الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل بندقية
-
نهج متكامل لمراقبة مسببات الأمراض وتحليل الميتاجينوم بالأسلوب الشامل في تربية سمك السلمون الأطلسي
2026 | المؤلف: Ottavia Benedicenti وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم المناعة (Immunology)تقدم الدراسة سير عمل قابل للنشر في الميدان مصمم لاكتشاف مسببات الأمراض المائية في تربية الأحياء المائية، مع التركيز بشكل خاص على إنتاج السلمون الأطلسي. يدمج هذا السير عمل الحمض النووي البيئي (eDNA) وترشيح الحمض النووي الريبي البيئي (eRNA) مع PCR الكمي العكسي المستهدف (RT-qPCR) والميتاباركويدينغ. كان الهدف الأساسي هو تقييم جدوى وأداء هذا النهج…
-
تسلسل الحمض النووي الميتاجينومي باستخدام تقنية النانو بورت الطويلة لمراقبة التنوع البيولوجي في الأنهار والحياة البرية والتلوث والصحة البيئية
2026 | المؤلف: Orestis Nousias وآخرون | المجلة: NAR Genomics and Bioinformatics | المجال: علم البيئة (Ecology)تناقش هذه القسم الحاجة الملحة لمراقبة التنوع البيولوجي وظهور الأمراض المعدية في سياق ارتفاع درجات الحرارة العالمية ونمو السكان البشر. يقترح المؤلفون استخدام تسلسل الميتاجينوم الطويل القراءة من الحمض النووي البيئي (eDNA) كاختبار شامل لتقييم تنوع الأنواع عبر شجرة الحياة، من الفيروسات إلى الكائنات متعددة الخلايا المعقدة، تحديدًا ضمن نظام نهر أفوكا في مقاطعة ويكلو،…
-
التحديات في التقاط الميكروبيوم الفطري من بيانات الميتاجينوم الشامل: نقص البرمجيات وقواعد البيانات
2025 | المؤلف: Ekaterina Avershina وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة الحالة الحالية لأدوات المعلوماتية الحيوية لتوصيف الميكروبيوم الفطري، وهو المكون الفطري للميكروبيوم المعوي، باستخدام بيانات ميتاجينومية محاكاة. قام المؤلفون بتقييم سبعة أدوات لتعيين التصنيف التسلسلي للفطريات، باستثناء أداة واحدة قديمة تتطلب تعديلات كبيرة. قاموا بإنشاء 18 مجتمعًا وهميًا بتنوع في غنى الأنواع ووفرتها، تضم ما يصل إلى 165 نوعًا من الفطريات من شُعبتي…
-
فك الميتاجينوميات من خلال تسلسل القراءة الطويلة: مراجعة شاملة
2024 | المؤلف: Chan Kyung Kim وآخرون | المجلة: Journal of Translational Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في أبحاث المجتمع الميكروبي، مع تسليط الضوء بشكل خاص على الانتقال من تسلسل 16S rRNA وميتاجينوميات الشوتغن إلى تسلسل القراءة الطويلة (LRS). توفر LRS، التي تسهلها بشكل أساسي تقنيات من Pacific Biotechnologies (PacBio) وOxford Nanopore Technologies (ONT)، مزايا كبيرة مقارنة بتسلسل القراءة القصيرة (SRS) من خلال إنتاج قراءات…