الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: ارتباط البروتين
-
تحقيق واسع النطاق في بيانات ديناميات الجزيئات لمستقبلات البروتينات الغشائية GPCR يكشف عن مواقع ألوستيرية وبوابات جانبية
2025 | المؤلف: David Aranda-García وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يصف المؤلفون المنهجية المستخدمة للتحقيق في إدخالات الدهون في مستقبلات البروتين G المرتبطة (GPCRs) من خلال محاكاة الديناميكا الجزيئية الشاملة (MD). قاموا بتحليل مجموعة بيانات تتكون من 190 هيكلًا محاكى، وحددوا 49 إدخالًا للدهون تتوافق مع تلك التي لوحظت في الهياكل المحلولة تجريبيًا. ومن الجدير بالذكر أن 46 من هذه الإدخالات تم…
-
هياكل TGF-β مع بيتاجلايكان ومستقبلات الإشارة تكشف آليات التجميع المعقد والإشارة
2025 | المؤلف: Łukasz Wieteska وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يستكشف المؤلفون التفاعلات الهيكلية بين TGF-β و BG ZP-C، كاشفين عن مواقع الربط الحرجة وطبيعة هذه التفاعلات. تشير البنية البلورية لمركب mmTGF-β2:BG ZP-C إلى أن مجال BG ZP-C يرتبط بالسطح الداخلي لأصابع TGF-β2، مع مشاركة بقايا محفوظة مثل I92 و K97 و E99، والتي تعتبر ضرورية للربط. ومن الجدير بالذكر أن التفاعلات…
-
استكشاف في السيليكو لمشتقات الزانثون الطبيعية كمثبطات محتملة لتكاثر فيروس كورونا المسبب لمتلازمة التنفس الحاد الشديد 2 (SARS-CoV-2) ودخول الخلايا
2025 | المؤلف: Vincent A. Obakachi وآخرون | المجلة: Journal of Computer-Aided Molecular Design | المجال: علم السموم (Toxicology)لقد أبرزت جائحة COVID-19 ضرورة وجود علاجات مضادة للفيروسات فعالة، خاصة ضد المتغيرات المقاومة للقاحات الناشئة. تستكشف هذه الدراسة مشتقات الزانثون الطبيعية كعوامل مثبطة محتملة لمستقبل ACE2، الذي يسهل دخول SARS-CoV-2 إلى خلايا الإنسان. حدد تحليل حسابي لـ 91 مركب زانثون من *Swertia chirayita* مرشحين، XAN71 و XAN72، اللذان أظهرا تقارب ارتباط متفوق يبلغ -70.97…
-
تحديد TNFAIP2 كمنظم خلوي فريد لتنشيط مستقبل CSF-1
2025 | المؤلف: Randa A. Abdelnaser وآخرون | المجلة: Life Science Alliance | المجال: علم المناعة (Immunology)تدرس الدراسة الدور التنظيمي للبروتين 2 المستحث بواسطة TNF-α (TNFAIP2) في تنشيط مستقبل CSF-1 (CSF1R)، وهو كيناز تيروزين حاسم يشارك في تطوير البلعميات النسيجية وهدف علاجي في أورام مختلفة. يوضح المؤلفون أن TNFAIP2 ضروري لتكوين تجمعات CSF1R في البلعميات، حيث يؤدي تثبيطه أو تقليله إلى انخفاض كبير في كل من تكوين التجمعات والاستجابة الوظيفية للبلعميات…
-
الأساس الهيكلي لتنشيط معتمد على اللجند لمجمع AHR-ARNT الهتروثنائي
2025 | المؤلف: Xiaotong Diao وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)مستقبل الهيدروكربون العطري (AHR) هو مستقبل داخلي حيوي يكتشف مجموعة متنوعة من الروابط الجزيئية الصغيرة، بما في ذلك الملوثات البيئية والمركبات الذاتية. عند ارتباط الرابط، ينتقل AHR إلى النواة، حيث يشكل معقدًا نشطًا نسخيًا مع ناقل مستقبل الهيدروكربون العطري النووي (ARNT). يبدأ هذا المعقد برامج التعبير الجيني المتعلقة بإزالة السموم الخلوية والاستجابات المناعية. تبحث الدراسة…
