اللعاب مقابل مسحات الآفة لتشخيص PCR لفيروس mpox من النوع Ib في أوغندا: دراسة مستقبلية متطابقة في المستشفى Saliva versus lesion swabs for PCR diagnosis of acute-phase clade Ib mpox in Uganda: a prospective matched hospital cohort study

شارك:
المجلة: The Lancet Microbe، المجلد: 7، العدد: 8
DOI: https://doi.org/10.1016/j.lanmic.2026.101395
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42372777
تاريخ النشر: 2026-06-29
المؤلف: Jennifer Serwanga وآخرون
الموضوع الرئيسي: أبحاث فيروس الجدري وتفشيه

نظرة عامة

في سياق تفشي سلالة Ib من مرض جدري القرود بين السكان المتأثرين بفيروس نقص المناعة البشرية في شرق ووسط إفريقيا، كان الهدف من هذه الدراسة هو تقييم الأداء التشخيصي لأنواع مختلفة من العينات – البلازما، اللعاب، العينات التناسلية، الشرجية، وعينات الجلد – خلال مرحلة الطفح الحاد من العدوى. تم إجراء دراسة جماعية مستقبلية شملت 155 بالغًا تم إدخالهم إلى المستشفى مع اشتباه في الإصابة بجدري القرود في مستشفى الإحالة الوطني لجدري القرود في أوغندا، حيث تم جمع 836 عينة سريرية. وجدت الدراسة أنه في مجموعة مطابقة من 80 مشاركًا، أظهر اللعاب (98% إيجابية)، وعينات الجلد (98%)، والعينات التناسلية (96%) عوائد تشخيصية عالية، بينما أظهرت البلازما حساسية أقل بشكل ملحوظ (43%).

تشير النتائج إلى أن اللعاب يمكن أن يكون بديلاً قابلاً للتطبيق لأخذ عينات من الآفات، خاصة في الحالات التي تكون فيها أخذ العينات مؤلمة أو صعبة من الناحية التشغيلية. في المتابعة بعد ثلاثة أشهر، كانت DNA MPXV المستمرة نادرة، وتم ملاحظتها بشكل أساسي في الأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. أكدت جميع الجينومات المتسلسلة تخصيص سلالة Ib. تؤكد هذه النتائج على إمكانية استخدام اللعاب كعينة تشخيصية ذات عائد مرتفع خلال المرحلة الحادة من جدري القرود من سلالة Ib، على الرغم من الحاجة إلى مزيد من البحث لتقييم فعاليتها في المراحل المبكرة من العدوى.

مقدمة

تسلط مقدمة ورقة البحث الضوء على أزمة الصحة العامة المستمرة التي يسببها جدري القرود في شرق ووسط إفريقيا، وخاصة بسبب سلالتي I وIb الناشئة. أدى التفشي في أوغندا، الذي بدأ في يوليو 2024 واستمر حتى 2026، إلى 8,359 حالة مؤكدة و50 حالة وفاة اعتبارًا من 5 نوفمبر 2025، مما أثر بشكل أساسي على المناطق ذات الكثافة السكانية العالية مثل كمبالا وواكيزو. ومن الجدير بالذكر أن جزءًا كبيرًا من المرضى الذين تم إدخالهم إلى المستشفى (48%) كانوا من الأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية، حيث غالبًا ما يظهر المرض من خلال آفات تناسلية وموكوس جلدية.

تؤكد الممارسات التشخيصية الحالية، التي تستند أساسًا إلى تفشي سلالة II، على أهمية مواد الآفات لتأكيد PCR، والتي يمكن أن تكون مؤلمة وصعبة للمرضى. للتخفيف من هذه المشكلات، تم استكشاف طرق أخذ عينات بديلة، مثل مسحات الحلق والبلعوم، على الرغم من وجود نقص في الدراسات المستقبلية التي تركز على أخذ عينات اللعاب خلال تفشي سلالة I أو Ib. تؤكد الورقة على إمكانية استخدام اللعاب كعينة تشخيصية، نظرًا لحمولتها العالية من DNA MPXV وحساسيتها الأكبر مقارنةً بالعينات البلعومية في سياقات معينة. قام المؤلفون بإجراء تسلسل الفيروسات لتأكيد إصابات سلالة Ib في مجموعتهم الأوغندية، مما يسهل تحليلًا محددًا للسلالة لحمولة DNA الفيروسية ويدعو لاستخدام عينات غير جراحية مثل اللعاب لتحسين قبول التشخيص وقابلية التوسع.

