تسلسل RNA الخلوي الفردي يكشف عن أطلس الخلايا ويحدد خلايا الورم الدورية المسؤولة عن تكرار الأميلوبلاستوما
Single-cell transcriptomics reveals cell atlas and identifies cycling tumor cells responsible for recurrence in ameloblastoma

المجلة: International Journal of Oral Science، المجلد: 16، العدد: 1
DOI: https://doi.org/10.1038/s41368-024-00281-4
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38424060
تاريخ النشر: 2024-02-29
المؤلف: Gan Xiong وآخرون
الموضوع الرئيسي: علم الأمراض الفموية والوجهية

نظرة عامة

تبحث الدراسة في الآليات الخلوية التي تكمن وراء تكرار الأورام في الأميلوبلاستوما، وهو ورم حميد ولكنه غازي محليًا مرتبط بتدمير العظام الكبير ومعدلات تكرار عالية. باستخدام تحليل بدقة الخلية الواحدة، تحدد الدراسة خمس مجموعات فرعية متميزة من الأورام تتميز بتوقيعات متنوعة تتعلق بالاستجابة المناعية (IR) وإعادة تشكيل العظام (BR) وتطور الأسنان (TD) وتطور الظهارة (ED) ودورة الخلية (CC). ومن الجدير بالذكر أن الدراسة تسلط الضوء على أن خلايا CC تمتلك خصائص الخلايا الجذعية وهي المسؤولة بشكل أساسي عن تكرار الورم، مدفوعة ببرنامج يتم بوساطة EZH2.

علاوة على ذلك، تُظهر الدراسة أن استهداف EZH2 يقضي بشكل فعال على خلايا الأميلوبلاستوما CC ويمنع نمو الورم في نماذج الأعضاء المستمدة من المرضى. توضح هذه النتائج هوية ووظيفة وآليات تنظيم خلايا CC داخل الأميلوبلاستوما، مما يشير إلى أن EZH2 يمثل هدفًا علاجيًا واعدًا لإدارة هذا النوع من الأورام.

مقدمة

تناقش مقدمة ورقة البحث الأميلوبلاستوما (AM)، وهو أكثر الأورام الظهارية السنية انتشارًا، المعروف بتسببه في تدمير كبير للعظام المحلية ومعدل تكرار مرتفع، والذي يبلغ حوالي 38% حتى بعد التدخل الجراحي الجذري. عادة ما ينشأ الورم من بقايا الظهارة السنية في الفك، مما يؤدي إلى تشوهات وجهية شديدة ووظائف غير طبيعية. تشمل العلاجات الحالية بشكل أساسي الاستئصال الجراحي، والذي غالبًا ما يؤدي إلى فقدان إضافي للعظام الوجهية، مما يبرز الحاجة الملحة لاستراتيجيات علاجية جديدة. ومن الجدير بالذكر أن مثبطات BRAF أظهرت وعدًا في علاج AM الإيجابي لـ BRAF، مما يشير إلى أن استهداف جينات محرك الورم قد يكون نهجًا قابلاً للتطبيق.

لمعالجة التباين الجيني والوظيفي في AM، تستخدم الدراسة تقنيات النسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) للتحقيق في التباين داخل الورم (ITH) والبيئة الدقيقة للورم (TME) على مستوى الخلية الواحدة. تحدد التحليلات تسع مجموعات خلوية رئيسية داخل AM، كاشفة عن تنوع كبير في مجموعات خلايا الورم والستروما والمناعة. تبرز الدراسة بشكل خاص مجموعة فرعية من خلايا دورة الخلية (CC) في AM، والتي تُعتبر شديدة الأورام وتُنظم بواسطة دائرة بوساطة EZH2. وُجد أن تثبيط EZH2 يقلل بشكل كبير من تكاثر وإمكانية الأورام لخلايا AM، مما يشير إلى أن مثبطات EZH2 قد تمثل طريقًا علاجيًا واعدًا لعلاج AM. بشكل عام، توفر هذه الدراسة رؤى حاسمة حول المشهد الخلوي والجزيئي لـ AM، مما يمهد الطريق لاستراتيجيات علاجية محسنة.

الطرق

في قسم “المواد والطرق”، يحدد المؤلفون توفر المواد الكيميائية وحزمة R المستخدمة في دراستهم، كما هو مفصل في الجدول S3. الوصول إلى هذه المواد مشروط بتنفيذ اتفاقية نقل المواد. لأي استفسارات أو طلبات تتعلق بالمواد الكيميائية، يتم توجيه الأطراف المهتمة للتواصل مع المؤلف المقابل، البروفيسور تشينغ وانغ، عبر البريد الإلكتروني على wangch75@mail.sysu.edu.cn. يضمن هذا النهج المنظم الامتثال للمعايير التنظيمية مع تسهيل التعاون داخل مجتمع البحث.

