الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل النوكليوتيدات عالي الإنتاجية

استنتاج نقل مستوى الإجهاد عبر بيانات الميتاجينوم متعددة الممالك باستخدام TRACS Strain-level transmission inference across multi-kingdom metagenomic data using TRACS

2026 | المؤلف: Gerry Tonkin-Hill وآخرون | المجلة: Nature Microbiology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يقدم هذا القسم تجميع نقل السلالات (TRACS)، وهو خوارزمية مبتكرة مصممة لتقدير المسافات الجينية بدقة بين السلالات المتواجدة معًا من نفس النوع في بيانات الميتاجينوم. تعالج هذه الطريقة التعقيدات التي تطرأ بسبب التنوع داخل الأنواع، لا سيما في سياق الميكروبات المسببة للأمراض والميكروبات المتعايشة. من خلال تحليل مجموعات بيانات زراعة الميكروبات البرازية والمحاكاة الواسعة، يظهر…
16S-Pipeline: منصة شاملة قائمة على الويب لتحليل تسلسل 16S rRNA من البداية إلى النهاية

2026 | المؤلف: Tatsuya Unno | المجلة: The Journal of Microbiology | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)

لقد مكنت التقدمات الحديثة في تسلسل الجينات باستخدام علامات عالية الإنتاجية من تحليل بيانات التسلسل دون الاعتماد التقليدي على وحدات التصنيف العملياتي الجزيئية (OTUs)، التي تجمع قراءات التسلسل بناءً على عتبة تباين ثابتة. بدلاً من ذلك، تسمح المنهجيات الجديدة بالتمييز الدقيق لمتغيرات تسلسل الأمبليكون (ASVs)، مما يميز الاختلافات حتى على مستوى التغيرات في النيوكليوتيدات الفردية…
التسلسل المستهدف للقراءات الطويلة لتوصيف التكرارات عالية الدقة في ضمور العضلات النمطي من النوع 1

2026 | المؤلف: Yoojung Han وآخرون | المجلة: Experimental & Molecular Medicine | المجال: علم الأعصاب الخلوي والجزيئي (Cellular and Molecular Neuroscience)

تقدم القسم المعنون “نظرة عامة” شاملة للورقة البحثية، موضحًا الأهداف الرئيسية وأهمية الدراسة. ويؤكد على أهمية سؤال البحث في سياق الأدبيات الموجودة ويسلط الضوء على المنهجيات المستخدمة لمعالجة المشكلة. ويبرز المؤلف أهمية النتائج، مشيرًا إلى أنها تسهم في فهم أعمق لموضوع البحث وقد يكون لها آثار على الأبحاث المستقبلية والتطبيقات العملية. بالإضافة إلى ذلك، قد…
تسلسل طويل للعائلات يكشف عن زيادة معدلات الطفرات في الخط الجرثومي وما بعد الإخصاب في الحمض النووي المتكرر

2026 | المؤلف: Michelle D. Noyes وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الوراثة (Genetics)

في هذه الدراسة، استخدم المؤلفون تقنيات تسلسل القراءة الطويلة، بما في ذلك إيلومينا، أكسفورد نانو بور، وباك بايو، لتعزيز اكتشاف الطفرات الجديدة في مجموعة من 73 طفلًا من 42 عائلة مصابة بالتوحد، بإجمالي 157 فردًا. غطت التحليلات 2.77 جيجاباز من الجينوم البشري، كاشفة عن متوسط 95 طفرة جديدة لكل انتقال، تتكون من 87.5 استبدال نوكليوتيد…
تجميع عالي الجودة للميتا جينوم من قراءات النانو بورا باستخدام nanoMDBG

2026 | المؤلف: Gaëtan Benoit وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)

يتناول هذا القسم التقدم في تجميع الميتاجينوم الذي يسهل استخدام تقنيات التسلسل الطويلة من الجيل الثالث، مع تسليط الضوء بشكل خاص على قدرات PacBio HiFi وتقنيات أكسفورد نانوبور (ONT). تُعرف قراءات PacBio HiFi بدقتها العالية، مما يمكن من إنتاج مئات من الجينومات المجمعة من الميتاجينوم شبه الكاملة (MAGs) من عينة واحدة. في الوقت نفسه، أدت…
تحليل الميكروبيوم البكتيري لعينات المهبل وعنق الرحم والبطانة الرحمية لدى المرضى الذين يعانون من الأديوميوزيس خلال فترة الزرع

