلة: Advanced Science | المجال: علم المناعة (Immunology)في سياق سرطان الثدي الثلاثي السلبي (TNBC)، تلعب البلعميات المحفزة للورم دورًا حاسمًا في تعزيز النقائل وكبح الاستجابات المناعية. لاستهداف هذه البلعميات بشكل فعال، قام الباحثون بتصميم ببتيد يعرف باسم MACTIDE، مستمد من الببتيد المرتبط بـ CD206 المعروف سابقًا mUNO. يتضمن هذا الببتيد الجديد حلقة مثبط التربسين، مما يعزز من تقارب ارتباطه بـ CD206 من…
-
π-PrimeNovo: نموذج تعلم عميق غير تكراري دقيق وفعال لتسلسل الببتيدات من جديد
2025 | المؤلف: Xiang Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه القسم التقدم في تسلسل الببتيدات من خلال مطيافية الكتلة المتسلسلة (MS/MS)، مع التأكيد على قيود طرق البحث التقليدية في قواعد البيانات في علم البروتينات. يبرز إدخال نموذج π-PrimeNovo، وهو نموذج قائم على Transformer غير تكراري مصمم لتسلسل الببتيدات من جديد. يعالج هذا النموذج تحديات تراكم الأخطاء وسرعات الاستدلال البطيئة المرتبطة بالنماذج التكرارية. لا…
-
تمكين diaTracer من التحليل المركزي للطيف لبيانات بروتيوميات diaPASEF
2025 | المؤلف: Kai Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في قياس الببتيدات والبروتينات من خلال الاستحواذ المستقل عن البيانات (DIA) في علم البروتيوميات باستخدام الكروماتوغرافيا السائلة-مطيافية الكتلة (LC-MS/MS). يسلط الضوء على دمج فصل حركة الأيونات عبر تقنية diaPASEF على منصة timsTOF من Bruker، مما يعزز دقة القياس وتغطية البروتين. يقدم المؤلفون diaTracer، أداة حسابية مصممة لبيانات diaPASEF،…
-
الببتيدات الذاتية الداخلية تحمي الامتياز المناعي للجهاز العصبي المركزي
2024 | المؤلف: Min Woo Kim وآخرون | المجلة: Nature | المجال: الطب النفسي البيولوجي (Biological Psychiatry)يتناول هذا القسم من ورقة البحث التفاعل بين الجهاز العصبي المركزي (CNS) والجهاز المناعي، متحدياً الرؤية التقليدية لامتياز المناعة في CNS. يحدد المؤلفون مجموعة من الببتيدات الذاتية التنظيمية المستمدة من CNS والتي يتم تقديمها على جزيئات معقد التوافق النسيجي الرئيسي من الفئة الثانية (MHC-II). هذه الببتيدات ضرورية للحفاظ على التواصل بين CNS والجهاز المناعي المحيطي،…
-
المشهد الجينومي لـ 2,023 سرطان قولون ومستقيم
2024 | المؤلف: Alex J. Cornish وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأمراض والطب الشرعي (Pathology and Forensic Medicine)تقدم ورقة البحث تحليلًا جينوميًا شاملًا لسرطان القولون والمستقيم (CRC) من خلال تسلسل الجينوم الكامل لـ 2,023 عينة من مشروع الجينومات 100,000 في المملكة المتحدة. تحدد هذه الدراسة أكثر من 250 جينًا محتملاً للسائق، العديد منها لم يرتبط سابقًا بـ CRC أو أنواع السرطان الأخرى، وتكشف عن تغييرات جينومية متكررة تتجاوز المناطق المشفرة. يصنف المؤلفون…
-
تجميع ذاتي للببتيد والأجسام المضادة في الموقع لحجب إشارات CD47 وCD24 يعزز البلعمة التي تتوسطها البلعميات والاستجابات المناعية المضادة للأورام
2024 | المؤلف: Weiqi Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)تقدم البحث نهجًا علاجيًا جديدًا، يسمى مثبطات CD47 و CD24 المستهدفة ثنائيًا التي تم تجميعها في الموقع (PAC-SABI)، تهدف إلى تعزيز فعالية العلاج المناعي من خلال إعادة تنشيط خلايا المناعة الفطرية، وخاصة البلعميات. يعمل PAC-SABI من خلال انتشار السطح البيولوجي على أغشية خلايا السرطان، مستفيدًا من تفاعلات الرباط-المستقبلات وردود الفعل المحفزة بالإنزيمات لحجب مسارات الإشارة…