-
تصميم جديد لمحفزات بروتينات الميني بايندر لـ TLR3
2025 | المؤلف: Chloe S. Adams وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم المناعة (Immunology)قسم “الطرق” في ورقة البحث يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. استخدمت الدراسة نهجًا كميًا، مع دمج التحليلات الإحصائية لتقييم البيانات المجمعة من تجارب مختلفة. تضمنت المنهجيات المحددة تجارب مختبرية خاضعة للرقابة، حيث تم التلاعب بالمتغيرات بشكل منهجي لمراقبة آثارها على النتائج ذات الأهمية. شملت جمع البيانات استخدام أدوات وبروتوكولات موحدة…
-
مسح شامل لوظائف التقييم لنماذج ربط البروتين
2025 | المؤلف: Azam Shirali وآخرون | المجلة: BMC Bioinformatics | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يبرز المؤلفون أهمية وظائف التقييم في ربط البروتينات، وهو أمر أساسي لفهم تفاعلات البروتين. يؤكدون على أن فعالية أدوات الربط تعتمد بشكل كبير على القدرة على التمييز بدقة بين المجمعات المرتبطة الأصلية وغير الأصلية. على الرغم من اقتراح العديد من وظائف التقييم المبتكرة، لا تزال طريقة تقييم فعالة عالمياً بعيدة المنال. يقترح…
-
بصمات متعددة المقاييس تكشف عن تنظيم العناصر التنظيمية الجانبية
2025 | المؤلف: Hu Yan وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تتناول هذه الفقرة الأساليب التجريبية وتوضح الإجراءات والتقنيات المستخدمة في الدراسة للتحقيق في أسئلة البحث. تتفصل في تصميم التجارب، بما في ذلك اختيار المواد، وتحضير العينات، والمنهجيات المحددة المستخدمة لجمع البيانات. تؤكد الفقرة على أهمية التحكم في المتغيرات لضمان موثوقية وصحة النتائج. بالإضافة إلى ذلك، تشمل الأساليب التحليلات الإحصائية المطبقة على البيانات لتفسير النتائج بدقة.…
-
تحديد موقع ارتباط لمثبطات الجزيئات الصغيرة المستهدفة للبروتين TRPM4 البشري
2025 | المؤلف: Babatunde Ekundayo وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: الأنظمة الحسية (Sensory Systems)تبحث الدراسة في آليات ارتباط بروتين TRPM4، وهو قناة كاتيون أحادي القيمة تنشط بواسطة الكالسيوم، ويُعتقد أنها مرتبطة بمختلف الاضطرابات الجينية والقلبية الوعائية. تستخدم الدراسة المجهر الإلكتروني بالتبريد (cryo-EM) لتوضيح ثلاث هياكل لبروتين TRPM4 البشري الكامل: غير المرتبط، المرتبط بالمثبط القوي NBA (مشتق من حمض الأنثرانيل)، والمرتبط بمشتق آخر، IBA. تكشف النتائج أن كل من…
-
ديناميات المونوأمينيلاتيشن الهيستونية ثنائية الاتجاه تنظم الإيقاع العصبي
2025 | المؤلف: Qingfei Zheng وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تسلط الأبحاث الضوء على دور تعديلات الهيستون H3 الأحادية الأمين في Gln5 كعلامات وراثية مهمة في الدماغ، تؤثر على التعبير الجيني. على وجه التحديد، تحدد الدراسة إنزيم الترانسجلوتاميناز 2 (TG2) كإنزيم رئيسي يحفز السيروتونيل (H3Q5ser) والدوبامينيل (H3Q5dop) للهيستون H3، مما يعدل حالات الكروماتين. ومن الجدير بالذكر أن المؤلفين يكشفون أن TG2 يعمل أيضًا كحاذف ومبادل…