الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ميثيلation الحمض النووي
-
تفاعل الانتحار الثنائي والبيئة الدقيقة للورم عبر السرطانات: الآثار المترتبة على التنبؤ والاستجابات العلاجية
2025 | المؤلف: Shengshan Xu وآخرون | المجلة: BMC Cancer | المجال: طب الرئة والجهاز التنفسي (Pulmonary and Respiratory Medicine)التعرف الأخير على الديسولفيدبتوز كنوع متميز من موت الخلايا له آثار كبيرة على علاج السرطان، ومع ذلك فإن التحليل الشامل لجينات الديسولفيدبتوز (DRGs) عبر أنواع السرطان المختلفة كان غير كافٍ. استخدمت هذه الدراسة التحليل الجينومي، والتحليل النسخي، وتحليل المناعة، مع الاستفادة بشكل خاص من البيانات من أطلس جينوم السرطان (TCGA)، لكشف التغيرات الحرجة في تعبير…
-
ساعة إبيجينية قائمة على الدم تتنبأ بالقدرة الجوهرية على الوفاة وترتبط بالعوامل السريرية والمناعية ونمط الحياة
2025 | المؤلف: Matías Fuentealba وآخرون | المجلة: Nature Aging | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول قسم ورقة البحث تطوير ساعة القدرة الذاتية (IC)، وهي متنبئ جديد قائم على ميثيل الحمض النووي، والذي يشمل القدرات البدنية والعقلية للفرد. استخدمت الدراسة بيانات من مجموعة INSPIRE-T، التي تضم 1,014 مشاركًا تتراوح أعمارهم بين 20 و102 عامًا، لإنشاء هذا المتنبئ، الذي يستند إلى تقييمات سريرية شاملة لأبعاد صحية متنوعة، بما في ذلك الإدراك،…
-
تتبع النسائل مع الطفرات الجسدية يكشف ديناميات شيخوخة الدم
2025 | المؤلف: Michael Scherer وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يتناول المؤلفون قيود الطرق الحالية لتتبع مستنسخات الخلايا الجذعية أثناء التمايز، والتي غالبًا ما تتطلب تعديلات جينية أو تعتمد على متغيرات الحمض النووي الجسدية النادرة. يقدمون نهجًا جديدًا يستفيد من أنماط ميثلة الحمض النووي في مواقع CpG محددة، حيث تعكس مجموعة واحدة التمايز الخلوي وتخضع أخرى لتغيرات عشوائية في الميثيل، مما يعمل…
-
المستويات المنخفضة من السيلينيوم، والبروتين السيليني، وGPx3 مرتبطة بتسريع الشيخوخة البيولوجية: نتائج من دراسة الشيخوخة في برلين II (BASE-II)
2025 | المؤلف: Valentin Max Vetter وآخرون | المجلة: Clinical Epigenetics | المجال: التغذية وعلم الحميات (Nutrition and Dietetics)تستكشف هذه الدراسة العلاقة بين مؤشرات السيلينيوم الحيوية والشيخوخة البيولوجية، باستخدام بيانات من 1,568 مشاركًا أكبر سنًا في دراسة شيخوخة برلين II (متوسط العمر 68.8 سنة). تم تقييم العمر البيولوجي من خلال عمر الميثيل الحمضي النووي (DNAmA) وانحرافه عن العمر الزمني، والذي يُطلق عليه تسارع DNAmA (DNAmAA). قام الباحثون بقياس مستويات السيلينيوم في المصل باستخدام…
-
TRAPT: إطار عمل عميق متعدد المراحل للتعلم المدمج لتوقع المنظمات النسخية استنادًا إلى بيانات الإبيجينوم الواسعة النطاق
2025 | المؤلف: Guorui Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)إن تحديد المنظمين النسخيين التنظيميين (TRs) أمر حاسم لفهم التعبير الجيني في سياق ظهور الأمراض وتقدمها. تقدم هذه الدراسة أداة توقع نشاط المنظم النسخي (TRAPT)، وهي إطار تعلم عميق متعدد الوسائط مصمم لاستنتاج نشاط TR من خلال دمج الإمكانيات التنظيمية لعناصر التنظيم الجيني المستهدفة ومواقع الربط على مستوى الجينوم. تظهر النتائج التجريبية من 570 مجموعة…
