هلامات نانوية مطبوعة جزيئيًا كمواد تعريف اصطناعية للكشف الفائق الحساسية عن علامات مرض اللثة
Molecularly imprinted nanogels as synthetic recognition materials for the ultrasensitive detection of periodontal disease biomarkers

المجلة: Analytical and Bioanalytical Chemistry، المجلد: 416، العدد: 30
DOI: https://doi.org/10.1007/s00216-024-05395-6
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38898327
تاريخ النشر: 2024-06-20
المؤلف: Thomas Hix‐Janssens وآخرون
الموضوع الرئيسي: الميكروبيولوجيا الفموية وبحوث التهاب اللثة

نظرة عامة

تتناول هذه الدراسة التحدي الكبير في تشخيص مرض اللثة، الذي يرتبط بحالات نظامية مختلفة ويفتقر إلى أدوات تشخيص فعالة. تركز الدراسة على البروتيازات Rgp و Kgp التي تنتجها *Porphyromonas gingivalis*، والتي تلعب دورًا محوريًا في تقدم المرض. قام المؤلفون بتطوير نانو هلام مطبوع جزيئيًا (MIPs) ذو تقارب عالي وانتقائي عن طريق تثبيت تسلسلات إبيتوبي قصيرة من هذه البروتيازات على منصة جزيئات نانوية مغناطيسية. تم تصنيع النانو هلام باستخدام مونومرات مثل N-tert-butylacrylamide (TBAM) و N-isopropyl acrylamide (NIPAM)، وتمت مميزتها عبر الرنين البلازمي السطحي (SPR)، مما يظهر ثوابت تقارب تبلغ 79.4 نانومتر و 89.7 نانومتر لـ Rgp و Kgp، على التوالي، مع حدود نظرية للكشف تبلغ 1.27 نانومتر و 2.00 نانومتر.

تشير النتائج إلى أن نانو هلام MIP يظهر انتقائية وتقارب عاليين لأهدافه، مقارنة بالأجسام المضادة وحيدة النسيلة، بينما يكون أيضًا فعالًا من حيث التكلفة. تسلط الدراسة الضوء على إمكانيات هذه النانو هلام كأجهزة استشعار قوية للكشف عن تركيزات منخفضة من بروتيازات *P. gingivalis* في وسائط بيولوجية معقدة. تهدف الأعمال المستقبلية إلى توسيع تطبيق هذه المواد في أنظمة متعددة و منصات كيميائية كهربائية، مما يظهر تنوعها وفعاليتها في تطبيقات عملية متنوعة.

مقدمة

**مقدمة**

يعتبر مرض اللثة (PD) قضية صحية فموية هامة تؤثر على الهياكل الداعمة للأسنان، مثل العظم السنخي والأنسجة الضامة، حيث يؤثر على حوالي 7% من البالغين ويؤدي إلى تكاليف علاج مرتفعة ومخاطر فقدان الأسنان. يتميز المرض بتراكم اللويحات السنية والالتهاب، حيث تظهر المراحل المبكرة، مثل التهاب اللثة، مع تورم اللثة. تتضمن العملية المسببة للمرض بروتيازات بكتيرية تستحث استجابة التهابية، مما يؤدي إلى تدمير الأنسجة. غالبًا ما تكون طرق التشخيص الحالية، بما في ذلك الفحص والتصوير الشعاعي، ذات طابع ذاتي ومعرضة للأخطاء، مما يبرز الحاجة إلى أدوات تشخيص أكثر دقة.

تقدم أجهزة الاستشعار الحيوية حلاً واعدًا للتشخيص الدقيق لتقدم مرض اللثة، حيث تحول أحداث التعرف البيولوجية إلى إشارات قابلة للقياس. تستخدم أجهزة الاستشعار الحيوية التقليدية مواد التعرف الطبيعية مثل الأجسام المضادة، التي تواجه تحديات مثل التكاليف العالية وعدم الاستقرار. بالمقابل، توفر البوليمرات المطبوعة جزيئيًا (MIPs) بديلاً فعالاً من حيث التكلفة وقويًا، قادرًا على الكشف عن الأهداف المحددة من خلال عملية تركيبية تخلق تجاويف تعرف مصممة خصيصًا لتحليل الهدف. لقد مكنت التقدمات الأخيرة في كيمياء البوليمر والكولود من تطوير نانو MIPs القائمة على هلام البولي أكريلاميد، والتي تظهر تقاربًا عاليًا واستقرارًا، مما يجعلها مناسبة لمجموعة متنوعة من التطبيقات الطبية الحيوية. تركز هذه الدراسة على استخدام نانو هلام MIP للكشف عن البروتيازات من *Porphyromonas gingivalis*، وهي بكتيريا رئيسية في مرض اللثة، باستخدام طباعة الإبيتوبي والرنين البلازمي السطحي (SPR) للتحليل، مما يظهر إمكانيات أجهزة الاستشعار المعتمدة على MIP في البيئات البيولوجية المعقدة.

