• مقارنة منهجية لطرق النسخ الجيني المكاني المعتمدة على التسلسل

    2024 | المؤلف: Yue You وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    في هذا القسم، يقوم المؤلفون بتقييم منهجيات النسخ الجيني المكاني (sST) بشكل منهجي، مع التركيز على استراتيجيات الفهرسة المكانية المختلفة، بما في ذلك الميكروأري، والتقنيات المعتمدة على الكريات، وتقنيات بولوني/نانوبول، والميكروفلويديك. تستخدم الدراسة أنسجة مرجعية محددة جيدًا: دماغ الفأر البالغ، جنين الفأر E12.5، وبصلة الشم في الفأر البالغ، والتي تظهر خصائص مورفولوجية مميزة وملفات تعبير…


  • فك رموز المجالات المكانية من الميكروبيوم المكاني متعدد الأبعاد باستخدام SpatialGlue

    2024 | المؤلف: Yahui Long وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    في هذا القسم، قام المؤلفون بتقييم SpatialGlue مقابل عدة طرق منافسة باستخدام بيانات متعددة الأومكس المكانية التي تم الحصول عليها تجريبيًا والمحاكاة مع تسميات الحقيقة المعروفة. استخدمت التقييمات مقاييس إشرافية مثل التجانس، المعلومات المتبادلة، المعلومات المتبادلة المعدلة (AMI)، المعلومات المتبادلة العادية (NMI)، ومؤشر راند المعدل (ARI). تضمنت مجموعات البيانات المحاكاة وضعيتين قدمتا رؤى فريدة ومتكاملة…


  • تقدم في النسخ الجيني المكاني وتطبيقاته في أبحاث السرطان

    2024 | المؤلف: Zhenyun Du وآخرون | المجلة: Molecular Cancer | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

    تقدم هذه القسم نظرة عامة على أهمية الأورام الخبيثة، مع تسليط الضوء على المراضة والوفيات المرتبطة بها، ويؤكد على تعقيد حدوثها وتطورها. لقد عزز ظهور تقنيات التسلسل، وخاصة النسخ الجزيئي المكاني، فهمنا للآليات الجينية والجزيئية التي تكمن وراء الأورام. يسمح النسخ الجزيئي المكاني بتحديد كمية التعبير الجيني ضمن السياق المكاني للأنسجة، مما يوفر رؤى حول…