طرق البحث

توضح قسم “الطرق” في ورقة البحث التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في أسئلة البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، يتضمن تحليلات إحصائية لتقييم البيانات المجمعة. تم اختيار المشاركين من خلال طريقة أخذ عينات طبقية لضمان التمثيل عبر الفئات الديموغرافية الرئيسية. شملت عملية جمع البيانات أدوات وبروتوكولات موحدة للحفاظ على الموثوقية والصلاحية.

تم إجراء التحليل باستخدام أدوات برمجية سهلت تطبيق اختبارات إحصائية متنوعة، بما في ذلك اختبارات t وANOVA، لتقييم الفروق بين المجموعات. بالإضافة إلى ذلك، تم إجراء تحليلات انحدار لاستكشاف العلاقات المحتملة بين المتغيرات. تم تحديد مستوى الدلالة عند p < 0.05، مما يضمن أن النتائج كانت قوية إحصائيًا. بشكل عام، تم تصميم الإطار المنهجي لمعالجة الفرضيات المطروحة في الدراسة بدقة، مما يوفر أساسًا قويًا للنتائج المقدمة في الأقسام اللاحقة.

النتائج

في هذه الدراسة، تم تسجيل 155 بالغًا تم إدخالهم إلى المستشفى مع تشخيص سريري لجدري القرود، حيث قدم 145 منهم بيانات ديموغرافية كاملة. كانت المجموعة ذات متوسط عمر 30 عامًا، وكانت في الغالب من الذكور، وتقيم بشكل أساسي في كمبالا وواكيزو، وهما منطقتان مركزيتان لتفشي سلالة Ib في أوغندا. ومن الجدير بالذكر أن 48% من المشاركين كانوا إيجابيين لفيروس نقص المناعة البشرية. أظهر جميع المشاركين أعراضًا عند القبول، حيث كان الطفح الجلدي المخاطي والحمى من أكثر الميزات السريرية شيوعًا. لوحظت معدلات إيجابية عالية لـ PCR في الأقسام المخاطية، وخاصة العينات التناسلية (98%)، وعينات الجلد (98%)، واللعاب (96%)، بينما كانت إيجابية البلازما أقل بكثير (44%). يشير هذا إلى عبء فيروسي كبير في الأقسام المخاطية خلال المرحلة الحادة من المرض، حيث أظهرت PCR البلازما فائدة محدودة لتأكيد الحالة.

أظهرت عينات المتابعة بعد حوالي ثلاثة أشهر انخفاضًا حادًا في اكتشاف DNA MPXV، مع استمرار الإيجابية بشكل رئيسي بين الأفراد المصابين بفيروس نقص المناعة البشرية. أشار التحليل إلى أن العينات المخاطية أظهرت توافقًا قويًا عبر الأقسام، بينما أظهرت عينات البلازما توافقًا ضعيفًا مع الأقسام المخاطية، مما يشير إلى أن المواقع المخاطية أكثر موثوقية لتشخيص العدوى النشطة. أكدت تسلسلات الجينوم الكامل للعينات الإيجابية لـ PCR من MPXV الحادة المختارة أن المجموعة تمثل تفشيًا متجانسًا من سلالة Ib، دون وجود دليل على اختلاط السلالات. تؤكد هذه النتائج على أهمية أخذ عينات من الأقسام المخاطية في تشخيص جدري القرود وتسلط الضوء على الآثار المحتملة لمراقبة استمرار الفيروس في المرضى المثبطين للمناعة.

