الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: شبكات تنظيم الجينات
-
تمثيل الإجماع لرسوم بيانية متعددة للخلايا من مسارات الإشارات الجينية لتوصيف نوع الخلية
2025 | المؤلف: Yu‐An Huang وآخرون | المجلة: BMC Biology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يقدم القسم نظرة عامة على التحديات والتقدم في توضيح نوع الخلايا باستخدام تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). تعاني الطرق التقليدية من مشاكل مثل خصوصية العلامات وتأثيرات الدفعة، مما يعقد التعرف الدقيق على أنواع الخلايا بسبب تعقيد التفاعلات الخلوية وشبكات تنظيم الجينات. لمعالجة هذه التحديات، يقدم المؤلفون scMCGraph، وهو إطار حسابي جديد يدمج بيانات التعبير الجيني…
-
المحركات الشاملة للسرطان للنقائل
2025 | المؤلف: Ryan Lusby وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: التقنية الحيوية (Biotechnology)تتناول هذه الدراسة القضية الحرجة للانتقال، وهو سبب رئيسي لوفيات السرطان، من خلال استكشاف الآليات التنظيمية الجينية المعنية عبر أنواع متعددة من السرطان. باستخدام تحليل النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة من أكثر من 200 مريض يعانون من أورام انتقالية وغير انتقالية تمتد عبر ستة أنواع من السرطان، تحدد الأبحاث توقيع جيني أساسي تنبؤي يوضح…
-
GeneCompass: فك شفرة الآليات التنظيمية الجينية العالمية من خلال نموذج أساسي مستند إلى المعرفة عبر الأنواع
2024 | المؤلف: Xiaodong Yang وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على تطوير GeneCompass، وهو نموذج أساسي عبر الأنواع مصمم لتعزيز فهمنا لآليات تنظيم الجينات من خلال دمج البيانات من أكثر من 120 مليون ترانسكريبتوم أحادي الخلية من البشر والفئران. غالبًا ما تركز طرق البحث التقليدية على الكائنات الحية النموذجية الفردية، مما يحد من الرؤى حول الآليات التنظيمية العالمية. ومع ذلك، فإن التقدم…
-
استنتاج الشبكات التنظيمية للجينات من بيانات المولتيوم أحادي الخلية باستخدام بيانات خارجية على نطاق الأطلس
2024 | المؤلف: Qiuyue Yuan وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول القسم المعنون “نظرة عامة” المنهجيات والآثار المترتبة على استنتاج وظائف الجينات من خلال الأساليب الحسابية. ويبرز أهمية دمج مصادر البيانات البيولوجية المختلفة، مثل تسلسلات الجينوم، وملفات التعبير، وتفاعلات البروتين، لتعزيز دقة توقعات وظائف الجينات. يؤكد البحث على دور خوارزميات التعلم الآلي في معالجة هذه المجموعات المعقدة من البيانات، مما يسمح بتحديد وظائف الجينات التي…