النتائج

توفر نتائج هذه الدراسة تحليلًا شاملًا للنسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة للأميلوبلاستوما (AM)، كاشفة عن تنوع خلوي كبير وتباين داخل الورم. باستخدام ملفات تعريف scRNA-seq من أورام 11 مريضًا، حدد الباحثون تسع أنواع خلوية رئيسية، بما في ذلك خلايا الظهارة، والألياف، والخلايا النقوية واللمفاوية، وخلايا الصمغ، وخلايا B، والخلايا البطانية، والليفية العضلية، والخلايا العظمية. ومن الجدير بالذكر أن الدراسة سلطت الضوء على وجود مجموعات فرعية متميزة من الظهارة، حيث أظهرت مجموعة واحدة (c0) ميزات مناعية ومجموعة أخرى (c1) مرتبطة بإعادة تشكيل العظام. كما كشفت التحليلات عن تباينات في عدد النسخ الكروموسومية (CNVs) في خلايا الظهارة، مع تضخيمات على الكروموسومات 12 و17 وحذف على الكروموسومات 6 و10، بما يتماشى مع النتائج السابقة في AM.

علاوة على ذلك، حددت الدراسة مجموعة فرعية محددة من الخلايا الدورية (c4) المرتبطة بتكرار الورم، والتي تتميز بارتفاع التعبير عن علامات دورة الخلية والجينات المرتبطة بالخصائص الجذعية. كانت هذه المجموعة من الخلايا الدورية غنية بشكل كبير في عينات AM المتكررة مقارنة بالأورام الأولية، مما يشير إلى دورها في عدوانية الورم وتكراره. تشير النتائج إلى أن استهداف EZH2، وهو منظم رئيسي تم تحديده في خلايا AM الدورية، قد يثبط التكاثر والخصائص الجذعية، مما يقدم استراتيجية علاجية محتملة لإدارة AM. بشكل عام، تؤكد هذه الأبحاث على تعقيد البيئة الدقيقة لـ AM وأهمية الحالات الخلوية المحددة في سلوك الورم وتكراره.

المناقشة

في هذه الدراسة، بحث المؤلفون في الأميلوبلاستوما (AM)، وهو ورم سني عدواني محلي، باستخدام تسلسل RNA على مستوى الخلية الواحدة (scRNA-seq) لتوضيح تركيبها الخلوي وتنوعها الجيني. حددوا تسع مجموعات خلوية رئيسية تساهم في آفات AM، كاشفين عن تباين كبير داخل الورم. ومن الجدير بالذكر أنه تم تحديد خمس مجموعات فرعية متميزة من خلايا الظهارة الورمية، مع تركيز خاص على مجموعة فرعية عالية الدورة (CC AM cells) التي أظهرت تجديدًا ذاتيًا نشطًا وقدرات بدء الورم. وُجد أن هذه المجموعة تفتقر إلى علامات الجذعية الكلاسيكية مثل SOX2 وNANOG، مما يتحدى الافتراضات السابقة حول خصائص الخلايا الجذعية في خلايا الظهارة السنية.

كما حددت الدراسة EZH2 كعامل نسخي حاسم يقود تكاثر خلايا CC AM، حيث ارتبط تعبيره بتكرار الورم. أظهر استهداف EZH2 أنه يثبط تكاثر الخلايا وتكوين كريات الورم، مما يشير إلى أنه قد يكون هدفًا علاجيًا واعدًا لعلاج AM. توفر النتائج أطلسًا شاملًا للنسخ الجيني على مستوى الخلية الواحدة لـ AM، مما يبرز الإمكانية للعلاجات المستهدفة التي تستهدف مجموعة خلايا CC AM وEZH2 للحد من تكرار الورم. ومع ذلك، يعترف المؤلفون بالقيود، بما في ذلك عدم القدرة على تتبع سلالة الخلايا في الجسم الحي بسبب نقص نماذج الفئران المناسبة والحاجة إلى مزيد من التحقيق في تأثيرات الطفرات المسرطنة المختلفة الموجودة في AM.

Journal: International Journal of Oral Science, Volume: 16, Issue: 1
DOI: https://doi.org/10.1038/s41368-024-00281-4
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38424060
Publication Date: 2024-02-29
Author(s): Gan Xiong et al.
Primary Topic: Oral and Maxillofacial Pathology

Overview

The research investigates the cellular mechanisms underlying tumor recurrence in ameloblastoma, a benign yet locally invasive tumor associated with significant bone destruction and high recurrence rates. Utilizing single-cell resolution analysis, the study identifies five distinct tumor subpopulations characterized by varying signatures related to immune response (IR), bone remodeling (BR), tooth development (TD), epithelial development (ED), and cell cycle (CC). Notably, the study highlights that CC cells possess stemness properties and are primarily responsible for tumor recurrence, driven by an EZH2-mediated program.

