الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: RNA، دليل، أنظمة CRISPR-Cas

يتم إعاقة القطع العابر لـ CRISPR-Cas9 بواسطة حلقة R محاطة، وموصل مطول، ونطاق HNH غير النشط

2026 | المؤلف: Roser Montagud‐Martínez وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذه الدراسة، يبحث المؤلفون في الآليات التي تعالج بها Cas9 الحمض النووي أحادي السلسلة poly(T) بطريقة موجهة بواسطة RNA. يحددون عدة عوامل حاسمة تؤثر على هذه النشاطات التقطيعية. من الجدير بالذكر أن وجود حلقات R غير المحاطة على الجانب 5′ من RNA يعزز من التقطيع التبادلي عند استهداف الحمض النووي مزدوج السلسلة القصير. على…
تحسين إزالة الجينات في الجسم الحي بدقة عالية باستخدام sgRNAs متعددة الأهداف من Cas12a

2026 | المؤلف: Fillip Port وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذه الدراسة، يتناول المؤلفون قيود تقنية كريسبر (CRISPR) في تعطيل الجينات باستخدام نوكلياز كريسبر، مثل وجود رنا مرشد فردي (sgRNAs) غير مثالي، ومواقع مستهدفة غير قابلة للوصول، ونتائج إصلاح غير مرغوب فيها. يقدمون نظامًا يعتمد على Cas12a في ذبابة الفاكهة (Drosophila) يستخدم أربعة sgRNAs لكل جين لتعزيز فعالية استهداف الجينات. تستفيد هذه الطريقة المتعددة…
CRISPR-GPT لأتمتة تجارب تحرير الجينات

2025 | المؤلف: Yuanhao Qu وآخرون | المجلة: Nature Biomedical Engineering | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يقدم القسم CRISPR-GPT، وهو نظام متقدم لوكيل نموذج لغة كبير (LLM) مصمم لتعزيز تجارب تحرير الجينات المعتمدة على CRISPR. إدراكًا للقيود التي تواجه نماذج LLM التقليدية في معالجة التحديات البيولوجية المحددة، يدمج CRISPR-GPT قدرات التفكير لتفكيك المهام المعقدة، واتخاذ القرارات، والتعاون التفاعلي بين البشر والذكاء الاصطناعي. النظام مزود بخبرة في المجال، وتقنيات استرجاع، وأدوات خارجية،…
تصميم البروتين الموجه بالتطور لـ IscB من أجل تحرير الجينوم المستمر في الجسم الحي

2025 | المؤلف: Soumya Kannan وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تشير الأبحاث إلى أن الطفرات النقطية تؤثر عادةً على قوة ارتباط البروتينات بالحمض النووي، ومع ذلك لا تغير بشكل كبير من الارتباط التفاضلي بين تسلسلات الحمض النووي المستهدفة وغير المستهدفة. تشير هذه النتيجة إلى أنه بينما يمكن أن تؤثر الطفرات على قوة تفاعلات الارتباط، فإن خصوصية الارتباط تظل مستقرة نسبيًا. هذه الرؤى ضرورية لفهم آليات…
بناء مكتبات CRISPR متعددة الأهداف في الطماطم للتغلب على التكرار الوظيفي على مستوى الجينوم

2025 | المؤلف: Amichai Berman وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يتناول هذا القسم قيود طرق الطفرات التقليدية في برامج التربية وفحص الطفرات، لا سيما فيما يتعلق بالتكرار الجيني وعدم القدرة على استهداف جينات معينة. بينما تقدم تقنية CRISPR-Cas9 تحريرًا دقيقًا للجينات، واجهت تطبيقاتها في تحسين المحاصيل تحديات في قابلية التوسع. تتناول هذه الدراسة هذه القضايا من خلال تطوير مكتبات CRISPR متعددة الأهداف على مستوى الجينوم…
التوصيل الفيروسي لمحرر الجينوم الموجه بواسطة RNA لتحرير الخط الجرثومي بدون نقل جينات في الأرابيدوبسيس

2025 | المؤلف: Trevor Weiss وآخرون | المجلة: Nature Plants | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تناقش هذه الفقرة التقدم في تحرير الجينوم داخل علم الأحياء النباتية، مع تسليط الضوء على التحديات المرتبطة بتوصيل أنظمة التحرير إلى النباتات. غالبًا ما تكون الطرق التقليدية، مثل زراعة الأنسجة والتحويل، بطيئة وتعتمد على النمط الجيني، مما يتطلب إجراءات معقدة لتحقيق تعديلات خالية من الجينات المنقولة. يقترح المؤلفون حلاً مبتكرًا من خلال هندسة فيروس رattle…
تصوير RNA للخلايا الحية بجزيء واحد باستخدام CRISPR–Csm

2025 | المؤلف: Chenglong Xia وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

قسم “طرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والأساليب التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة منهجية كمية، تتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات المجمعة من مصادر متنوعة. تم تطبيق تقنيات محددة، مثل تحليل الانحدار واختبار الفرضيات، لتحديد العلاقات بين المتغيرات ذات الأهمية. شملت عملية جمع البيانات عملية أخذ عينات منهجية، مما يضمن عينة تمثيلية…
الحاجز الطوبولوجي لتنشيط Cas12a بواسطة الهياكل النانوية الدائرية يسهل التحفيز الذاتي ويحول استشعار الحمض النووي/الحمض النووي الريبي

2024 | المؤلف: Fei Deng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تناقش هذه الفقرة أهمية التحكم في قطع CRISPR/Cas12a من أجل تقدم أجهزة الاستشعار الحيوية. يظهر المؤلفون أن الهياكل النانوية الدائرية الصغيرة من الحمض النووي، التي تكمل جزئيًا تسلسلات RNA الدليل، تظهر تفعيلًا ضئيلًا لبروتينات Cas12a الريبونوكليوبروتينية. ومع ذلك، عندما يتم تسطيح هذه الهياكل، فإنها تستعيد التفعيل. تؤدي هذه النتيجة إلى تطوير نظام تفاعل تضخيم الحمض…
جزيئات فيروسية مصممة للتوصيل المؤقت لمجمعات ريبونوكليوبروتين المحرر الرئيسي في الجسم الحي

2024 | المؤلف: Meirui An وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

قسم “الطرق” يحدد الإجراءات التجريبية والتحليلية المستخدمة في الدراسة. استخدم الباحثون مزيجًا من الأساليب الكمية والنوعية لجمع البيانات، مما يضمن تحليلًا شاملاً لسؤال البحث. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب محكومة، وتحليلات إحصائية، وتقنيات نمذجة، والتي تم اختيارها لتعزيز موثوقية وصحة النتائج. شمل جمع البيانات استخدام أدوات وبروتوكولات موحدة لتقليل التحيز وضمان الاتساق عبر التجارب. تشمل الطرق…