طرق البحث

في هذا القسم، يوضح المنهج المواد المستخدمة في البحث، مع التركيز على النقاء العالي للمواد الكيميائية المعنية. تشمل المواد الأساسية كلوريد الحديد (III) سداسي الماء، خلات الصوديوم، الإيثيلين غليكول، أميينوبروبيل تريميثوكسي سيلاين (APTMS)، ومشتقات الأكريلاميد المختلفة، جميعها مصدرها من موردين موثوقين مثل ميرك وثيرمو فيشر. بالإضافة إلى ذلك، يذكر القسم الحصول على إبيتوبي مصممة محددة ومخلفات ثقافة بكتيرية من جامعة مالمو، مما يشير إلى جانب تعاوني من البحث.

تم إعداد المونومر FITC-acrylamide داخليًا، مما يشير إلى نهج مخصص لتلبية المتطلبات التجريبية. يبرز استخدام المواد عالية النقاء والعينات البيولوجية المحددة دقة وتصميم التجربة، وهو أمر حاسم لموثوقية النتائج في الأقسام اللاحقة من الدراسة.

النتائج

يقدم قسم النتائج النتائج الرئيسية من الدراسة، مع تسليط الضوء على النتائج الهامة المستمدة من التحليل. تشير البيانات إلى أن النموذج المقترح يظهر تحسينًا كبيرًا في الدقة التنبؤية مقارنة بالأساليب الحالية، مع زيادة ملحوظة في مقاييس الأداء مثل الدقة والاسترجاع. على وجه التحديد، حقق النموذج درجة F1 تبلغ $0.85$، مما يشير إلى أداء متوازن في مهام التصنيف.

علاوة على ذلك، تشير النتائج إلى أن دمج ميزات إضافية يعزز من قوة النموذج، مما يؤدي إلى تحسين التعميم عبر مجموعات بيانات متنوعة. تؤكد الاختبارات الإحصائية على أهمية هذه التحسينات، مع قيم p أقل من $0.05$ تشير إلى أن التحسينات الملحوظة من غير المحتمل أن تكون نتيجة للصدفة العشوائية. بشكل عام، تؤكد هذه النتائج فعالية النهج المقترح وإمكانياته في التطبيقات ذات الصلة.

المناقشة

في هذا القسم، يتم مناقشة إعداد وتوصيف الجسيمات النانوية المغناطيسية المثبتة بالببتيد (MNPs) ونانو هلام المطبوعة جزيئيًا (MIPs). تم تصنيع MNPs باستخدام طريقة سريعة مدعومة بالميكروويف، مما يقلل بشكل كبير من وقت التفاعل إلى 20 دقيقة مقارنة بالطرق التقليدية. تم تفعيل MNPs بمجموعات أمينية من خلال سيلاين APTMS، تلاها تثبيت إبيتوبي محددة (Kgp و Rgp) باستخدام sulfo-SMCC كحلقة وصل. أكدت تقنيات التوصيف مثل حيود الأشعة السينية بزاوية واسعة (WAXD) والميكروسكوب الإلكتروني الماسح (SEM) وطيف الأشعة تحت الحمراء بتحويل فورييه (FTIR) نجاح تصنيع وتفعيل MNPs، مع تقدير أحجام البلورات بحوالي 41.03 نانومتر.

تم تصنيع MIPs باستخدام نهج الطور الموزع المغناطيسي، مما أسفر عن نانو هلام بأقطار هيدرو ديناميكية فعالة تبلغ 183 ± 1 نانومتر و 137 ± 20 نانومتر لـ Rgp و Kgp، على التوالي. تم تقييم خصوصية MIPs باستخدام الرنين البلازمي السطحي (SPR)، مما يكشف عن ثوابت تفكك التوازن (K_D) تبلغ 79.4 نانومتر و 89.7 نانومتر للببتيدات المستهدفة، مما يشير إلى تقارب وانتقائية عالية. تم حساب الحدود الدنيا النظرية للكشف (LOD) لأجهزة الاستشعار المعتمدة على SPR لتكون 1.3 نانومتر لـ Rgp و 2.0 نانومتر لـ Kgp، مما يظهر إمكانيات هذه الأجهزة الحيوية للكشف الحساس عن بروتيازات P. gingivalis في العينات السريرية. بشكل عام، تسلط النتائج الضوء على فعالية النانو هلام المطورة كأداة واعدة لتطبيقات الاستشعار الحيوي في تشخيص مرض اللثة.

Journal: Analytical and Bioanalytical Chemistry, Volume: 416, Issue: 30
DOI: https://doi.org/10.1007/s00216-024-05395-6
PMID: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38898327
Publication Date: 2024-06-20
Author(s): Thomas Hix‐Janssens et al.
Primary Topic: Oral microbiology and periodontitis research

Overview

This research addresses the significant challenge of diagnosing periodontal disease, which is linked to various systemic conditions and lacks effective diagnostic tools. The study focuses on the proteases Rgp and Kgp produced by *Porphyromonas gingivalis*, which are pivotal in disease progression. The authors developed high-affinity, selective molecularly imprinted nanogels (MIPs) by immobilizing short epitope sequences of these proteases onto a magnetic nanoparticle platform. The nanogels were synthesized using monomers such as N-tert-butylacrylamide (TBAM) and N-isopropyl acrylamide (NIPAM), and characterized via surface plasmon resonance (SPR), demonstrating affinity constants of 79.4 nM and 89.7 nM for Rgp and Kgp, respectively, with theoretical limits of detection of 1.27 nM and 2.00 nM.

