الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: البروتيوم
-
خرائط البروتيوميات البصرية العميقة لتحديد السمية البروتينية في مرض الكبد الوراثي
2025 | المؤلف: Florian A. Rosenberger وآخرون | المجلة: Nature | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)يتناول قسم ورقة البحث التحديات التي تطرحها أمراض طي البروتين غير الصحيح، وخاصة نقص α1-أنتي تريبسين (AATD)، ويقدم نهجًا جديدًا باستخدام البروتيوميات المكانية مع التعلم الآلي للتحقيق في هذه الحالات في أنسجة الكبد البشرية. من خلال استخدام البروتيوميات البصرية العميقة (DVP) جنبًا إلى جنب مع تحليل الخلايا الفردية، نجح البحث في رسم خرائط الأحداث الجزيئية…
-
يتيح InstaNovo تسلسل الببتيدات الجديد المدعوم بالانتشار في تجارب البروتيوميات على نطاق واسع
2025 | المؤلف: Kevin Eloff وآخرون | المجلة: Nature Machine Intelligence | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم التقدمات في علم البروتيوميات القائم على مطيافية الكتلة، مع التركيز بشكل خاص على تحديد الببتيدات من خلال مطيافية الكتلة المت tandem. تعتمد الطرق التقليدية عادةً على قواعد بيانات البروتين لتحديد الببتيدات، مما يمكن أن يكون محدودًا في سياقات معينة. لمعالجة هذه القيود، يقدم المؤلفون InstaNovo، وهو نموذج تحويل يقوم بترجمة قمم أيونات…
-
رسم الخرائط المكاني الزمني للبروتينات خارج الخلوية عبر TyroID المتوافق مع الحياة
2025 | المؤلف: Zijuan Zhang وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الخلوي (Cell Biology)تعتبر البروتينات خارج الخلوية حاسمة للإشارات داخل الخلوية والتواصل بين الخلايا، مما يؤثر بشكل كبير على الصحة والمرض. لقد أدت التطورات الأخيرة في تقنيات وسم القرب (PL) إلى تحسين رسم خرائط البروتينات خارج الخلوية؛ ومع ذلك، كانت قابليتها للتطبيق في الجسم الحي محدودة. تقدم هذه الدراسة TyroID، وهي طريقة مبتكرة متوافقة مع الجسم الحي للوسم…
-
المناعة الفطرية الذاتية الخلوية بواسطة ببتيدات الدفاع المستمدة من البروتيازوم
2025 | المؤلف: Karin Goldberg وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذه الدراسة، تم استرجاع تسلسلات الببتيدات المضادة للميكروبات (AMP) بشكل منهجي من أربعة قواعد بيانات متاحة للجمهور: CAMP(R4)، DRAMP، DBAASP، وdbAMP. شملت مجموعة البيانات ليس فقط تسلسلات AMP ولكن أيضًا بيانات وصفية ذات صلة مثل معرف البروتين، التسلسل، مصدر الكائن الحي، والنشاط البيولوجي. لضمان سلامة التحليل، طبق الباحثون معيار تصفية يركز حصريًا على الببتيدات…
-
تطهير النظام الغليمفاتي وخطر مرض الزهايمر: دراسة واسعة للبروتينات في السائل الدماغي الشوكي
2025 | المؤلف: Natàlia Cullell وآخرون | المجلة: Alzheimer s Research & Therapy | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)تستكشف الدراسة دور النظام الغليمفاتي (GS) في مرض الزهايمر (AD) وإمكاناته كمصدر لمؤشرات حيوية جديدة. باستخدام نهج بروتيومي ثنائي المراحل، قام الباحثون بتقييم صحة GS لدى الأفراد الذين يعانون من ضعف إدراكي خفيف أميني (aMCI) من خلال تطبيق عامل تباين قائم على الغادولينيوم (GBCA) وتصوير الرنين المغناطيسي التسلسلي T1 3T. في المرحلة الأولى، حددوا سبعة…
-
