الأبحاث المرتبطة بالكلمة المفتاحية: تسلسل النوكليوتيدات عالي الإنتاجية
-
أداة تكلفة الجينوم: اعتبارات لتحسين كفاءة التكاليف من خلال مقارنة السيناريوهات المتعددة
2025 | المؤلف: Marco Marklewitz وآخرون | المجلة: Frontiers in Public Health | المجال: الاقتصاد والاقتصاد القياسي (Economics and Econometrics)يتناول القسم تطوير وتقييم أداة تكلفة الجينوم (GCT)، التي أنشأتها تعاون بين خمس مؤسسات، بما في ذلك منظمة الصحة العالمية ووكالة الأمن الصحي في المملكة المتحدة، لتسهيل المراقبة الجينومية المستدامة في البلدان ذات الدخل المنخفض والمتوسط. تم اختبار GCT في مختبرات الصحة العامة عبر ثلاث مناطق تابعة لمنظمة الصحة العالمية لتقييم دقتها وفائدتها في تقدير…
-
زراعة الميكروبات المستهدفة الموجهة بواسطة الميتاجينوم
2025 | المؤلف: Jeremy Armetta وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)تقدم هذه القسم نظرة عامة على أنواع مختلفة مصنفة تحت ترتيب Clostridiales، وبشكل خاص تلك التي تم تحديدها على أنها “أنواع غير مؤكدة”، مما يشير إلى عدم اليقين في تصنيفها الضريبي. تسرد عدة إدخالات مع بيانات وصفية مرتبطة، بما في ذلك الإشارات إلى سلالات أو أنواع محددة، مثل “mO TU v25 125 16” و “mO…
-
تحليل الحمض النووي الخالي من الخلايا متعدد الوسائط للكشف عن إشارات سرطان محددة
2025 | المؤلف: Dimitris Vavoulis وآخرون | المجلة: Nature Communications | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)في هذا القسم، يوضح المؤلفون الطرق المستخدمة للتحقق من صحة خط أنابيبهم لتمييز عينات البلازما السرطانية وغير السرطانية. قاموا بتوليد بيانات في السليكو من خلال محاكاة عينات البلازما مع نسب متغيرة من الحمض النووي الورمي المتداول (ctDNA)، باستخدام عينات بلازما فعلية كقوالب. بالنسبة لعينات غير السرطان، تم نمذجة إشارة التغطية الإجمالية للذراع الكروموسومي \( k…
-
التجميع من جديد لجينوم الميتوكوندريا لنبات الجذور العرقية وتحديد نوعين من تكوينات إعادة التركيب المتماثلة الناتجة عن تسلسلات متكررة
2025 | المؤلف: Guang Yu Zhou وآخرون | المجلة: BMC Genomics | المجال: علم العقاقير (Pharmacology)في هذه الدراسة، تم تجميع وتوضيح الجينومات الميتوكوندرية والكلوروبلاستية لنبات *Glycyrrhiza glabra*، وهو نبات طبي بارز، بنجاح باستخدام تقنيات تسلسل القراءة القصيرة (Illumina) والطويلة (Oxford Nanopore). وُجد أن الجينوم الميتوكوندري له هيكل دائري يمتد على 421,293 قاعدة مع محتوى GC يبلغ 45.1%، ويحتوي على 56 جينًا موضحًا. كانت إحدى النتائج المهمة هي تحديد 514 تسلسلًا…
-
التهاب رئة الكلاميديا البيطرية – الجوانب التطورية على الأشعة المقطعية للصدر
2025 | المؤلف: Na Yang وآخرون | المجلة: BMC Infectious Diseases | المجال: علم الأحياء الدقيقة (Microbiology)تهدف الدراسة إلى تعزيز دقة تشخيص التهاب الرئة الناتج عن المتدثرة الرئوية (C. psittaci) من خلال تحليل نتائج التصوير المقطعي المحوسب (CT) عبر مراحل المرض المختلفة. تم فحص 80 حالة تم تشخيصها عبر تسلسل الجيل التالي من يناير 2019 إلى ديسمبر 2023. تشمل المظاهر الرئيسية في التصوير المقطعي التهاب الرئة الفصي والأنواع الكروية من الالتهاب…
-
Pythium insidiosum: مسبّب مرض ناشئ يتم تشخيصه بسهولة بشكل خاطئ ويُعطى علاجًا كفطر