-
تعزز البلعميات C1Q+ TPP1+ تقدم سرطان القولون من خلال ميثلة p53 المدفوعة بواسطة SETD8
2025 | المؤلف: Veronica Veschi وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم المناعة (Immunology)في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في آليات تعطيل وظيفة مثبط الورم p53 في سرطان القولون والمستقيم (CRC)، مع التركيز على دور الإنزيم SETD8، الذي يقوم بميثلة p53 عند الليسين 382 (p53 K382me1). تستخدم الأبحاث منهجيات متنوعة، بما في ذلك الفحوصات النسيجية المرضية، تسلسل RNA، ونماذج حيوانية قبل السريرية، لتحليل تعبير SETD8 و p53 K382me1 في…
-
تحديد N6-methyladenine باستخدام التعلم العميق ودمج الميزات التمييزية
2025 | المؤلف: Salman Khan وآخرون | المجلة: BMC Medical Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم ورقة البحث Deep-N6mA، وهو نموذج جديد للشبكات العصبية العميقة (DNN) مصمم للتعرف الدقيق على مواقع N6-methyladenine (6 m A) في تسلسلات الحمض النووي، والتي تعتبر حاسمة للتنظيم الجيني والتعبير الجيني. يستخدم النموذج نهج استخراج ميزات هجين يدمج ميزات مختلفة قائمة على التسلسل، بما في ذلك k-mer، وDinucleotide-based Cross Covariance (DCC)، وTrinucleotide-based Auto Covariance (TAC)،…
-
ذاكرة وراثية مستمرة للقاح mRNA لـ SARS-CoV-2 في البلعميات المشتقة من وحيدات النوى
2025 | المؤلف: Alexander Simonis وآخرون | المجلة: Molecular Systems Biology | المجال: علم المناعة (Immunology)تبحث هذه الدراسة في دور لقاحات mRNA في إنشاء ذاكرة مناعية من خلال تعديلات فوق جينية في خلايا المناعة الفطرية، وتحديداً البلعميات المشتقة من أحادية النواة البشرية. وجد الباحثون أن تطعيم mRNA ضد SARS-CoV-2 يزيد بشكل كبير من أسيتيل الهيستون H3 ليسين 27 (H3K27ac) في مناطق المحفز، مما يشير إلى تشكيل ذاكرة فوق جينية. ومن…
-
تحقق متعدد المراكز مستقبلي من منصة للتوصيف الجزيئي السريع لأورام الجهاز العصبي المركزي
2025 | المؤلف: Areeba Patel وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الوراثة (Genetics)تقدم ورقة البحث تحققًا متعدد المراكز لـ Rapid-CNS 2، وهو سير عمل مبتكر لتسلسل النانو المسامي مصمم للتوصيف الجزيئي السريع لأورام الجهاز العصبي المركزي (CNS). تواجه الفحوصات التشخيصية التقليدية تحديات مثل التكاليف العالية، التعقيد الفني، وأوقات الاستجابة المطولة. بالمقابل، يمكّن Rapid-CNS 2 من تصنيف الميثيل في الوقت الحقيقي وتحليل عدد نسخ الحمض النووي ضمن نافذة…
-
تسلسل القراءة الطويل يعزز اكتشاف التغيرات المرضية والجديدة في المرضى الذين يعانون من أمراض نادرة
2025 | المؤلف: Shruti Sinha وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)يستعرض قسم “الطرق” الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. يوضح اختيار المشاركين، بما في ذلك معايير الإدراج والاستبعاد، بالإضافة إلى حسابات حجم العينة لضمان القوة الإحصائية. استخدمت الدراسة تصميم تجربة عشوائية محكومة، حيث تم توزيع المشاركين على مجموعة العلاج أو مجموعة التحكم. شملت جمع البيانات تقييمات وقياسات موحدة، تم إجراؤها في البداية وفي فترات المتابعة.…