بروتيوميات اللعاب والميتابروتيوميات تحدد بصمات جزيئية وتصنيفية مميزة لمرض السكري من النوع الثاني
2025 | المؤلف: Diana Samodova وآخرون | المجلة: Microbiome | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة البروتينات اللعابية والبروتينات الميتابروتينية لدى الأفراد الذين تم تشخيصهم حديثًا بمرض السكري من النوع الثاني (T2D) مقارنةً بالأشخاص الأصحاء. باستخدام تقنيات مطيافية الكتلة المتقدمة (MS)، حدد الباحثون أكثر من 4500 بروتين بشري وبكتيري من عينات اللعاب لـ 15 مريضًا بمرض السكري من النوع الثاني و15 شخصًا صحيًا متطابقين في العمر ومؤشر كتلة…
-
توقيعات البروتيوم في البلازما للعزلة الاجتماعية والوحدة المرتبطة بالمراضة والوفيات
2025 | المؤلف: Chun Shen وآخرون | المجلة: Nature Human Behaviour | المجال: الصحة (Health)تبحث هذه الدراسة في الآليات البيولوجية التي تربط العلاقات الاجتماعية بنتائج الصحة، باستخدام بيانات من 42,062 مشاركًا وتحليل 2,920 بروتين بلازما من بنك المملكة المتحدة الحيوي. تحدد الدراسة توقيعات بروتينية مرتبطة بالعزلة الاجتماعية والوحدة من خلال دراسة ارتباط شاملة للبروتينات وتحليل شبكة التعبير المشترك للبروتينات. تشير النتائج الرئيسية إلى أن البروتينات المرتبطة بهذه المفاهيم تشارك…
-
المشهد البروتيني الحاسوبي للميكروبات والمضيف في سرطان الفم يكشف عن مسارات وظيفية واستقلابية رئيسية بين فوسوبكتيريوم نوكليتوم وتقدم السرطان
2025 | المؤلف: Camila Paz Muñoz-Grez وآخرون | المجلة: International Journal of Oral Science | المجال: أمراض اللثة (Periodontics)تستقصي هذه الدراسة دور مسببات الأمراض اللثوية، وتحديداً *Fusobacterium nucleatum* (F. nucleatum)، في تقدم سرطان الخلايا الحرشفية الفموية (OSCC). باستخدام البروتيوميات الحاسوبية، قام الباحثون بتحليل السركتوم لعينات خزعة من مرضى OSCC وأشخاص أصحاء من خلال مطيافية الكتلة. وجدوا زيادة ملحوظة في تنظيم البروتينات المضيفة المتعلقة باستجابة الليببوليسكاريد (LPS)، وهجرة/التصاق الخلايا، واستقلاب الأحماض الأمينية في بروتيوم…
-
التغيرات البروتينية عند العلاج بالسيماغلوتيد لدى الأفراد الذين يعانون من السمنة
2025 | المؤلف: Lasse Maretty وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)يتناول هذا القسم من ورقة البحث تأثير السيماغلوتيد، وهو دواء للسمنة ومرض السكري من النوع 2، على البروتينات الدائرة، استنادًا إلى عينات مصل تم جمعها من تجربتين سريريتين من المرحلة الثالثة: STEP 1 (n = 1,311) و STEP 2 (n = 645). وجدت الدراسة أن السيماغلوتيد يؤثر على مجموعة واسعة من العمليات البيولوجية، بما في…
-
تحليل سريع وعميق للبروتينات الفوسفاتية باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral
2024 | المؤلف: Noah M. Lancaster وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: التحليل الطيفي (Spectroscopy)تناقش هذه القسم أهمية فسفرة البروتينات في العمليات الخلوية والتحديات المرتبطة بالكشف عنها وقياسها. يقدم المؤلفون نهجًا جديدًا باستخدام مطياف الكتلة Orbitrap Astral، مع دمج اكتساب البيانات المستقل (DIA)، مما يسمح بتحليل سريع وشامل للفسفورومات في نماذج الإنسان والفأر. لقد نجحوا في رسم خريطة لحوالي 30,000 موقع فسفرة بروتيني فريد في غضون 30 دقيقة وكشفوا…