المناقشة

في هذه الدراسة، بحثنا في الفائدة التشخيصية لللعاب وغيرها من العينات غير الآفات خلال المرحلة الحادة من جدري القرود من سلالة Ib في أوغندا. تكشف نتائجنا أن اللعاب والعينات التناسلية والجلدية أظهرت إيجابية PCR شبه عالمية مع توافق قوي في قيم العتبة الدورية (Ct)، مما يشير إلى إشارة فيروسية مخاطية مشتركة خلال المرض المتقدم. بالمقابل، أظهرت عينات البلازما حساسية أقل بكثير وتوافقًا ضعيفًا مع الأقسام المخاطية، مما يشير إلى أنه لا ينبغي الاعتماد على البلازما لتأكيد الإصابة بجدري القرود بشكل روتيني. تدعو هذه النتائج إلى إعطاء الأولوية لللعاب أو مسحات الآفات كعينات تشخيصية من الخط الأول خلال مرحلة الطفح، خاصة في البيئات التي قد تكون فيها أخذ العينات مؤلمة أو غير عملية.

تسلط الدراسة أيضًا الضوء على أهمية التشخيص الموجه نحو المريض، حيث يوفر أخذ عينات اللعاب بديلاً غير جراحي يمكن أن يعزز الوصول إلى الاختبار، خاصة في السكان ذوي انتشار فيروس نقص المناعة البشرية العالي. بينما تدعم بياناتنا إدراج اللعاب في خوارزميات التشخيص لجدري القرود من سلالة Ib، هناك حاجة إلى مزيد من البحث لتقييم أدائه في المراحل المبكرة من العدوى وفي الحالات المدارة مجتمعيًا. تشمل القيود تركيز المجموعة على المرضى الذين تم إدخالهم إلى المستشفى، مما قد يؤثر على قابلية التعميم، وغياب البيانات حول الحالة المناعية، والتي يمكن أن تؤثر على استمرار الفيروس. بشكل عام، توفر نتائجنا رؤى حاسمة لتحسين استراتيجيات التشخيص لجدري القرود في التفشي الإفريقي، مما يبرز الحاجة إلى تحديث الإرشادات التي تتضمن اللعاب جنبًا إلى جنب مع مسحات الآفات التقليدية.

Journal: The Lancet Microbe, Volume: 7, Issue: 8
DOI: https://doi.org/10.1016/j.lanmic.2026.101395
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/42372777
Publication Date: 2026-06-29
Author(s): Jennifer Serwanga et al.
Primary Topic: Poxvirus research and outbreaks

Overview

In the context of the expanding clade Ib mpox outbreak among HIV-affected populations in East and Central Africa, this study aimed to evaluate the diagnostic performance of various specimen types—plasma, saliva, genital, anal, and skin swabs—during the acute rash phase of the infection. A prospective cohort study involving 155 adults hospitalized with suspected mpox was conducted at Uganda’s national mpox referral hospital, where 836 clinical specimens were collected. The study found that in a matched subset of 80 participants, saliva (98% positivity), skin swabs (98%), and genital swabs (96%) demonstrated high diagnostic yields, while plasma showed significantly lower sensitivity (43%).

The results indicate that saliva can serve as a viable alternative to lesion sampling, particularly in situations where lesion sampling is painful or operationally challenging. At the three-month follow-up, persistent MPXV DNA was rare, primarily observed in individuals with HIV. All sequenced genomes confirmed clade Ib assignment. These findings underscore the potential of saliva as a high-yield diagnostic specimen during the acute phase of clade Ib mpox, although further research is necessary to assess its efficacy in earlier stages of infection.

Introduction

The introduction of the research paper highlights the ongoing public health crisis posed by Mpox in East and Central Africa, particularly due to the clade I and emergent clade Ib lineages. The outbreak in Uganda, which began in July 2024 and persisted into 2026, has led to 8,359 confirmed cases and 50 deaths as of November 5, 2025, primarily affecting densely populated areas like Kampala and Wakiso. Notably, a significant portion of hospitalized patients (48%) were individuals living with HIV, with the disease often manifesting through genital and mucocutaneous lesions.

