الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: طافرة
-
الصمت العابر للتغيرات المفرطة يحافظ على ألفة خلايا B خلال الانفجار النسلي
Transient silencing of hypermutation preserves B cell affinity during clonal burstingفي هذا القسم، يستكشف المؤلفون عملية نضوج تقارب الأجسام المضادة في خلايا B المركز الجرثومي (GC)، مع التركيز على الطفرات المفرطة الجسدية (SHM) وتنظيمها أثناء التوسع الكلوني. يصفون كيف تخضع خلايا B المركز الجرثومي للطفرات في جيناتها المناعية، والتي تخضع بعد ذلك للاختيار بناءً على تقاربها مع المستضدات، مما يؤدي إلى زيادة عامة في التقارب…
-
دمج نماذج لغة البروتين والمصنع الحيوي التلقائي لتعزيز تطور البروتين
Integrating protein language models and automatic biofoundry for enhanced protein evolutionتقدم الدراسة نهجًا جديدًا في هندسة البروتينات يدمج التعلم الآلي وتقنيات البيوفوندري الآلية لتعزيز عملية التطور الموجه التقليدية. من خلال استخدام نموذج لغة البروتين ESM-2، طور الباحثون منصة تطور تلقائية تعمل ضمن نظام حلقة مغلقة، مما يسهل دورة التصميم-البناء-الاختبار-التعلم. تبدأ هذه النظام عملية التطور من خلال إجراء توقعات بدون عينة لـ 96 نوعًا من البروتينات،…
-
خريطة المشهد البيوكيميائي للروبيسكو
A map of the rubisco biochemical landscapeروبيسكو، الإنزيم الأساسي لثاني أكسيد الكربون في الغلاف الحيوي، يظهر حركيات بطيئة ويقدم تحديات لتحسينات الهندسة بسبب معاييره البيوكيميائية المعقدة. تقدم هذه الدراسة اختبارًا متوازيًا ضخمًا باستخدام سلالة مهندسة من *Escherichia coli* لاستكشاف منهجي لمشهد التسلسل-الوظيفة للروبيسكو من *Rhodospirillum rubrum*. من خلال تقييم أكثر من 99% من الطفرات أحادية الأحماض الأمينية تحت تركيزات مختلفة من…
-
تحوير الطفرات في مواقع التشبع لـ 500 مجال بروتين بشري
Site-saturation mutagenesis of 500 human protein domainsفي هذا القسم، يصف المؤلفون بناء مكتبة شاملة من متغيرات الأحماض الأمينية لمجالات البروتين البشري باستخدام تقنية التخليق الضخم المتوازي المستندة إلى الشرائح الدقيقة (mMPS). المكتبة، التي تُسمى Human Domainome 1، تتكون من 1,230,584 متغير عبر 1,248 مجال بروتين متنوع هيكليًا، مع تحويل كل موضع حمض أميني إلى جميع الأحماض الأمينية الأخرى الـ19. تشير نتائج…