الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تحليل الخلايا المفردة
-
SeuratExtend: تبسيط تحليل RNA-seq على مستوى الخلية الواحدة من خلال إطار عمل متكامل وبديهي
2025 | المؤلف: Yichao Hua وآخرون | المجلة: GigaScience | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم هذا القسم SeuratExtend، وهو حزمة R مصممة لتعزيز تحليل بيانات تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). مبنية على إطار العمل Seurat المستخدم على نطاق واسع، تتناول SeuratExtend التحديات التي تطرحها الزيادة السريعة في أدوات التحليل من خلال دمج الوظائف الأساسية وقواعد البيانات في منصة متكاملة. تدعم الحزمة مجموعة متنوعة من التحليلات، بما في ذلك إثراء…
-
خلايا T K+CD8+ تتفاعل مع الألياف لدعم الالتهاب العددي في الزوائد الأنفية
2024 | المؤلف: Cuilian Guo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)التفاعل بين الخلايا الداعمة والخلايا المناعية أمر حاسم في سياقات بيولوجية ومرضية مختلفة، وخاصة في التهاب الأنف والجيوب الأنفية المزمن مع الزوائد الأنفية (CRSwNP). يتميز هذا الحالة بالتهاب في مجرى الهواء العلوي يقوده بشكل أساسي خلايا T المساعدة من النوع 2 (Th2) وخلايا اللمفوية الفطرية من النوع 2 (ILC2) والحمضات، والتي عادة ما تُعالج بالكورتيكوستيرويدات…
-
نظرة بانورامية على ديناميات تجمعات الخلايا في شيخوخة الثدييات
2024 | المؤلف: Zehao Zhang وآخرون | المجلة: Science | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقدم المؤلفون PanSci، وهو أطلس شامل للتعبير الجيني على مستوى الخلية الواحدة، الذي يصف أكثر من 20 مليون خلية من 623 نسيجًا للفئران، ملتقطًا البيانات عبر مراحل الحياة المختلفة، والأجناس، والأنماط الجينية. تكشف هذه المجموعة الواسعة من البيانات عن أكثر من 3000 حالة خلوية متميزة وتحدد أكثر من 200 مجموعة خلوية مرتبطة…
-
تسليط الضوء على تفاعل الخلايا الشبيهة بالنوادي مع الخلايا النخاعية المثبطة للمناعة في سرطان البروستاتا من خلال تحليل النسخ الجيني الخلوي الفردي والمكاني
2024 | المؤلف: Antti Kiviaho وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات التي تم جمعها من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية محكومة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة آثارها على النتائج ذات الأهمية. شمل جمع البيانات استخدام أدوات موحدة لضمان…
-
عزل الخلايا العصبية المستجيبة للهلوسة التي تكمن وراء حالات السلوك المضاد للقلق
2024 | المؤلف: Jessie Muir وآخرون | المجلة: Science | المجال: علم النفس السريري (Clinical Psychology)تبحث هذه الدراسة في الآليات العصبية التي تكمن وراء التأثيرات السلوكية للمواد المهلوسة، والتي تظهر كعلاجات محتملة للاضطرابات النفسية العصبية. تركز الدراسة على تحديد خلايا عصبية معينة في القشرة الجبهية الحجاجية الوسطى (mPFC) التي تتأثر بالمواد المهلوسة. باستخدام مُدمج نشاط يعتمد على الضوء والكالسيوم، قام الباحثون بوسم هذه الخلايا العصبية المستجيبة للمواد المهلوسة وراثيًا. من…
-
البروتيوميات المكانية للخلايا الفردية والعضيات على شرائح الأنسجة باستخدام بروتيوميات التوسع المدعومة بالمرشحات
2024 | المؤلف: Zhen Dong وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)اتبعت الدراسة جميع اللوائح المعنية بالمشاركين البشريين وتم تنفيذها بما يتماشى مع إعلان هلسنكي. تم الحصول على الموافقة لجمع واستخدام الأنسجة البشرية من لجنة الأخلاقيات المؤسسية في المستشفى الثاني التابع لجامعة تشجيانغ كلية الطب، وكذلك من لجنة الأخلاقيات في جامعة ويستليك. يضمن هذا الإشراف الأخلاقي أن البحث يتوافق مع المعايير المعمول بها لعلاج الموضوعات البشرية.…
-
GeneCompass: فك شفرة الآليات التنظيمية الجينية العالمية من خلال نموذج أساسي مستند إلى المعرفة عبر الأنواع
2024 | المؤلف: Xiaodong Yang وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على تطوير GeneCompass، وهو نموذج أساسي عبر الأنواع مصمم لتعزيز فهمنا لآليات تنظيم الجينات من خلال دمج البيانات من أكثر من 120 مليون ترانسكريبتوم أحادي الخلية من البشر والفئران. غالبًا ما تركز طرق البحث التقليدية على الكائنات الحية النموذجية الفردية، مما يحد من الرؤى حول الآليات التنظيمية العالمية. ومع ذلك، فإن التقدم…
-
تسلسل RNA الخلوي الفردي المكاني يكشف عن أنماط متميزة من الاختلال في الخلايا غير العصبية والعصبية الناتجة عن طفرة جين خطر الزهايمر Trem2R47H
2024 | المؤلف: Kevin G. Johnston وآخرون | المجلة: Molecular Psychiatry | المجال: طب الأعصاب (Neurology)تُعتبر طفرة R47H في جين TREM2 عامل خطر كبير لمرض الزهايمر. تبحث هذه الدراسة في تأثيرات طفرة Trem2 R47H على أنواع الخلايا المختلفة عبر مناطق الدماغ القشرية وغير القشرية المتعددة، باستخدام نموذج فأر مع خلفيات من النوع البري و5xFAD. من خلال استخدام MERFISH للتعبير الجيني المكاني، قام الباحثون بتوصيف 19 مقطع دماغي من أنماط جينية…
-
تحليل بان-سرطاني على مستوى الخلية الواحدة لإظهار تباين الخلايا النخاعية المتسللة للأورام في حجب نقاط التفتيش المناعية
2024 | المؤلف: Weiyuan Li وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)تلعب الخلايا النخاعية أدوارًا حاسمة في الجهاز المناعي، لا سيما في تعديل الاستجابات المناعية داخل بيئة الورم الدقيقة (TME). تبحث هذه الدراسة في الخلايا النخاعية المتسللة إلى الورم (TIMs) من خلال تحليل شامل شامل للسرطان باستخدام تسلسل النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة عبر ثمانية أنواع من السرطان، تشمل 192 عينة ورم من 129 مريضًا.…
-
مقارنة منهجية لطرق النسخ الجيني المكاني المعتمدة على التسلسل
2024 | المؤلف: Yue You وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقوم المؤلفون بتقييم منهجيات النسخ الجيني المكاني (sST) بشكل منهجي، مع التركيز على استراتيجيات الفهرسة المكانية المختلفة، بما في ذلك الميكروأري، والتقنيات المعتمدة على الكريات، وتقنيات بولوني/نانوبول، والميكروفلويديك. تستخدم الدراسة أنسجة مرجعية محددة جيدًا: دماغ الفأر البالغ، جنين الفأر E12.5، وبصلة الشم في الفأر البالغ، والتي تظهر خصائص مورفولوجية مميزة وملفات تعبير…