DOI: https://doi.org/10.1186/s40364-025-00882-z
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41508138
تاريخ النشر: 2026-01-09
المؤلف: Urszula Smyczyńska وآخرون
الموضوع الرئيسي: الميكرو RNA في تنظيم الأمراض
نظرة عامة
تدرس هذه الدراسة تأثير نوع المادة البيولوجية (البلازما مقابل المصل) وطرق التكميم (تسلسل miRNA مقابل RT-qPCR) على مستويات microRNA (miRNA)، والتي تعتبر علامات حيوية محتملة في علم الأورام الدقيق. تم جمع العينات من 202 امرأة، بما في ذلك 154 حاملة لنسخ BRCA1/2 الضارة، عبر ثلاثة مراكز. أظهر التحليل أن الفروق في مستويات miRNA الفردية بين المصل والبلازما كانت أكثر وضوحًا مع تسلسل miRNA مقارنة بـ qPCR. على وجه الخصوص، كانت مستويات miR-193a-3p وmiR-197-3p وmiR-877-5p وmiR-2110 أعلى بشكل ملحوظ في المصل، بينما كان miR-28-5p أكثر وفرة في البلازما، كما تم تأكيده بواسطة كلا الطريقتين.
وجدت الدراسة علاقة إيجابية تبلغ حوالي 75% بين مستويات miRNA التي تم قياسها بواسطة التسلسل وqPCR، مما يشير إلى توافق جيد لميكروRNA ذات التعبير العالي. ومع ذلك، فإن الفروق الكبيرة في مستويات miRNA المطلقة والنسبية تتطلب معايرة محددة للمواد للاختبارات، مما قد يؤثر على اختيار علامات miRNA المثلى للتطبيقات السريرية. تشير العلاقة القوية بين الاختبارات المعتمدة على علامات انحلال الدم qPCR إلى قابليتها للتطبيق في بيانات التسلسل، ولكن تحويل اختبارات متعددة miRNA من المصل إلى البلازما لا يزال غير عملي بدون معايرة تجريبية.
نقاش
في هذا النقاش، يؤكد المؤلفون على الحاجة الملحة لترجمة علامات miRNA المستندة إلى الدم إلى الممارسة السريرية لتكون بسيطة وقابلة للتكرار وقوية. يبرزون أن اختيار المادة البيولوجية وبروتوكولات الاختبار يؤثر بشكل كبير على محتوى miRNA بسبب عوامل مثل تباين مكونات الدم، وعوامل التخثر، والتلوث. تقيم الدراسة أداء miRNAs المرتبطة بطفرات BRCA التي تم تحديدها سابقًا عبر أنواع عينات مختلفة (المصل والبلازما) وطرق التكميم (التسلسل وqPCR) باستخدام ثلاثة مجموعات بيانات متميزة. من الجدير بالذكر، لوحظ توافق عالٍ بين طريقتي التكميم، حيث تم قياس 71.7% من miRNAs بواسطة كلا الطريقتين في مجموعة البيانات الأولى، واتجاهات مماثلة في مجموعات البيانات الأخرى.
تكشف النتائج أنه بينما اكتشف التسلسل مجموعة أوسع من miRNAs، قدمت qPCR وسيلة فعالة من حيث التكلفة للتحليل المستهدف. كما حددت الدراسة miRNAs محددة، مثل miR-375-3p وlet-7b-5p، التي أظهرت علاقات قوية عبر الطرق، مما يشير إلى استقرارها المحتمل عبر المصفوفات البيولوجية. ومع ذلك، يحذر المؤلفون من أن الفروق في ملفات miRNA بين المصل والبلازما يمكن أن تؤثر بشكل كبير على التفسيرات التشخيصية، حيث قد يقدم المصل رؤى أفضل حول تنشيط الصفائح الدموية والاستجابات الالتهابية. بشكل عام، تؤكد الأبحاث على ضرورة الاعتبارات المنهجية الدقيقة والتحقق من نتائج التسلسل قبل التطبيق السريري، داعيةً إلى اختبارات قائمة على المصل باعتبارها أكثر موثوقية على الرغم من انخفاض عوائد miRNA مقارنة بالبلازما.
DOI: https://doi.org/10.1186/s40364-025-00882-z
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41508138
Publication Date: 2026-01-09
Author(s): Urszula Smyczyńska et al.
Primary Topic: MicroRNA in disease regulation
Overview
This study investigates the impact of biological material type (plasma vs. serum) and quantification methods (miRNA sequencing vs. RT-qPCR) on microRNA (miRNA) levels, which are potential biomarkers in precision oncology. Samples were collected from 202 women, including 154 carriers of BRCA1/2 pathogenic variants, across three centers. The analysis revealed that differences in individual miRNA levels between serum and plasma were more pronounced with miRNA sequencing compared to qPCR. Specifically, miR-193a-3p, miR-197-3p, miR-877-5p, and miR-2110 were significantly higher in serum, while miR-28-5p was more abundant in plasma, as confirmed by both methods.
The study found a positive correlation of approximately 75% between miRNA levels quantified by sequencing and qPCR, indicating good concordance for high-expression miRNAs. However, the significant differences in absolute and relative miRNA levels necessitate material-specific calibration for tests, which may influence the selection of optimal miRNA biomarkers for clinical applications. The strong inter-assay correlation of established qPCR hemolysis markers suggests their applicability in sequencing data, but the conversion of multi-miRNA tests from serum to plasma remains impractical without experimental calibration.
Discussion
In this discussion, the authors emphasize the critical need for the translation of blood-based miRNA biomarkers into clinical practice to be simple, replicable, and robust. They highlight that the choice of biomaterial and testing protocols significantly influences the miRNA content due to factors such as blood component variability, clotting factors, and contamination. The study evaluates the performance of previously identified BRCA mutation-associated miRNAs across different sample types (serum and plasma) and quantification methods (sequencing and qPCR) using three distinct datasets. Notably, a high concordance was observed between the two quantification methods, with 71.7% of miRNAs quantified by both methods in the first dataset, and similar trends in the other datasets.
The findings reveal that while sequencing detected a broader range of miRNAs, qPCR provided a cost-effective means for targeted analysis. The study also identified specific miRNAs, such as miR-375-3p and let-7b-5p, that exhibited strong correlations across methods, suggesting their potential stability across biological matrices. However, the authors caution that differences in miRNA profiles between serum and plasma can significantly impact diagnostic interpretations, with serum potentially offering better insights into platelet activation and inflammatory responses. Overall, the research underscores the necessity for careful methodological considerations and validation of sequencing results before clinical application, advocating for serum-based tests as potentially more reliable despite lower miRNA yields compared to plasma.