Furthermore, the research demonstrates that targeting EZH2 effectively eliminates CC ameloblastoma cells and inhibits tumor growth in patient-derived organoid models. These findings elucidate the identity, function, and regulatory mechanisms of CC cells within ameloblastoma, suggesting that EZH2 represents a promising therapeutic target for managing this tumor type.

Introduction

The introduction of the research paper discusses Ameloblastoma (AM), the most prevalent odontogenic epithelial tumor, known for causing significant local bone destruction and a high recurrence rate, which is approximately 38% even after radical surgical intervention. The tumor typically originates from remnants of odontogenic epithelium in the jaw, leading to severe facial deformities and dysfunctions. Current treatments primarily involve surgical resection, which often results in further facial bone loss, highlighting the urgent need for novel therapeutic strategies. Notably, BRAF inhibitors have shown promise in treating BRAF-positive AM, suggesting that targeting tumor driver genes could be a viable approach.

To address the genetic and functional heterogeneity of AM, the study employs single-cell transcriptomics (scRNA-seq) to investigate intratumoral heterogeneity (ITH) and the tumor microenvironment (TME) at a single-cell level. The analysis identifies nine major cell clusters within AM, revealing diverse tumor, stromal, and immune cell populations. The research particularly highlights a subset of cell cycle (CC) AM cells, which are characterized as highly tumorigenic and regulated by an EZH2-mediated circuit. Inhibition of EZH2 was found to significantly reduce the proliferation and tumorigenic potential of AM cells, indicating that EZH2 inhibitors may represent a promising therapeutic avenue for AM treatment. Overall, this study provides critical insights into the cellular and molecular landscape of AM, paving the way for improved therapeutic strategies.

Methods

In the “Materials and Methods” section, the authors outline the availability of reagents and the R package utilized in their study, as detailed in Table S3. Access to these materials is contingent upon the execution of a Materials Transfer Agreement. For further inquiries or requests regarding the reagents, interested parties are directed to contact the corresponding author, Prof. Cheng Wang, via email at wangch75@mail.sysu.edu.cn. This structured approach ensures compliance with regulatory standards while facilitating collaboration within the research community.

Results

The results of this study provide a comprehensive single-cell transcriptomic analysis of ameloblastoma (AM), revealing significant cellular diversity and intratumoral heterogeneity. Utilizing scRNA-seq profiles from tumors of 11 patients, the researchers identified nine major cell types, including epithelial cells, fibroblasts, myeloid and lymphoid cells, mast cells, B cells, endothelial cells, myofibroblasts, and osteoclasts. Notably, the study highlighted the presence of distinct epithelial subclusters, with one cluster (c0) exhibiting immune features and another (c1) associated with bone remodeling. The analysis also uncovered chromosomal copy number variations (CNVs) in epithelial cells, with amplifications on chromosomes 12 and 17 and deletions on chromosomes 6 and 10, consistent with previous findings in AM.

Furthermore, the study identified a specific subpopulation of cycling cells (c4) linked to tumor recurrence, characterized by high expression of cell cycle markers and stemness-associated genes. This cycling cell population was significantly enriched in recurrent AM samples compared to primary tumors, suggesting its role in tumor aggressiveness and recurrence. The findings indicate that targeting EZH2, a key regulator identified in cycling AM cells, may inhibit proliferation and stemness, presenting a potential therapeutic strategy for managing AM. Overall, this research underscores the complexity of the AM microenvironment and the importance of specific cellular states in tumor behavior and recurrence.

Discussion

In this study, the authors investigated ameloblastoma (AM), a locally aggressive odontogenic tumor, using single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) to elucidate its cellular composition and genetic diversity. They identified nine major cell clusters contributing to AM lesions, revealing significant intratumor heterogeneity. Notably, five distinct subsets of tumor epithelial cells were characterized, with a specific focus on a high-cycling subset (CC AM cells) that exhibited active self-renewal and tumor-initiating capabilities. This subset was found to lack classic stemness markers such as SOX2 and NANOG, challenging previous assumptions about stem cell characteristics in dental epithelial cells.

The study further identified EZH2 as a critical transcription factor driving the proliferation of CC AM cells, correlating its expression with tumor recurrence. Targeting EZH2 was shown to inhibit cell proliferation and tumor sphere formation, suggesting that it could serve as a promising therapeutic target for AM treatment. The findings provide a comprehensive single-cell transcriptomic atlas of AM, highlighting the potential for targeted therapies aimed at the CC AM cell subset and EZH2 to mitigate tumor recurrence. However, the authors acknowledge limitations, including the inability to trace cell lineage in vivo due to the lack of appropriate mouse models and the need for further investigation into the effects of different oncogenic mutations present in AM.