الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: طي RNA
-
التفاعلات المؤقتة التي تتوسطها الأيونات تنظم دوران الوحدات الفرعية في الريبوسوم حقيقي النواة Transient ion-mediated interactions regulate subunit rotation in a eukaryotic ribosome
2026 | المؤلف: George Wanes وآخرون | المجلة: Proceedings of the National Academy of Sciences | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة دور الأيونات في طي RNA والتغيرات الشكلية، مع تسليط الضوء على نموذج نظري تم تطويره للتحقيق في هذه التفاعلات الأيونية العابرة. يعمل النموذج بدقة على مستوى الذرات ويشمل تمثيلًا مبسطًا للطاقة الحيوية الجزيئية، والكهرباء الساكنة الصريحة، ومجموعة متنوعة من الأيونات (K\(^+\)، Cl\(^-\)، Mg\(^{2+}\)). إنه يلتقط بشكل فعال البيئة الأيونية المعتمدة على التركيز…
-
تقييم شامل لنماذج اللغة الكبيرة في توقع الهيكل الثانوي للـ RNA Comprehensive benchmarking of large language models for RNA secondary structure prediction
2026 | المؤلف: Luciano I Zablocki وآخرون | المجلة: Briefings in Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في السنوات الأخيرة، اكتسب تطوير نماذج اللغة الكبيرة (LLMs) لـ RNA زخمًا، مستلهمًا من نجاحها في تحليل الحمض النووي والبروتين. تستخدم هذه النماذج بيانات RNA واسعة النطاق لتعلم تمثيلات عددية غنية دلاليًا لأسس RNA من خلال التعلم الذاتي. الفرضية الأساسية هي أن التمثيلات عالية الجودة لـ RNA يمكن أن تحسن بشكل كبير الأداء في المهام…
-
R2DT: منصة شاملة لتصور الهيكل الثانوي لـ RNA R2DT: a comprehensive platform for visualizing RNA secondary structure
2026 | المؤلف: Holly McCann وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على R2DT، حزمة البرمجيات التي تم تطويرها لتصور الهياكل الثانوية (2D) لـ RNA، والتي تعتبر ضرورية لفهم وظيفة RNA. النسخة الأحدث، R2DT 2.0، تقدم العديد من التحسينات الملحوظة، بما في ذلك القدرة على عرض بيانات محددة الموضع مثل تعدد أشكال النوكليوتيدات الفردية (SNPs) وتفاعلات SHAPE. علاوة على ذلك، يتميز R2DT…
-
NuFold: نهج شامل لتوقع الهيكل الثلاثي RNA مع تمثيل مرن لمركز القاعدة النووية
2025 | المؤلف: Yuki Kagaya وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تناقش هذه الفقرة الدور المحوري لـ RNA في العمليات البيولوجية، مع التأكيد على وظائفه كـ RNA رسول (mRNA) و RNAs غير المشفرة (ncRNAs). على الرغم من أهمية فهم الهياكل الثلاثية لـ RNA لتوضيح آلياتها الوظيفية، فإن التحديد التجريبي لهذه الهياكل محدود ويتطلب موارد كبيرة، مما يؤدي إلى فجوة كبيرة في البيانات الهيكلية المتاحة. لمعالجة هذه…