2026 | المؤلف: Nika Troha وآخرون | المجلة: Microbiology Spectrum | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)

تعتبر الانتباذ البطاني الرحمي حالة نسائية مزمنة شائعة تتميز بأعراض مثل النزيف الرحمي غير الطبيعي، والألم الحوضي المزمن (CPP)، وعسر الطمث، والعقم، والتي غالبًا ما تظهر استجابة ضعيفة للعلاج. قامت هذه الدراسة بتحليل التراكيب الميكروبية للمسالك التناسلية للنساء المصابات بالانتباذ البطاني الرحمي (عدد = 33) مقارنةً بالضوابط الصحية (عدد = 31) باستخدام تقنيات أخذ العينات…
تعزيز سلاسل الإمداد لمراقبة الجينوم الممرض في آسيا

2026 | المؤلف: Anne‐Claire Stona وآخرون | المجلة: BMJ Global Health | المجال: علم المحاصيل والزراعة (Agronomy and Crop Science)

تستكشف ورقة البحث حالة أنظمة الشراء وإدارة سلسلة التوريد (PSM) لعلم الجينوم الخاص بالعوامل الممرضة في جنوب وجنوب شرق آسيا، لا سيما في سياق تقنية التسلسل من الجيل التالي (NGS) التي أوصت بها منظمة الصحة العالمية لمراقبة الأمراض. شمل استبيان مقطعي تم إجراؤه من 2022 إلى 2023 42 شريكًا عبر 13 دولة، بالإضافة إلى مقابلات…
الكشف الجزيئي عن الميكوبلازما الهيموتروبية (الهيموبلازما) في البشر والكلاب التي تعيش في الجزر والساحل الرئيسي للبرازيل: نهج صحة واحدة

2026 | المؤلف: Louise Bach Kmetiuk وآخرون | المجلة: Parasites & Vectors | المجال: علم الطفيليات (Parasitology)

تدرس الدراسة عدوى Mycoplasma spp. في البشر والكلاب من المجتمعات التقليدية في الجزر المحيطية والمناطق الساحلية في جنوب البرازيل، مما يعالج فجوة بحثية هامة. باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR) وتسلسل الجيل التالي المستهدف (tNGS)، حدد الباحثون معدل عدوى بنسبة 6.2% في البشر، مع تأكيد وجود Mycoplasma haemocanis في 1.0% من الحالات. في الكلاب، كان…
تسلسل الجيل التالي الميتاجينومي يعزز تشخيص العدوى الفطرية في متلقي زراعة الكلى: دراسة استعادية

2026 | المؤلف: Q. Edward Wang وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الأمراض المعدية (Infectious Diseases)

تبحث هذه الورقة البحثية في فائدة تسلسل الجينوم الميتاجيني من الجيل التالي (mNGS) في تشخيص العدوى الفطرية بين مرضى زراعة الكلى، وهي مجموعة معرضة لمثل هذه العدوى بسبب انخفاض معدلات الكشف وارتفاع معدل الوفيات. شملت الدراسة 234 مريضًا من مرضى زراعة الكلى من سبتمبر 2021 إلى أغسطس 2023، مع التركيز على 66 مريضًا يُشتبه في…
توسيع المشهد الجيني للأمراض الأيضية الوراثية باستخدام تسلسل القراءة الطويلة وتحليل النسخ

2026 | المؤلف: Alejandro Soriano-Sexto وآخرون | المجلة: European Journal of Human Genetics | المجال: علم الوراثة (Genetics)

تستكشف هذه الدراسة تطبيق تسلسل القراءة الطويلة (LRS) لتشخيص الأمراض الأيضية الوراثية النادرة (IMD) التي لا تزال غير محسومة على الرغم من التقدم في تسلسل الجيل التالي. من خلال استهداف جينات معينة (FARS2، GYS2، PEX1، SLC2A1، AGL، ACAT1، وACADM) في سبعة مرضى، حدد الباحثون ستة متغيرات مسببة جديدة، بما في ذلك متغيرين داخل الجين، ومتغير…