2024 | المؤلف: Liuyang Hu وآخرون | المجلة: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology | المجال: الحيوانات الصغيرة (Small Animals)تتناول الورقة البحثية الزيادة في حالات الإصابة بالبيثيوم، وهو مرض معدٍ تسببه *Pythium insidiosum*، خاصة في المناطق الاستوائية وشبه الاستوائية. غالبًا ما يتم تشخيص المرض بشكل خاطئ على أنه عدوى فطرية بسبب الوعي المحدود بين المهنيين الطبيين. يقدم المؤلفون حالتين: واحدة من التهاب القرنية الناتج عن البيثيوم في مريض بدون حالات صحية أساسية وأخرى من…
-
مقارنة منهجية لطرق النسخ الجيني المكاني المعتمدة على التسلسل
2024 | المؤلف: Yue You وآخرون | المجلة: Nature Methods | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)في هذا القسم، يقوم المؤلفون بتقييم منهجيات النسخ الجيني المكاني (sST) بشكل منهجي، مع التركيز على استراتيجيات الفهرسة المكانية المختلفة، بما في ذلك الميكروأري، والتقنيات المعتمدة على الكريات، وتقنيات بولوني/نانوبول، والميكروفلويديك. تستخدم الدراسة أنسجة مرجعية محددة جيدًا: دماغ الفأر البالغ، جنين الفأر E12.5، وبصلة الشم في الفأر البالغ، والتي تظهر خصائص مورفولوجية مميزة وملفات تعبير…
-
توصيات لاستخدام تسلسل الجينوم من الجيل التالي (NGS) للمرضى المصابين بالسرطان المتقدم في عام 2024: تقرير من مجموعة العمل للطب الدقيق التابعة للجمعية الأوروبية لطب الأورام (ESMO)
2024 | المؤلف: M.F. Mosele وآخرون | المجلة: Annals of Oncology | المجال: أبحاث السرطان (Cancer Research)قامت الجمعية الأوروبية لعلم الأورام الطبية (ESMO) بتحديث توصياتها لاستخدام تسلسل الجيل التالي للأورام (NGS) في المرضى الذين يعانون من سرطانات متقدمة، مما يعكس التقدم في الطب الدقيق. قامت المجموعة بتقييم الأثر السريري لتسلسل الجيل التالي للأورام على قرارات العلاج باستخدام مقياس ESMO للعمل السريري للأهداف الجزيئية (ESCAT)، مع مراعاة عوامل مثل التكلفة والفعالية والوصول.…
-
تحديد الأنواع الرئيسية في قنوات الجذور وآفات ما حول الذروة في التهابات الأسنان بعد العلاج: أبحاث الميكروبيوم من الجيل التالي
2024 | المؤلف: María Teresa Arias‐Moliz وآخرون | المجلة: International Endodontic Journal | المجال: جراحة الفم (Oral Surgery)تهدف هذه الدراسة إلى تحليل ومقارنة الميكروبيوم الموجود في قنوات الجذر وآفات المحيط الجذري للأسنان المتأثرة بالعدوى بعد العلاج، مع تحديد الأنواع الأساسية باستخدام تسلسل الجيل التالي. تم استخراج عينات من مرضى يعانون من التهاب اللثة القمي بعد العلاج جراحيًا، وتم تكسيرها بالتبريد، وخضعت لاستخراج الحمض النووي البكتيري وتسلسل المناطق المتغيرة V3-V4 من جين 16S…
-
تجميع الميتاجينوم عالي الجودة من قراءات طويلة دقيقة باستخدام metaMDBG
2024 | المؤلف: Gaëtan Benoit وآخرون | المجلة: Nature Biotechnology | المجال: علم الأحياء الجزيئي (Molecular Biology)قسم “الطرق” يوضح التصميم التجريبي والتقنيات التحليلية المستخدمة في الدراسة. يتفصل في معايير اختيار المشاركين، التدخلات المحددة التي تم إدارتها، ومدة الدراسة. تشمل المنهجية مقاييس كمية، مثل الاختبارات الإحصائية المستخدمة لتحليل البيانات، مما يضمن قوة النتائج. بالإضافة إلى ذلك، يصف القسم الأدوات والآلات المستخدمة لجمع البيانات، بما في ذلك أي استبيانات أو تقييمات. يؤكد المؤلفون…