يقدم القسم scNiche، وهو إطار عمل حسابي جديد مصمم لتحديد وتوصيف أماكن الخلايا من بيانات الأوميكس المكانية بدقة خلوية فردية. يقارن المؤلفون scNiche ضد كل من مجموعات البيانات المحاكاة والبيولوجية، مما يظهر أدائه المتفوق في تحديد أماكن الخلايا بفعالية مقارنة بالطرق الحالية. ومن الجدير بالذكر أن scNiche يكشف عن تأثير البيئة الدقيقة على الأنماط الخلوية…

تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في علم النسخ الجيني المكاني، الذي يسمح بتقدير التعبير الجيني في إحداثيات مكانية محددة داخل الأنسجة، مما يعزز فهمنا لآليات الأمراض. يبرز المؤلفون إمكانية استخدام صور الهستولوجيا الملونة بالهيماتوكسيليين والإيوزين (H&E) بتكلفة منخفضة للتنبؤ بالتعبير الجيني المكاني، مع معالجة التكاليف العالية المرتبطة بتقنيات النسخ الجيني المكاني الحالية (SRT).…

يقدم هذا القسم STAIG، وهو نموذج جديد للتعلم العميق تم تطويره لعلم النسخ الجيني المكاني، والذي يعد حيوياً لتحليل الهياكل الخلوية والتفاعلات داخل المجالات المكانية. يدمج STAIG بفعالية البيانات متعددة الأنماط، بما في ذلك التعبير الجيني، والإحداثيات المكانية، والصور النسيجية، باستخدام التعلم التبايني القائم على الرسوم البيانية جنباً إلى جنب مع تقنيات استخراج الميزات المتقدمة.…