الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: التسلسل العميق
-
JASPAR 2026: توسيع ملفات ارتباط عوامل النسخ ودمج نماذج التعلم العميق
JASPAR 2026: expansion of transcription factor binding profiles and integration of deep learning models2025 | المؤلف: Damla Ovek وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قاعدة بيانات JASPAR، وهي مورد مفتوح الوصول لملفات ارتباط الحمض النووي لعوامل النسخ (TFs)، قد شهدت تحديثات كبيرة في إصدارها الحادي عشر. تم توسيع مجموعة CORE بنسبة 12%، مع إضافة 306 مصفوفات تكرار موضع جديدة أو محدثة (PFMs)، بينما شهدت مجموعة UNVALIDATED زيادة بنسبة 60% مع 433 ملفًا جديدًا. يتضمن هذا التحديث دمج برنامج inMOTIFin…
-
تحسين إعادة بناء الإمكانات التنموية للخلايا الفردية باستخدام CytoTRACE 2
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 22025 | المؤلف: Minji Kang وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يوضح المؤلفون المنهجيات المستخدمة لمقارنة CytoTRACE 2 مع مجموعة متنوعة من أساليب التعلم الآلي المراقب لتوقع نوع الخلية واستنتاج الإمكانات التنموية. قاموا بتقييم CytoTRACE 2 جنبًا إلى جنب مع ثلاث طرق متخصصة في توضيح الخلايا المفردة (scPred وSingleCellNet وscmap) وخمسة مصنفات عامة. شمل التقييم التدريب والاختبار عبر أربع طيات، بما في ذلك…