الأبحاث في مجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)
-
نموذج خشن لبروتينات غير مرتبة ومتعددة المجالات
2024 | المؤلف: Fan Cao وآخرون | المجلة: Protein Science | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يناقش المؤلفون التحديات المرتبطة بتوصيف التجمعات الشكلية للبروتينات متعددة المجالات بسبب تعقيدها وديناميكياتها. يقدمون نموذجًا خشنًا يعزز من كفاءة ودقة محاكاة هذه البروتينات في المحلول. تسلط الدراسة الضوء على أهمية موضع مواقع التفاعل داخل المجالات المطوية، كاشفة أن وضع هذه المواقع في مواقع ذرات Cα يؤدي إلى تفاعلات مفرطة بين المجالات. بالمقابل،…
-
العلاج الجيني AAV لضمور العضلات دوشين: التجربة العشوائية المرحلة 3 EMBARK
2024 | المؤلف: Jerry R. Mendell وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تجربة EMBARK المرحلة 3 العشوائية حققت في فعالية وسلامة الديلاندستروجن موكسابارفوفك، وهو علاج جيني لضمور العضلات الدوشيني (DMD)، في الذكور المتنقلين الذين تتراوح أعمارهم بين 4 إلى 8 سنوات. تم توزيع 125 مشاركًا عشوائيًا لتلقي إما جرعة واحدة عن طريق الوريد من الديلاندستروجن موكسابارفوفك (1.33 × 10¹⁴ جينوم ناقل/كغ؛ ن = 63) أو دواء وهمي…
-
GeneCompass: فك شفرة الآليات التنظيمية الجينية العالمية من خلال نموذج أساسي مستند إلى المعرفة عبر الأنواع
2024 | المؤلف: Xiaodong Yang وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على تطوير GeneCompass، وهو نموذج أساسي عبر الأنواع مصمم لتعزيز فهمنا لآليات تنظيم الجينات من خلال دمج البيانات من أكثر من 120 مليون ترانسكريبتوم أحادي الخلية من البشر والفئران. غالبًا ما تركز طرق البحث التقليدية على الكائنات الحية النموذجية الفردية، مما يحد من الرؤى حول الآليات التنظيمية العالمية. ومع ذلك، فإن التقدم…
-
نموذج الذكاء الاصطناعي AlphaFold لعلم الأحياء الجزيئي واكتشاف الأدوية: تحقيق معلوماتي مدفوع بالتعلم الآلي
2024 | المؤلف: Song‐Bin Guo وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)لقد حول نموذج AlphaFold بشكل كبير البحث البيولوجي؛ ومع ذلك، فإن الكمية الهائلة من البيانات غير المهيكلة في هذا المجال تتطلب مزيدًا من التحليل لفهم مشهد البحث بشكل شامل وإبلاغ الاستفسارات المستقبلية. تستخدم هذه التحليل العلمي أساليب المعلومات المدفوعة بالتعلم الآلي لتحديد مجموعات البحث الرئيسية، وتتبع الاتجاهات الناشئة، وتسليط الضوء على المجالات غير المستكشفة. تشير…
-
crRNA المقسوم مع CRISPR-Cas12a يمكّن الكشف عالي الحساسية والمتعدد للـ RNA وDNA
2024 | المؤلف: Yi-Chuan Chen وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)لقد تقدم نظام CRISPR-Cas12a بشكل كبير في اختبار الأحماض النووية (NAT) بسبب قدراته السريعة والدقيقة، على الرغم من أن الطرق التقليدية كانت تتطلب تضخيم RNA مسبق. تقدم هذه الدراسة نظام Cas12a المنقسم الجديد (SCas12a) الذي يجمع بين إنزيم Cas12a و crRNA المنقسم، مما يمكّن من الكشف عن miRNAs و RNAs الطويلة بدون تضخيم و بشكل…
-
البروتينات المصممة لتحفيز الإندوسيتوز تفكك الأهداف وتضخم الإشارات
2024 | المؤلف: Buwei Huang وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تتناول الأبحاث تطوير بروتينات مصممة من جديد، تُسمى EndoTags، التي تسهل عملية الإندوسيتوز المستهدفة لمستقبلات معينة، مما يتجاوز القيود المرتبطة بالطرق التقليدية المعتمدة على الأجسام المضادة. من خلال اختيار مستقبلات ذات ملفات تعبير نسيجي مميزة—مثل IGF2R، ASGPR، TfR، وsortilin—تهدف الدراسة إلى تحقيق تحكم محدد نسيجياً في الإندوسيتوز. يسمح نهج EndoTag باستهداف مواقع المستقبلات التي لا…
-
تصميم بروتينات متعددة الحالات ووظيفية باستخدام انتشار فضاء تسلسل RoseTTAFold
2024 | المؤلف: Sidney Lisanza وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم البحث مولد البروتين (PG)، وهو نموذج جديد لانتشار مساحة التسلسل مبني على RoseTTAFold، يهدف إلى تعزيز توليد هياكل البروتين من الصفر مع معالجة قيود النماذج الحالية في توليد الخصائص الوظيفية والسمات المحددة بالتسلسل. يعمل PG من خلال البدء من تمثيل تسلسلي مشوش ويستخدم إزالة الضوضاء التكرارية لإنتاج أزواج من تسلسلات وهياكل البروتين، مسترشداً بسمات…
-
استهداف السرطان باستخدام مثبطات بان-كراس الصغيرة الجزيئات
2024 | المؤلف: Johannes Popow وآخرون | المجلة: Science | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على تطوير ACBI3، وهو جزيء صغير قادر على استهداف طيف واسع من طفرات KRAS المسرطنة، بما في ذلك المتغيرات الشائعة G12D و G12V. على عكس المثبطات التقليدية، التي لها فعالية محدودة ضد معظم طفرات KRAS، يقوم ACBI3 بتفكيك 13 من أصل 30 أليل لـ KRAS، مما يؤدي إلى تعديل كبير ومستدام لمسارات…
-
Bacteroides uniformis يقوم بتحليل β-glucan لتعزيز Lactobacillus johnsonii مما يحسن مستويات حمض الإندول-3-لاكتك في تخفيف التهاب القولون
2024 | المؤلف: Shanshan Zhang وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تبحث هذه الدراسة في دور β-غلوكان (BG)، وهو ألياف غذائية نشطة بيولوجيًا، في تخفيف التهاب القولون من خلال تأثيراته على ميكروبيوم الأمعاء والمواد الأيضية. تكشف الدراسة أن تدخل BG لا يحسن فقط أعراض التهاب القولون ولكن أيضًا يعكس انخفاض أنواع اللاكتوباسيلوس في الفئران المصابة بالتهاب القولون، مع وجود ارتباط سلبي كبير بين وفرة اللاكتوباسيلوس وشدة…
-
المجاميع التعايشية تزيل الكائنات الحية المعوية عبر السيطرة البيئية
2024 | المؤلف: Munehiro Furuichi وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استخدام فئران C57BL/6، التي تم الحفاظ عليها تحت ظروف خالية من الجراثيم (GF)، والمصدر من مختبرات يابانية مختلفة بما في ذلك مختبرات سانكيو، SLC اليابان، وCLEA اليابان. تم تربية وصيانة الفئران الخالية من الجراثيم والفئران الجنوطوبية في مرافق متخصصة في كلية الطب بجامعة كيو ومركز الابتكار الطبي والكيميائي بجامعة JSR-Keio. بالإضافة…