الأبحاث ضمن الموضوع : هيكل الإنزيم ووظيفته




  • اكتشاف المحلل الانتقائي KRAS(G12D) ASP3082

    2025 | المؤلف: Tomohiro Yoshinari وآخرون | المجلة: Communications Chemistry | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)

    تركز الأبحاث على جين السرطان الفيروسي المتماثل مع KRAS، وهو جين سرطاني متحور بشكل متكرر في أنواع مختلفة من السرطانات، مع تسليط الضوء بشكل خاص على طفرة KRAS(G12D)، التي تعد الأكثر انتشارًا. بينما تم تطوير والتحقق من عدة مثبطات تساهمية تستهدف طفرة KRAS(G12C)، لم يتم الموافقة على أي علاجات لغيرها من الطفرات، بما في ذلك…

  • التصميم الحسابي الكامل لإنزيمات إزالة كيمب عالية الكفاءة

    2025 | المؤلف: Dina Listov وآخرون | المجلة: Nature | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)

    تقدم البحث سير عمل حسابي جديد لتصميم إنزيمات فعالة، تستهدف بشكل خاص طيات TIM-barrel، التي واجهت تقليديًا تحديات في تحقيق معدلات تحفيزية مقارنة بالإنزيمات الطبيعية. كانت التصاميم الحسابية السابقة تتطلب تحسينات تجريبية واسعة، مما أدى إلى كفاءات تحفيزية منخفضة. يُبلغ المؤلفون عن التصميم الناجح لثلاثة إنزيمات كيمب مع كفاءات تتجاوز 2,000 M\(^{-1}\)s\(^{-1}\)، حيث أظهر المتغير…

  • GōMartini 3: من التغيرات الشكلية الكبيرة في البروتينات إلى تصحيحات التحيز البيئي

    2025 | المؤلف: Paulo C. T. Souza وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: كيمياء المواد (Materials Chemistry)

    تقدم هذه القسم نظرة عامة على التقدم في النمذجة ذات الحبيبات الخشنة، مع التركيز بشكل خاص على نموذج GōMartini المحسن، الذي يدمج تنفيذ المواقع الافتراضية لنموذج Gō مع إطار عمل Martini 3. يهدف هذا النموذج إلى تحسين الكفاءة الحسابية مع تمثيل ديناميات البروتين بدقة عبر سياقات بيولوجية متنوعة. يبرز البحث الاختبارات الواسعة التي أجرتها المجتمع…