الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل القاعدة

الكشف عالي الحساسية عن تسلسلات dsDNA المستقلة عن البروتين High-sensitivity, protein-independent detection of dsDNA sequences

2026 | المؤلف: Jiaqi Yan وآخرون | المجلة: Proceedings of the National Academy of Sciences | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

الكشف الدقيق عن تسلسلات الجينات المستهدفة أمر حاسم للتشخيصات الجينية والبحث، خاصة عند التعامل مع التسلسلات مزدوجة الشريط، التي تقدم تحديات كبيرة بسبب هيكلها الثنائي المستقر. تتضمن الطرق التقليدية عادةً تفاعلات إنزيمية معقدة لفصل وتضخيم هذه الأشرطة المزدوجة، مما يؤدي غالبًا إلى أخطاء ويعقد سير العمل. تقترح هذه الدراسة نهجًا جديدًا خاليًا من الإنزيمات ومستقلًا…
الانخفاض السريع والعميق للحمض النووي لفيروس نقص المناعة البشرية القابل للتحفيز والسليم في الأطفال التايلنديين الذين تم علاجهم مبكرًا

2026 | المؤلف: Marta Massanella وآخرون | المجلة: Journal of Clinical Investigation | المجال: علم الفيروسات (Virology)

تناقش ورقة البحث استمرار فيروس نقص المناعة البشرية في خزانات فيروسية على الرغم من العلاج المضاد للفيروسات القهري (ART) المطول لدى البالغين والأطفال. وتبرز أن بدء العلاج مبكرًا يقلل بشكل كبير من حجم هذه الخزانات، خاصةً في الأطفال المولودين بفيروس نقص المناعة البشرية، كما يتضح من دراسات متعددة تظهر انخفاض تكرار الخلايا المصابة بشكل مستمر…
رسم خرائط تسلسل mRNA المباشر عبر الإنترنت باستخدام هضمات RNase T1 الجزئية

2026 | المؤلف: Jessica S. Dale وآخرون | المجلة: Analytical Chemistry | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

تتناول هذه الفقرة تطوير وتطبيق طريقة تعتمد على مطيافية الكتلة لرسم تسلسل مباشر لـ mRNA، باستخدام هضمات RNase T1 الجزئية عبر الإنترنت مع مطيافية الكتلة السائلة ثنائية الأبعاد (2D LC-MS). تتيح هذه الطريقة تحليل الخصائص النوعية الحرجة لأدوية mRNA، مثل هوية التسلسل، وكفاءة التغطية 5′، وخصائص ذيل poly(A) 3′، والتي تعتبر ضرورية لضمان جودة وسلامة…
التفاعل بين IRES والشحنة يؤثر هيكليًا على ترجمة RNA الدائري

2026 | المؤلف: Youkui Huang وآخرون | المجلة: Cell Research | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذه الدراسة، يحقق المؤلفون في تأثير تسلسلات الحمولة على السلامة الهيكلية وكفاءة الترجمة لـ RNAs الدائرية المهندسة في المختبر (ivcRNAs) باستخدام موقع دخول الريبوسوم الداخلي لفيروس ساليفيروس A (IRES). يظهرون أن التفاعلات المحددة بين IRES SV-A وبعض تسلسلات الحمولة يمكن أن تضر بالسلامة الهيكلية لـ IRES، مما يؤدي إلى تقليل كفاءة الترجمة. من خلال…
تنظيم تعبير جين PHOX2B بواسطة RNA الطبيعي غير المشفر الطويل PHOX2B-AS1

2026 | المؤلف: Simona Di Lascio وآخرون | المجلة: FEBS Journal | المجال: الأنظمة الصماء والذاتية (Endocrine and Autonomic Systems)

تناقش هذه الفقرة دور بروتين الهوميوبوكسي 2B (PHOX2B) كعامل نسخ حاسم لتطوير الجهاز العصبي الذاتي. ترتبط الطفرات غير المتجانسة في جين PHOX2B بمختلف الاضطرابات العصبية التنموية، بما في ذلك متلازمة نقص التهوية المركزية الخلقية ومرض هيرشسبرونغ، كما أنها مرتبطة أيضًا بالأورام العصبية، حيث تحدث الطفرات في كل من الحالات العائلية والعشوائية. على الرغم من أهميته،…
بناء تسلسلات DNA معقدة ومتنوعة باستخدام تقاطعات ثلاثية لـ DNA

2026 | المؤلف: Noah Evan Robinson وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

قسم “الطرق” في ورقة البحث يحدد تصميم التجربة والتقنيات التحليلية المستخدمة للتحقيق في سؤال البحث. يوضح معايير اختيار المشاركين، والمواد المستخدمة، والإجراءات المتبعة خلال جمع البيانات. يتم وصف طرق إحصائية محددة، بما في ذلك أي برامج تم استخدامها للتحليل، مما يضمن إمكانية تكرار النتائج. بالإضافة إلى ذلك، قد يتضمن القسم معلومات عن النماذج الرياضية المطبقة…
BFVD – مستودع كبير لهياكل البروتينات الفيروسية المتوقعة

2024 | المؤلف: Rachel Seongeun Kim وآخرون | المجلة: Nucleic Acids Research | المجال: علم البيئة (Ecology)

قاعدة بيانات هيكل البروتين AlphaFold (AFDB) هي مستودع شامل لهياكل البروتين المتوقعة، لكنها تفتقر إلى تغطية التسلسلات الفيروسية، مما يحد من البحث في علم الفيروسات. لسد هذه الفجوة، طور الباحثون قاعدة بيانات الفيروسات الكبيرة الرائعة (BFVD)، التي تحتوي على 351,242 هيكل بروتين تم التنبؤ به باستخدام ColabFold على ممثلي التسلسلات الفيروسية من مجموعات UniRef30. من…
توجيه RNAs الجسرية لإعادة التركيب القابلة للبرمجة للحمض النووي المستهدف والمانح

2024 | المؤلف: Matthew G. Durrant وآخرون | المجلة: Nature | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

في هذا القسم، تستكشف الدراسة دور إنزيم IS621 المعيد التركيب وRNA غير المشفر المرتبط به (ncRNA) في تسهيل إعادة تركيب الحمض النووي داخل الكائنات الحية بدائية النواة. تشمل عناصر IS110، التي تتضمن IS621، إنزيمات معيد التركيب تتميز بنطاق شبيه بـ RuvC من نوع DEDD ونطاق C-terminal غني بالسيرين محفوظ. هذه الإنزيمات قادرة على استئصال نفسها…