Current diagnostic practices, primarily based on clade II outbreaks, emphasize lesion material for PCR confirmation, which can be painful and challenging for patients. To mitigate these issues, alternative sampling methods, such as throat and oropharyngeal swabs, have been explored, although there is a lack of prospective studies focusing on saliva sampling during clade I or Ib outbreaks. The paper underscores the potential of saliva as a diagnostic specimen, given its higher MPXV DNA loads and greater sensitivity compared to oropharyngeal specimens in certain contexts. The authors conducted viral sequencing to confirm clade Ib infections in their Ugandan cohort, facilitating a clade-specific analysis of viral DNA burden and advocating for the use of non-invasive specimens like saliva for improved diagnostic acceptability and scalability.

Methods

The “Methods” section of the research paper outlines the experimental design and analytical techniques employed to investigate the research questions. The study utilized a quantitative approach, incorporating statistical analyses to evaluate the data collected. Participants were selected through a stratified sampling method to ensure representation across key demographics. Data collection involved standardized instruments and protocols to maintain reliability and validity.

The analysis was conducted using software tools that facilitated the application of various statistical tests, including t-tests and ANOVA, to assess differences between groups. Additionally, regression analyses were performed to explore potential relationships among variables. The significance level was set at p < 0.05, ensuring that findings were statistically robust. Overall, the methodological framework was designed to rigorously address the hypotheses posed in the study, providing a solid foundation for the results presented in subsequent sections.

Results

In this study, 155 adults hospitalized with clinically diagnosed mpox were enrolled, with 145 providing complete demographic data. The cohort had a median age of 30 years, was predominantly male, and primarily resided in Kampala and Wakiso, areas central to Uganda’s clade Ib outbreak. Notably, 48% of participants were HIV-positive. All participants exhibited symptoms upon admission, with mucocutaneous rash and fever being the most common clinical features. High PCR positivity rates were observed in mucocutaneous compartments, particularly genital swabs (98%), skin swabs (98%), and saliva (96%), while plasma positivity was significantly lower (44%). This indicates a substantial mucocutaneous viral burden during the acute phase of the disease, with plasma PCR showing limited utility for case confirmation.

Follow-up sampling at approximately three months revealed a sharp decline in MPXV DNA detection, with persistent positivity predominantly among HIV-positive individuals. The analysis indicated that mucocutaneous samples showed strong concordance across compartments, while plasma samples exhibited poor agreement with mucocutaneous compartments, suggesting that mucocutaneous sites are more reliable for diagnosing active infection. Whole-genome sequencing of selected acute MPXV PCR-positive specimens confirmed that the cohort represents a virologically homogeneous clade Ib outbreak, with no evidence of clade admixture. These findings underscore the importance of mucocutaneous sampling in diagnosing mpox and highlight potential implications for monitoring viral persistence in immunocompromised patients.

Discussion

In this study, we investigated the diagnostic utility of saliva and other non-lesion specimens during the acute phase of clade Ib monkeypox (mpox) in Uganda. Our findings reveal that saliva, genital, and skin specimens exhibited near-universal PCR positivity with strong concordance in cycle threshold (Ct) values, indicating a shared mucocutaneous viral signal during established disease. In contrast, plasma samples demonstrated significantly lower sensitivity and poor agreement with mucocutaneous compartments, suggesting that plasma should not be relied upon for routine confirmation of mpox infection. These results advocate for prioritizing saliva or lesion swabs as first-line diagnostic specimens during the rash phase, particularly in settings where lesion sampling may be painful or impractical.

The study also highlights the importance of patient-centered diagnostics, as saliva sampling offers a non-invasive alternative that can enhance access to testing, especially in populations with high HIV prevalence. While our data support the inclusion of saliva in diagnostic algorithms for clade Ib mpox, further research is necessary to evaluate its performance in earlier stages of infection and in community-managed cases. Limitations include the cohort’s focus on hospitalized patients, which may affect generalizability, and the absence of data on immune status, which could influence viral persistence. Overall, our findings provide critical insights into optimizing diagnostic strategies for mpox in African outbreaks, emphasizing the need for updated guidelines that incorporate saliva alongside traditional lesion swabs.

شارك: