الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: الجينوم، الفيروسي
-
انتقال الأنفلونزا الطيرية عالية الضراوة A/H5N1 من النوع 2.3.4.4b بين الأنواع ومن الثدييات إلى الثدييات مع تعديلات PB2
2025 | المؤلف: Catalina Pardo‐Roa وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)ظهور فيروسات إنفلونزا الطيور شديدة الضراوة H5N1 (HPAIV) من السلالة 2.3.4.4b في تشيلي في ديسمبر 2022 أدى إلى معدل وفيات كبير بين الطيور البرية والدواجن والثدييات البحرية، بالإضافة إلى حالة إنسانية مؤكدة واحدة. بين ديسمبر 2022 وأبريل 2023، تم الكشف عن HPAIV في 7.33% (714 من أصل 9745) من الحالات المأخوذة، مع تسلسل 177 جينوم…
-
أنماط انتشار SARS-CoV-2 على نطاق دقيق من تسلسلات مسببات الأمراض المتطابقة
2025 | المؤلف: Cécile Tran Kiem وآخرون | المجلة: Nature | المجال: النمذجة والمحاكاة (Modeling and Simulation)تناقش هذه القسم استخدام علم الجينوم للجراثيم لتوضيح أنماط انتقال الأمراض المعدية، مع التركيز بشكل خاص على SARS-CoV-2. تحلل الدراسة مجموعة بيانات تتكون من 114,298 جينوم SARS-CoV-2 تم جمعها في ولاية واشنطن بين مارس 2021 وديسمبر 2022، حيث تم تحديد 59,660 تسلسلًا متطابقًا مع غيرها في مجموعة البيانات. تشير النتائج إلى أن التوزيع الجغرافي لهذه…
-
VITAP: أداة عالية الدقة لتصنيف الفيروسات DNA وRNA بناءً على بيانات ميتا-أوميكية
2025 | المؤلف: Kaiyang Zheng وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم البيئة (Ecology)تقدم هذه القسم خط أنابيب تصنيف الفيروسات (VITAP)، وهو أداة جديدة مصممة لتعزيز تصنيف تسلسلات الفيروسات من الحمض النووي والحمض النووي الريبي. يدمج VITAP طرق قائمة على المحاذاة مع نظرية الرسوم البيانية لتحقيق دقة عالية في التصنيف الضريبي، مقدماً مستويات ثقة لكل وحدة تصنيفية. يقوم بتحديث قاعدة بياناته تلقائياً بما يتماشى مع اللجنة الدولية لتصنيف…
-
الميزات الجينومية الفيروسية تتنبأ بمضيفي خزان فيروس الأورثوبوكس
2025 | المؤلف: Katie K Tseng وآخرون | المجلة: Communications Biology | المجال: علم الفيروسات (Virology)في هذه الدراسة، طور المؤلفون إطار عمل نمذجة متعدد الزوايا للتنبؤ بارتباطات المضيف-الفيروس، باستخدام الفيروسات Orthopoxviruses (OPVs) كدراسة حالة. أنشأوا نموذجين متميزين قائمين على الصفات لتقييم أدائهم: ركز النموذج الأول على التنبؤ بقدرة المضيف بناءً على الصفات البيئية، مستخدمين مستويين من الأدلة – تعرض المضيف المحدد بواسطة بيانات إيجابية PCR وقابلية المضيف المستنتجة من بيانات…
-
التطور الوبائي والجيني لتفشي فيروس mpox من الصنف Ib في جمهورية الكونغو الديمقراطية الشرقية
2025 | المؤلف: Leandre Murhula Masirika وآخرون | المجلة: Nature Medicine | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)تناقش ورقة البحث التطور الوبائي والجيني لتفشي فيروس mpox من الصنف Ib المستمر في شرق جمهورية الكونغو الديمقراطية (DRC)، والذي بدأ في سبتمبر 2023 واستمر حتى يونيو 2024. تم الإبلاغ عن إجمالي 670 حالة في مستشفى كاميتيغا العام، مع توزيع ديموغرافي بنسبة 52.4% إناث و 47.6% ذكور. ومن الجدير بالذكر أن 83.4% من الحالات كانت…
-
الجينوتيب B من فيروس الأجنحة المشوهة والفيروسات المعاد تركيبها ذات الصلة تصبح سائدة في مستعمرات نحل العسل الأوروبي
2025 | المؤلف: Fabrice Sircoulomb وآخرون | المجلة: Scientific Reports | المجال: علم الحشرات (Insect Science)دور عثة فاروا ديسكتور في نقل فيروس الأجنحة المشوهة (DWV) إلى نحل العسل هو عامل مهم في وفيات مستعمرات النحل خلال الشتاء على مستوى العالم. هذه الدراسة تحقق في توزيع أنماط DWV الجينية A و B عبر 15 دولة أوروبية من 2010 إلى 2017، كاشفة عن انتشار ملحوظ لـ DWV-B ومركباته (A/B). استخدمت الأبحاث تقنية…
-
البيانات الوبائية لتفشي إنفلونزا A/H5N1 في فقمة الفيل في الأرجنتين تشير إلى انتقال العدوى من الثدييات إلى الثدييات
2024 | المؤلف: Marcela Uhart وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأوبئة (Epidemiology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على تفشي فيروس إنفلونزا الطيور عالي الضراوة H5N1، الذي أثر بشكل كبير على الثدييات البحرية في أمريكا الجنوبية منذ عام 2022. على وجه التحديد، يتناول البيانات الوبائية والتوصيف الجيني لسلالة 2.3.4.4b من فيروس H5N1 المرتبط بتفشي كبير بين فقمة الفيل الجنوبية (Mirounga leonina) في شبه جزيرة فالديز، الأرجنتين، في أكتوبر…
-
التنبؤ بتفاعلات العاثيات على مستوى السلالة عبر جنس الإشريكية باستخدام المعلومات الجينومية فقط
2024 | المؤلف: Baptiste Gaborieau وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم البيئة (Ecology)تبحث هذه الدراسة في إمكانية التنبؤ بإصابات البكتريوفاج في سلالات بكتيرية محددة، مع التركيز على جنس *Escherichia*. توضح الدراسة أن نتائج تفاعلات الفاج والبكتيريا يمكن التنبؤ بها بدقة على مستوى السلالة باستخدام البيانات الجينومية، محققة منطقة تحت منحنى خصائص التشغيل المستقبلية (AUROC) بنسبة 86%. تم إنشاء مجموعة بيانات شاملة، تضم تفاعلات بين 403 سلالة متنوعة…
-
الكشف الجزيئي بواسطة تضخيم الدائرة الدوارة مقترنًا بالتسلسل العميق للعدوى المختلطة بواسطة فيروس الورم الحليمي البقري 2 و4 في سرطان الغشاء المخاطي للمريء البقري
2024 | المؤلف: Bruna Fonseca Matias وآخرون | المجلة: Viruses | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)في هذه الدراسة، قام المؤلفون بالتحقيق في وجود أنواع فيروس الورم الحليمي البقري (BPV) المرتبطة بالآفات التكاثرية في القناة الهضمية العليا لثور، باستخدام تقنية تضخيم الدائرة المتدحرجة (RCA) تليها التسلسل عالي الإنتاجية (HTS). ركز البحث على آفتين مريئيتين مفرطتين، مستخدمين تفاعل البوليميراز المتسلسل مع أزواج من البرايمرات المتغيرة وRCA لتحليل السلالات الفيروسية. كشفت النتائج عن…
-
التعايش المتزامن لسلالات فيروس جدري القرود Ia وIb في مقاطعة كينشاسا، جمهورية الكونغو الديمقراطية، من يوليو إلى أغسطس 2024
2024 | المؤلف: Tony Wawina-Bokalanga وآخرون | المجلة: Eurosurveillance | المجال: علم الفيروسات (Virology)تسلط هذه التقرير الضوء على التزامن المشترك لفرعين متميزين من فيروس جدري القرود (MPXV)، وهما Ia وIb، في كينشاسا، جمهورية الكونغو الديمقراطية (DRC)، خلال يوليو وأغسطس 2024. تؤكد النتائج على تعقيد تفشي جدري القرود في المنطقة، مما يشير إلى أن عدة متغيرات جينية تتداول بنشاط. من المتوقع أن توفر الدراسات الجينومية الجارية رؤى أعمق حول…