الأبحاث ضمن الموضوع : علم النسخ الجيني أحادي الخلية والمكاني
-
فك شفرة الميكروبيئة المناعية للورم: رؤى من النسخ الجيني أحادي الخلية والمكاني حول الخلايا الليفية لسرطان عنق الرحم
2025 | المؤلف: Zhiheng Lin وآخرون | المجلة: Journal of Experimental & Clinical Cancer Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)**نظرة عامة** يستمر سرطان عنق الرحم (CC) في كونه تحديًا صحيًا عالميًا كبيرًا، متأثرًا بتنوع الأورام ودور الخلايا الليفية المرتبطة بالسرطان (CAFs) في تقدم المرض ومقاومة العلاج. تستخدم هذه الدراسة منهجيات متقدمة، بما في ذلك تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq)، والترانسكريبتوميات المكانية، وتحليل التفكيك، لاستكشاف البيئة المناعية للورم (TIME) في CC. من خلال…
-
يكشف الجينوم الفردي عن إعادة برمجة البيئة الدقيقة المناعية خلال الانتقال من MASH إلى HCC
2025 | المؤلف: Yu Huang وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تدرس الدراسة التغيرات المناعية المرتبطة بالانتقال من التهاب الكبد الدهني المرتبط بالخلل الأيضي (MASH) إلى سرطان الكبد (HCC). باستخدام نموذج الفأر STAM، قام الباحثون بإجراء تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) على خلايا CD45+ من أنسجة MASH وHCC، مدعومًا بتقنيات تدفق الخلايا والمناعة النسيجية المتعددة للتحقق. وقد حددوا 23 مجموعة رئيسية تمثل تسع مجموعات…
-
تحليل متعدد الجوانب لمرض الكلى البشري يحدد نمط خلايا أنبوبية التهابية وقابلة للتليف
2025 | المؤلف: Maximilian Reck وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستكشف الدراسة دور خلايا الظهارة الأنبوبية القريبة (PT) غير التكيفية في تقدم مرض الكلى المزمن (CKD)، مع التركيز على حالاتهم المعقدة ضمن بيئة ليفية. من خلال دمج تسلسل RNA أحادي النواة (snRNA-seq) وATAC-seq مع تصوير جزيئي عالي التعدد للخلايا الفردية، أنشأ الباحثون أطلسًا متعدد الأبعاد لمكان حدوث مرض الكلى البشري. وقد حددوا مجموعة فرعية محددة…
-
تتبع النسائل مع الطفرات الجسدية يكشف ديناميات شيخوخة الدم
2025 | المؤلف: Michael Scherer وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يتناول المؤلفون قيود الطرق الحالية لتتبع مستنسخات الخلايا الجذعية أثناء التمايز، والتي غالبًا ما تتطلب تعديلات جينية أو تعتمد على متغيرات الحمض النووي الجسدية النادرة. يقدمون نهجًا جديدًا يستفيد من أنماط ميثلة الحمض النووي في مواقع CpG محددة، حيث تعكس مجموعة واحدة التمايز الخلوي وتخضع أخرى لتغيرات عشوائية في الميثيل، مما يعمل…
-
CellFM: نموذج أساسي على نطاق واسع تم تدريبه مسبقًا على النسخ الجيني لـ 100 مليون خلية بشرية
2025 | المؤلف: Yuansong Zeng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول القسم التقدمات والتحديات في تسلسل الخلايا الفردية، مع التركيز بشكل خاص على تطوير نموذج أساسي جديد للخلايا الفردية (CellFM) مصمم لمعالجة قضايا مثل ضوضاء البيانات، وتأثيرات الدفعة، والندرة التي تعاني منها الأساليب التحليلية الحالية. على الرغم من ظهور أدوات مختلفة تهدف إلى تحليل بيانات الخلايا الفردية، فإن فعاليتها تتناقص مع مجموعات البيانات الجديدة وأحجام…
-
التقدم في النسخ الجيني المكاني وتطبيقه في نظام الهيكل العظمي العضلي
2025 | المؤلف: Haoyu Wang وآخرون | المجلة: Bone Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تستعرض هذه القسم التقدمات في علم النسخ الجيني المكاني (ST) وتطبيقاته ضمن النظام العضلي الهيكلي، مع تسليط الضوء على أهميته في فهم التباين الخلوي والتفاعلات بين الخلايا التي قد تتجاهلها طرق تسلسل RNA التقليدية. يستعرض المراجعة تقنيات مختلفة لجمع البيانات، مع التركيز على الاختراقات التكنولوجية الحديثة وتقديم سير عمل لدمج ST في أبحاث النظام العضلي…
-
أطلس خلوية متكامل للتعبير الجيني للأورغانويدات المشتقة من الأديم الباطن البشري
2025 | المؤلف: Quan Xu وآخرون | المجلة: Nature Genetics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، لم تتطلب الطرق التجريبية المستخدمة موافقة من لجنة الأخلاقيات، مما يشير إلى أن البحث قد شمل مواضيع غير بشرية أو استخدم بيانات لم تتطلب إشرافًا أخلاقيًا. إن غياب مثل هذه الموافقة يشير إلى نهج مبسط في المنهجية، مع التركيز المحتمل على التحليلات الحاسوبية أو النظرية بدلاً من التجارب المباشرة على البشر أو…
-
تحليل الجينوم والتعبير الجيني للخلايا الفردية لخلل تنسج القشرة البؤري الموزائي
2025 | المؤلف: Sara Baldassari وآخرون | المجلة: Nature Neuroscience | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يحدد قسم المنهجية النهج المنهجي المستخدم في البحث. يوضح تصميم التجربة، بما في ذلك اختيار المشاركين، وتقنيات جمع البيانات، وإجراءات التحليل. يتم وصف الأدوات والأجهزة المحددة المستخدمة في القياس، مما يضمن إمكانية إعادة إنتاج النتائج وموثوقيتها. تم إجراء تحليلات إحصائية لتقييم البيانات، مع تطبيق الاختبارات المناسبة بناءً على طبيعة المتغيرات المعنية. يبرز القسم أهمية الالتزام…
-
النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة يكشف كيف تتكيف أنسجة الجذور مع إجهاد التربة
2025 | المؤلف: Mingyuan Zhu وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام خط الأرز Xkitaake، الذي تم تحويله بجين XA21، جنبًا إلى جنب مع خط Kitaake غير المحوّر للتحقيق في اتجاهات التعبير الجيني من خلال تسلسل RNA أحادي الخلية (scRNA-seq). خضعت بذور الأرز لعملية تعقيم صارمة وتم إنباتها في ظروف محكومة قبل نقلها إلى بيئات نمو قائمة على الجل أو التربة. كانت…
-
تقييم نماذج خلايا الأساس لتوقع RNA-seq بعد الاضطراب
2025 | المؤلف: Gerold Csendes وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يؤكد المؤلفون على الحاجة الملحة للتنبؤات الدقيقة للاستجابات الخلوية للت perturbations لتعزيز فهمنا لسلوك الخلايا في حالات مختلفة. يشيرون إلى ندرة بيانات الاضطراب مقارنة ببيانات الخلايا الأساسية، مما أدى إلى تطوير نماذج خلوية أساسية تستخدم بيانات التعبير الجيني على مستوى الخلية الواحدة على نطاق واسع. هذه النماذج، بما في ذلك scGPT و…