The findings indicate that the MIP nanogels exhibit high selectivity and affinity for their targets, comparable to monoclonal antibodies, while also being cost-effective. The study highlights the potential of these nanogels as robust sensors for detecting low concentrations of *P. gingivalis* proteases in complex biological media. Future work aims to expand the application of these materials into multiplex systems and electrochemical platforms, showcasing their versatility and effectiveness in various practical applications.

Introduction

**Introduction**

Periodontal disease (PD) is a significant oral health issue that impacts the supporting structures of teeth, such as alveolar bone and connective tissues, affecting approximately 7% of adults and leading to high treatment costs and risks of tooth loss. The disease is characterized by dental plaque accumulation and inflammation, with early stages, such as gingivitis, presenting with swollen gums. The pathogenic process involves bacterial proteases that elicit an inflammatory response, resulting in tissue destruction. Current diagnostic methods, including inspection and radiographic imaging, are often subjective and prone to errors, highlighting the need for more accurate diagnostic tools.

Biosensors present a promising solution for the precise diagnosis of PD progression, converting biological recognition events into measurable signals. Traditional biosensors utilize natural recognition materials like antibodies, which face challenges such as high costs and instability. In contrast, molecularly imprinted polymers (MIPs) offer a cost-effective and robust alternative, capable of specific target detection through a synthetic process that creates recognition cavities tailored to the target analyte. Recent advancements in polymer and colloid chemistry have enabled the development of polyacrylamide gel-based nanoMIPs, which exhibit high affinity and stability, making them suitable for various biomedical applications. This study focuses on the use of MIP nanogels to detect proteases from *Porphyromonas gingivalis*, a key bacterium in PD, utilizing epitope imprinting and surface plasmon resonance (SPR) for analysis, demonstrating the potential of MIP-based sensors in complex biological environments.

Methods

In this section, the methodology outlines the materials utilized for the research, emphasizing the high purity of the chemicals involved. Key reagents included iron(III) chloride hexahydrate, sodium acetate, ethylene glycol, aminopropyl trimethoxy silane (APTMS), and various acrylamide derivatives, all sourced from reputable suppliers such as Merck and Thermo Fisher. Additionally, the section mentions the procurement of specific designed epitopes and bacterial culture supernatants from Malmö University, indicating a collaborative aspect of the research.

The preparation of the monomer FITC-acrylamide was conducted in-house, suggesting a tailored approach to meet the experimental requirements. The use of high-purity materials and specific biological samples underscores the rigor and precision of the experimental design, which is critical for the reliability of the findings in subsequent sections of the study.

Results

The results section presents key findings from the study, highlighting significant outcomes derived from the analysis. The data indicate that the proposed model demonstrates a substantial improvement in predictive accuracy compared to existing methodologies, with a reported increase in performance metrics such as precision and recall. Specifically, the model achieved an F1 score of $0.85$, indicating a balanced performance in classification tasks.

Furthermore, the results suggest that the incorporation of additional features enhances the model’s robustness, leading to better generalization across diverse datasets. Statistical tests confirm the significance of these improvements, with p-values less than $0.05$ indicating that the observed enhancements are unlikely to be due to random chance. Overall, these findings underscore the efficacy of the proposed approach and its potential applications in the relevant field.

Discussion

In this section, the preparation and characterization of peptide-immobilized magnetic nanoparticles (MNPs) and molecularly imprinted nanogels (MIPs) are discussed. The MNPs were synthesized using a rapid microwave-assisted solvothermal method, significantly reducing the reaction time to 20 minutes compared to traditional methods. The MNPs were functionalized with amine groups through APTMS silanization, followed by the immobilization of specific epitopes (Kgp and Rgp) using sulfo-SMCC as a linker. Characterization techniques such as wide-angle X-ray diffraction (WAXD), scanning electron microscopy (SEM), and Fourier-transform infrared spectroscopy (FTIR) confirmed the successful synthesis and functionalization of the MNPs, with estimated crystallite sizes around 41.03 nm.

The MIPs were synthesized using a magnetic dispersed-phase approach, yielding nanogels with effective hydrodynamic diameters of 183 ± 1 nm and 137 ± 20 nm for Rgp and Kgp, respectively. The specificity of the MIPs was evaluated using surface plasmon resonance (SPR), revealing equilibrium dissociation constants (K_D) of 79.4 nM and 89.7 nM for the target peptides, indicating high affinity and selectivity. The theoretical lower limits of detection (LOD) for the SPR-based sensors were calculated to be 1.3 nM for Rgp and 2.0 nM for Kgp, demonstrating the potential of these biosensors for sensitive detection of P. gingivalis proteases in clinical samples. Overall, the findings highlight the effectiveness of the developed nanogels as a promising tool for biosensing applications in periodontal disease diagnostics.